RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604740.5

LAMA4-222, Transcript of laminin subunit alpha 4, human

TSL 2

Gene LAMA4, Length 694 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LAMA4-222	ENST00000604740	RTP1	P59025	263 aa		6.71	□□□□□ -1.34
LAMA4-222	ENST00000604740	ZNF385B	Q569K4	471 aa		6.71	□□□□□ -1.34
LAMA4-222	ENST00000604740	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	6.71	□□□□□ -1.34
LAMA4-222	ENST00000604740	FCRL2	Q96LA5	508 aa	Predicted RBP	6.71	□□□□□ -1.34
LAMA4-222	ENST00000604740	PLCD4	Q9BRC7	762 aa		6.71	□□□□□ -1.34
LAMA4-222	ENST00000604740	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		6.71	□□□□□ -1.34
LAMA4-222	ENST00000604740	CRTAC1	Q9NQ79	661 aa		6.71	□□□□□ -1.34
LAMA4-222	ENST00000604740	NME1	P15531	152 aa	Known RBP	6.7	□□□□□ -1.34
LAMA4-222	ENST00000604740	CTSW	P56202	376 aa		6.7	□□□□□ -1.34
LAMA4-222	ENST00000604740	MRPL58	Q14197	206 aa	Known RBP	6.7	□□□□□ -1.34
LAMA4-222	ENST00000604740	SSPN	Q14714	243 aa		6.7	□□□□□ -1.34
LAMA4-222	ENST00000604740	TCERG1L	Q5VWI1	586 aa		6.7	□□□□□ -1.34
LAMA4-222	ENST00000604740	TMEM192	Q8IY95	271 aa		6.7	□□□□□ -1.34
LAMA4-222	ENST00000604740	NKD1	Q969G9	470 aa		6.7	□□□□□ -1.34
LAMA4-222	ENST00000604740	SLC6A18	Q96N87	628 aa		6.7	□□□□□ -1.34
LAMA4-222	ENST00000604740	SIRT5	Q9NXA8	310 aa		6.7	□□□□□ -1.34
LAMA4-222	ENST00000604740	GFOD1	Q9NXC2	390 aa		6.7	□□□□□ -1.34
LAMA4-222	ENST00000604740	MBD1	Q9UIS9	605 aa	Predicted RBP	6.7	□□□□□ -1.34
LAMA4-222	ENST00000604740	FBXL21	Q9UKT6	434 aa		6.7	□□□□□ -1.34
LAMA4-222	ENST00000604740	GPR55	Q9Y2T6	319 aa	Predicted RBP	6.7	□□□□□ -1.34
LAMA4-222	ENST00000604740	PCDHB12	Q9Y5F1	795 aa		6.7	□□□□□ -1.34
LAMA4-222	ENST00000604740		B8ZZF3	427 aa		6.69	□□□□□ -1.34
LAMA4-222	ENST00000604740	BMP7	P18075	431 aa		6.69	□□□□□ -1.34
LAMA4-222	ENST00000604740	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
LAMA4-222	ENST00000604740	CDADC1	Q9BWV3	514 aa		6.69	□□□□□ -1.34
LAMA4-222	ENST00000604740	ZCCHC4	Q9H5U6	513 aa		6.69	□□□□□ -1.34
LAMA4-222	ENST00000604740	IRAK3	Q9Y616	596 aa		6.69	□□□□□ -1.34
LAMA4-222	ENST00000604740	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		6.69	□□□□□ -1.34
LAMA4-222	ENST00000604740	NCAN	O14594	1321 aa		6.69	□□□□□ -1.34
LAMA4-222	ENST00000604740	FAM86C2P	A6NEL3	165 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LAMA4-222	ENST00000604740	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LAMA4-222	ENST00000604740	HRK	O00198	91 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LAMA4-222	ENST00000604740	TNFRSF10C	O14798	259 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LAMA4-222	ENST00000604740	PNLIP	P16233	465 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LAMA4-222	ENST00000604740	PI3	P19957	117 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LAMA4-222	ENST00000604740	HOXA5	P20719	270 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LAMA4-222	ENST00000604740	VIPR1	P32241	457 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LAMA4-222	ENST00000604740	HSF5	Q4G112	596 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
LAMA4-222	ENST00000604740	GALNT18	Q6P9A2	607 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LAMA4-222	ENST00000604740	SIGLEC10	Q96LC7	697 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LAMA4-222	ENST00000604740	TNFRSF10D	Q9UBN6	386 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LAMA4-222	ENST00000604740	FADS2P1	A8MWK0	482 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LAMA4-222	ENST00000604740	PRRG2	O14669	202 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LAMA4-222	ENST00000604740	ENDOU	P21128	410 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
LAMA4-222	ENST00000604740	EPHB3	P54753	998 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LAMA4-222	ENST00000604740	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
LAMA4-222	ENST00000604740	KIR3DS1	Q14943	382 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LAMA4-222	ENST00000604740	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LAMA4-222	ENST00000604740	CRTC3	Q6UUV7	619 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LAMA4-222	ENST00000604740	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LAMA4-222	ENST00000604740	TMEM151B	Q8IW70	566 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LAMA4-222	ENST00000604740	SLC9A7	Q96T83	725 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LAMA4-222	ENST00000604740	NT5C1A	Q9BXI3	368 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LAMA4-222	ENST00000604740	PARD6A	Q9NPB6	346 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LAMA4-222	ENST00000604740	ERVK13-1	Q9NX77	482 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LAMA4-222	ENST00000604740	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
LAMA4-222	ENST00000604740	ZNF205	O95201	554 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LAMA4-222	ENST00000604740	BMP8B	P34820	402 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LAMA4-222	ENST00000604740	ARL4A	P40617	200 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LAMA4-222	ENST00000604740	CTSK	P43235	329 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LAMA4-222	ENST00000604740	SLITRK4	Q8IW52	837 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LAMA4-222	ENST00000604740	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LAMA4-222	ENST00000604740	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
LAMA4-222	ENST00000604740	SPON2	Q9BUD6	331 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LAMA4-222	ENST00000604740	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LAMA4-222	ENST00000604740	CNTD2	Q9H8S5	307 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LAMA4-222	ENST00000604740	ABLIM1	O14639	778 aa		6.65	□□□□□ -1.34
LAMA4-222	ENST00000604740	N4BP3	O15049	544 aa		6.65	□□□□□ -1.34
LAMA4-222	ENST00000604740	MPO	P05164	745 aa		6.65	□□□□□ -1.34
LAMA4-222	ENST00000604740	PRKCA	P17252	672 aa		6.65	□□□□□ -1.34
LAMA4-222	ENST00000604740	ERVFRD-1	P60508	538 aa		6.65	□□□□□ -1.34
LAMA4-222	ENST00000604740	SLCO6A1	Q86UG4	719 aa		6.65	□□□□□ -1.34
LAMA4-222	ENST00000604740	NUP43	Q8NFH3	380 aa		6.65	□□□□□ -1.34
LAMA4-222	ENST00000604740	PANK1	Q8TE04	598 aa		6.65	□□□□□ -1.34
LAMA4-222	ENST00000604740	C20orf173	Q96LM9	149 aa		6.65	□□□□□ -1.34
LAMA4-222	ENST00000604740	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		6.65	□□□□□ -1.34
LAMA4-222	ENST00000604740	TRIM13	O60858	407 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LAMA4-222	ENST00000604740	YBX1	P67809	324 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
LAMA4-222	ENST00000604740	LAPTM5	Q13571	262 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LAMA4-222	ENST00000604740	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LAMA4-222	ENST00000604740	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
LAMA4-222	ENST00000604740	TMC6	Q7Z403	805 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LAMA4-222	ENST00000604740	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LAMA4-222	ENST00000604740	KCNC2	Q96PR1	638 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LAMA4-222	ENST00000604740	SUCO	Q9UBS9	1254 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
LAMA4-222	ENST00000604740		A0A1W2PQ45	241 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
LAMA4-222	ENST00000604740		A0A1W2PQY0	241 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LAMA4-222	ENST00000604740	NUDT19	A8MXV4	375 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LAMA4-222	ENST00000604740		C9IYK1	514 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LAMA4-222	ENST00000604740	VAV1	P15498	845 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LAMA4-222	ENST00000604740	BUD31	P41223	144 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
LAMA4-222	ENST00000604740	AFF3	P51826	1226 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
LAMA4-222	ENST00000604740	CDR1	P51861	262 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LAMA4-222	ENST00000604740	CYP4F8	P98187	520 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LAMA4-222	ENST00000604740	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LAMA4-222	ENST00000604740	NAT16	Q8N8M0	369 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LAMA4-222	ENST00000604740	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
LAMA4-222	ENST00000604740	DHRS1	Q96LJ7	313 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LAMA4-222	ENST00000604740	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LAMA4-222	ENST00000604740	PRR13	Q9NZ81	148 aa		6.63	□□□□□ -1.35

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