RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611278.4

ZNF248-208, Transcript of zinc finger protein 248, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF248, Length 4,204 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248-208ENST00000611278 SCLT1Q96NL6 688 aa9.91□□□□□ -0.82
ZNF248-208ENST00000611278 CPT1AP50416 773 aa9.91□□□□□ -0.82
ZNF248-208ENST00000611278 BCRP11274 1271 aa9.9□□□□□ -0.82
ZNF248-208ENST00000611278 TOP1P11387 765 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
ZNF248-208ENST00000611278 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
ZNF248-208ENST00000611278 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa9.9□□□□□ -0.82
ZNF248-208ENST00000611278 SLC28A3Q9HAS3 691 aa9.9□□□□□ -0.82
ZNF248-208ENST00000611278 NYAP2Q9P242 653 aa9.9□□□□□ -0.82
ZNF248-208ENST00000611278 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa9.9□□□□□ -0.82
ZNF248-208ENST00000611278 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
ZNF248-208ENST00000611278 SEPT4O43236 478 aa9.9□□□□□ -0.82
ZNF248-208ENST00000611278 XBP1P17861 261 aa9.9□□□□□ -0.82
ZNF248-208ENST00000611278 VCAM1P19320 739 aa9.9□□□□□ -0.82
ZNF248-208ENST00000611278 PDE4CQ08493 712 aa9.9□□□□□ -0.82
ZNF248-208ENST00000611278 TTLL4Q14679 1199 aa9.9□□□□□ -0.82
ZNF248-208ENST00000611278 PPP2R5BQ15173 497 aa9.9□□□□□ -0.82
ZNF248-208ENST00000611278 SLC44A5Q8NCS7 719 aa9.9□□□□□ -0.82
ZNF248-208ENST00000611278 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa9.9□□□□□ -0.82
ZNF248-208ENST00000611278 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP9.9□□□□□ -0.82
ZNF248-208ENST00000611278 MSNP26038 577 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
ZNF248-208ENST00000611278 ADORA2AP29274 412 aa9.9□□□□□ -0.82
ZNF248-208ENST00000611278 KCNV1Q6PIU1 500 aa9.9□□□□□ -0.82
ZNF248-208ENST00000611278 GLT8D2Q9H1C3 349 aa9.9□□□□□ -0.82
ZNF248-208ENST00000611278 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa9.9□□□□□ -0.82
ZNF248-208ENST00000611278 MOXD2PA6NHM9 499 aa9.9□□□□□ -0.83
ZNF248-208ENST00000611278 PARNO95453 639 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.83
ZNF248-208ENST00000611278 MYL3P08590 195 aa9.9□□□□□ -0.83
ZNF248-208ENST00000611278 DSG3P32926 999 aa9.9□□□□□ -0.83
ZNF248-208ENST00000611278 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.83
ZNF248-208ENST00000611278 TFAP4Q01664 338 aa9.9□□□□□ -0.83
ZNF248-208ENST00000611278 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa9.9□□□□□ -0.83
ZNF248-208ENST00000611278 NLRX1Q86UT6 975 aa9.9□□□□□ -0.83
ZNF248-208ENST00000611278 TMTC2Q8N394 836 aa9.9□□□□□ -0.83
ZNF248-208ENST00000611278 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.83
ZNF248-208ENST00000611278 DCAF4Q8WV16 495 aa9.9□□□□□ -0.83
ZNF248-208ENST00000611278 HELLSQ9NRZ9 838 aa9.9□□□□□ -0.83
ZNF248-208ENST00000611278 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa9.9□□□□□ -0.83
ZNF248-208ENST00000611278 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa9.89□□□□□ -0.83
ZNF248-208ENST00000611278 DNM1LO00429 736 aa9.89□□□□□ -0.83
ZNF248-208ENST00000611278 EFCAB14O75071 495 aa9.89□□□□□ -0.83
ZNF248-208ENST00000611278 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
ZNF248-208ENST00000611278 IGFBP4P22692 258 aa9.89□□□□□ -0.83
ZNF248-208ENST00000611278 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa9.89□□□□□ -0.83
ZNF248-208ENST00000611278 RNF146Q9NTX7 359 aa9.89□□□□□ -0.83
ZNF248-208ENST00000611278 FAM13BQ9NYF5 915 aa9.89□□□□□ -0.83
ZNF248-208ENST00000611278 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
ZNF248-208ENST00000611278 GPAA1O43292 621 aa9.89□□□□□ -0.83
ZNF248-208ENST00000611278 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
ZNF248-208ENST00000611278 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
ZNF248-208ENST00000611278 SRGAP2BP0DMP2 458 aa9.89□□□□□ -0.83
ZNF248-208ENST00000611278 RTP1P59025 263 aa9.89□□□□□ -0.83
ZNF248-208ENST00000611278 FPGSQ05932 587 aa9.89□□□□□ -0.83
ZNF248-208ENST00000611278 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa9.89□□□□□ -0.83
ZNF248-208ENST00000611278 SHISA4Q96DD7 197 aa9.89□□□□□ -0.83
ZNF248-208ENST00000611278 HAUS7Q99871 368 aa9.89□□□□□ -0.83
ZNF248-208ENST00000611278 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
ZNF248-208ENST00000611278 TPM2P07951 284 aa9.89□□□□□ -0.83
ZNF248-208ENST00000611278 OAZ1P54368 228 aa9.89□□□□□ -0.83
ZNF248-208ENST00000611278 C12orf42Q96LP6 360 aa9.89□□□□□ -0.83
ZNF248-208ENST00000611278 PRO3102Q9H379 93 aa9.89□□□□□ -0.83
ZNF248-208ENST00000611278 CASTP20810 708 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
ZNF248-208ENST00000611278 ADD2P35612 726 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF248-208ENST00000611278 FAM83BQ5T0W9 1011 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF248-208ENST00000611278 VGLL2Q8N8G2 317 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF248-208ENST00000611278 STAG1Q8WVM7 1258 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF248-208ENST00000611278 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
ZNF248-208ENST00000611278 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
ZNF248-208ENST00000611278 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
ZNF248-208ENST00000611278 TDHQ8IZJ6 230 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF248-208ENST00000611278 SDR42E1Q8WUS8 393 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF248-208ENST00000611278 TNFAIP2Q03169 654 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF248-208ENST00000611278 POLA2Q14181 598 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF248-208ENST00000611278 MTFR1Q15390 333 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF248-208ENST00000611278 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF248-208ENST00000611278 PDCL3Q9H2J4 239 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF248-208ENST00000611278 MLXIPQ9HAP2 919 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF248-208ENST00000611278 EEF2P13639 858 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
ZNF248-208ENST00000611278 BMP8BP34820 402 aa9.87□□□□□ -0.83
ZNF248-208ENST00000611278 ARHGEF16Q5VV41 709 aa9.87□□□□□ -0.83
ZNF248-208ENST00000611278 OLFML2BQ68BL8 750 aa9.87□□□□□ -0.83
ZNF248-208ENST00000611278 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
ZNF248-208ENST00000611278 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
ZNF248-208ENST00000611278 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa9.87□□□□□ -0.83
ZNF248-208ENST00000611278 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
ZNF248-208ENST00000611278 TMX2Q9Y320 296 aa9.87□□□□□ -0.83
ZNF248-208ENST00000611278 ATRNL1Q5VV63 1379 aa9.87□□□□□ -0.83
ZNF248-208ENST00000611278 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa9.87□□□□□ -0.83
ZNF248-208ENST00000611278 CALML3P27482 149 aa9.87□□□□□ -0.83
ZNF248-208ENST00000611278 FERMT2Q96AC1 680 aa9.87□□□□□ -0.83
ZNF248-208ENST00000611278 CDHR1Q96JP9 859 aa9.87□□□□□ -0.83
ZNF248-208ENST00000611278 TINF2Q9BSI4 451 aa9.87□□□□□ -0.83
ZNF248-208ENST00000611278 ZBTB22O15209 634 aa9.87□□□□□ -0.83
ZNF248-208ENST00000611278 FOSL2P15408 326 aa9.87□□□□□ -0.83
ZNF248-208ENST00000611278 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
ZNF248-208ENST00000611278 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
ZNF248-208ENST00000611278 RIOX2Q8IUF8 465 aa9.87□□□□□ -0.83
ZNF248-208ENST00000611278 ATG4CQ96DT6 458 aa9.87□□□□□ -0.83
ZNF248-208ENST00000611278 CALM1P0DP23 149 aa9.87□□□□□ -0.83
ZNF248-208ENST00000611278 CALM2P0DP24 149 aa9.87□□□□□ -0.83
ZNF248-208ENST00000611278 CALM3P0DP25 149 aa9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms