RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000603544.5

KIAA0391-205, Transcript of KIAA0391, human

TSL 5 BASIC

Gene KIAA0391, Length 2,232 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIAA0391-205	ENST00000603544	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		10.35	□□□□□ -0.75
KIAA0391-205	ENST00000603544	DACH1	Q9UI36	760 aa		10.35	□□□□□ -0.75
KIAA0391-205	ENST00000603544	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		10.34	□□□□□ -0.75
KIAA0391-205	ENST00000603544	MYO1B	O43795	1136 aa		10.34	□□□□□ -0.75
KIAA0391-205	ENST00000603544	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
KIAA0391-205	ENST00000603544	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
KIAA0391-205	ENST00000603544	AKR1B1	P15121	316 aa		10.34	□□□□□ -0.75
KIAA0391-205	ENST00000603544	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
KIAA0391-205	ENST00000603544	SCNN1D	P51172	638 aa		10.34	□□□□□ -0.75
KIAA0391-205	ENST00000603544	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
KIAA0391-205	ENST00000603544	PTPN14	Q15678	1187 aa		10.34	□□□□□ -0.75
KIAA0391-205	ENST00000603544	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
KIAA0391-205	ENST00000603544	SLF2	Q8IX21	1173 aa		10.34	□□□□□ -0.75
KIAA0391-205	ENST00000603544	IQUB	Q8NA54	791 aa		10.34	□□□□□ -0.75
KIAA0391-205	ENST00000603544	LRRC15	Q8TF66	581 aa		10.34	□□□□□ -0.75
KIAA0391-205	ENST00000603544	PIGS	Q96S52	555 aa		10.34	□□□□□ -0.75
KIAA0391-205	ENST00000603544	TMX1	Q9H3N1	280 aa		10.34	□□□□□ -0.75
KIAA0391-205	ENST00000603544	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		10.34	□□□□□ -0.75
KIAA0391-205	ENST00000603544	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		10.34	□□□□□ -0.75
KIAA0391-205	ENST00000603544	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
KIAA0391-205	ENST00000603544	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
KIAA0391-205	ENST00000603544	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
KIAA0391-205	ENST00000603544	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
KIAA0391-205	ENST00000603544	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
KIAA0391-205	ENST00000603544	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		10.34	□□□□□ -0.75
KIAA0391-205	ENST00000603544	MSL1	Q68DK7	614 aa		10.34	□□□□□ -0.75
KIAA0391-205	ENST00000603544	TMC4	Q7Z404	712 aa		10.34	□□□□□ -0.75
KIAA0391-205	ENST00000603544	TMEM139	Q8IV31	216 aa		10.34	□□□□□ -0.75
KIAA0391-205	ENST00000603544	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
KIAA0391-205	ENST00000603544	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		10.34	□□□□□ -0.75
KIAA0391-205	ENST00000603544	GSDMA	Q96QA5	445 aa		10.34	□□□□□ -0.75
KIAA0391-205	ENST00000603544	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
KIAA0391-205	ENST00000603544	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		10.34	□□□□□ -0.75
KIAA0391-205	ENST00000603544	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		10.33	□□□□□ -0.76
KIAA0391-205	ENST00000603544	TEX33	O43247	280 aa		10.33	□□□□□ -0.76
KIAA0391-205	ENST00000603544	MMP10	P09238	476 aa		10.33	□□□□□ -0.76
KIAA0391-205	ENST00000603544	PDHB	P11177	359 aa		10.33	□□□□□ -0.76
KIAA0391-205	ENST00000603544	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
KIAA0391-205	ENST00000603544	NAPA	P54920	295 aa		10.33	□□□□□ -0.76
KIAA0391-205	ENST00000603544	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
KIAA0391-205	ENST00000603544	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		10.33	□□□□□ -0.76
KIAA0391-205	ENST00000603544	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		10.33	□□□□□ -0.76
KIAA0391-205	ENST00000603544	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		10.33	□□□□□ -0.76
KIAA0391-205	ENST00000603544	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		10.33	□□□□□ -0.76
KIAA0391-205	ENST00000603544	NPR1	P16066	1061 aa		10.33	□□□□□ -0.76
KIAA0391-205	ENST00000603544	NFIA	Q12857	509 aa		10.33	□□□□□ -0.76
KIAA0391-205	ENST00000603544	NR1I3	Q14994	352 aa		10.33	□□□□□ -0.76
KIAA0391-205	ENST00000603544	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		10.33	□□□□□ -0.76
KIAA0391-205	ENST00000603544	SPATA1	Q5VX52	437 aa		10.33	□□□□□ -0.76
KIAA0391-205	ENST00000603544	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
KIAA0391-205	ENST00000603544	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		10.33	□□□□□ -0.76
KIAA0391-205	ENST00000603544	PLIN2	Q99541	437 aa		10.33	□□□□□ -0.76
KIAA0391-205	ENST00000603544	SCN9A	Q15858	1988 aa		10.32	□□□□□ -0.76
KIAA0391-205	ENST00000603544	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		10.32	□□□□□ -0.76
KIAA0391-205	ENST00000603544		A0A1B0GTH6	734 aa		10.32	□□□□□ -0.76
KIAA0391-205	ENST00000603544	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	10.32	□□□□□ -0.76
KIAA0391-205	ENST00000603544	SMCO2	A6NFE2	343 aa		10.32	□□□□□ -0.76
KIAA0391-205	ENST00000603544	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	10.32	□□□□□ -0.76
KIAA0391-205	ENST00000603544	KCNJ6	P48051	423 aa		10.32	□□□□□ -0.76
KIAA0391-205	ENST00000603544	ADK	P55263	362 aa	Known RBP	10.32	□□□□□ -0.76
KIAA0391-205	ENST00000603544	SPECC1L	Q69YQ0	1117 aa		10.32	□□□□□ -0.76
KIAA0391-205	ENST00000603544	GALNT17	Q6IS24	598 aa		10.32	□□□□□ -0.76
KIAA0391-205	ENST00000603544	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	10.32	□□□□□ -0.76
KIAA0391-205	ENST00000603544	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		10.32	□□□□□ -0.76
KIAA0391-205	ENST00000603544	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		10.32	□□□□□ -0.76
KIAA0391-205	ENST00000603544	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		10.32	□□□□□ -0.76
KIAA0391-205	ENST00000603544	TC2N	Q8N9U0	490 aa		10.32	□□□□□ -0.76
KIAA0391-205	ENST00000603544	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		10.32	□□□□□ -0.76
KIAA0391-205	ENST00000603544	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		10.32	□□□□□ -0.76
KIAA0391-205	ENST00000603544	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		10.32	□□□□□ -0.76
KIAA0391-205	ENST00000603544	DISC1	Q9NRI5	854 aa		10.32	□□□□□ -0.76
KIAA0391-205	ENST00000603544	USP40	Q9NVE5	1235 aa		10.32	□□□□□ -0.76
KIAA0391-205	ENST00000603544	CTNND2	Q9UQB3	1225 aa		10.32	□□□□□ -0.76
KIAA0391-205	ENST00000603544	GDA	Q9Y2T3	454 aa		10.32	□□□□□ -0.76
KIAA0391-205	ENST00000603544	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		10.32	□□□□□ -0.76
KIAA0391-205	ENST00000603544	APBA3	O96018	575 aa		10.31	□□□□□ -0.76
KIAA0391-205	ENST00000603544	SHMT1	P34896	483 aa		10.31	□□□□□ -0.76
KIAA0391-205	ENST00000603544	STAT6	P42226	847 aa		10.31	□□□□□ -0.76
KIAA0391-205	ENST00000603544	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	10.31	□□□□□ -0.76
KIAA0391-205	ENST00000603544	LETM2	Q2VYF4	491 aa		10.31	□□□□□ -0.76
KIAA0391-205	ENST00000603544	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		10.31	□□□□□ -0.76
KIAA0391-205	ENST00000603544	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	10.31	□□□□□ -0.76
KIAA0391-205	ENST00000603544	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		10.31	□□□□□ -0.76
KIAA0391-205	ENST00000603544	TMEM260	Q9NX78	707 aa		10.31	□□□□□ -0.76
KIAA0391-205	ENST00000603544	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		10.31	□□□□□ -0.76
KIAA0391-205	ENST00000603544	SIPA1L1	O43166	1804 aa		10.31	□□□□□ -0.76
KIAA0391-205	ENST00000603544	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	10.31	□□□□□ -0.76
KIAA0391-205	ENST00000603544	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	10.31	□□□□□ -0.76
KIAA0391-205	ENST00000603544	COA7	Q96BR5	231 aa		10.31	□□□□□ -0.76
KIAA0391-205	ENST00000603544	ARID3A	Q99856	593 aa		10.31	□□□□□ -0.76
KIAA0391-205	ENST00000603544	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	10.31	□□□□□ -0.76
KIAA0391-205	ENST00000603544	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	10.31	□□□□□ -0.76
KIAA0391-205	ENST00000603544	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		10.31	□□□□□ -0.76
KIAA0391-205	ENST00000603544	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	10.31	□□□□□ -0.76
KIAA0391-205	ENST00000603544	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
KIAA0391-205	ENST00000603544	PLSCR1	O15162	318 aa		10.3	□□□□□ -0.76
KIAA0391-205	ENST00000603544	FANCG	O15287	622 aa		10.3	□□□□□ -0.76
KIAA0391-205	ENST00000603544	EDIL3	O43854	480 aa		10.3	□□□□□ -0.76
KIAA0391-205	ENST00000603544	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	10.3	□□□□□ -0.76
KIAA0391-205	ENST00000603544	SNHG28	P0DPA3	235 aa		10.3	□□□□□ -0.76

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms