RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591097.5

CIRBP-231, Transcript of cold inducible RNA binding protein, human

TSL 1 (best)

Gene CIRBP, Length 1,507 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CIRBP-231	ENST00000591097	MORN1	Q5T089	497 aa		27.36	■■□□□ 1.97
CIRBP-231	ENST00000591097	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		27.36	■■□□□ 1.97
CIRBP-231	ENST00000591097	RIOX2	Q8IUF8	465 aa		27.36	■■□□□ 1.97
CIRBP-231	ENST00000591097	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	27.36	■■□□□ 1.97
CIRBP-231	ENST00000591097	RAET1E	Q8TD07	263 aa		27.36	■■□□□ 1.97
CIRBP-231	ENST00000591097	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		27.36	■■□□□ 1.97
CIRBP-231	ENST00000591097	USP6NL	Q92738	828 aa		27.36	■■□□□ 1.97
CIRBP-231	ENST00000591097	ARMC5	Q96C12	935 aa		27.36	■■□□□ 1.97
CIRBP-231	ENST00000591097	SENP2	Q9HC62	589 aa		27.36	■■□□□ 1.97
CIRBP-231	ENST00000591097	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	27.35	■■□□□ 1.97
CIRBP-231	ENST00000591097	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	27.35	■■□□□ 1.97
CIRBP-231	ENST00000591097	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		27.35	■■□□□ 1.97
CIRBP-231	ENST00000591097	MTA3	Q9BTC8	594 aa		27.35	■■□□□ 1.97
CIRBP-231	ENST00000591097	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		27.35	■■□□□ 1.97
CIRBP-231	ENST00000591097	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		27.35	■■□□□ 1.97
CIRBP-231	ENST00000591097	FDX1	P10109	184 aa		27.34	■■□□□ 1.97
CIRBP-231	ENST00000591097	STAT3	P40763	770 aa		27.34	■■□□□ 1.97
CIRBP-231	ENST00000591097	MCM5	P33992	734 aa		27.33	■■□□□ 1.97
CIRBP-231	ENST00000591097	OAZ1	P54368	228 aa		27.33	■■□□□ 1.97
CIRBP-231	ENST00000591097	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	27.33	■■□□□ 1.97
CIRBP-231	ENST00000591097	GRB14	Q14449	540 aa		27.33	■■□□□ 1.97
CIRBP-231	ENST00000591097	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	27.33	■■□□□ 1.97
CIRBP-231	ENST00000591097	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		27.33	■■□□□ 1.97
CIRBP-231	ENST00000591097	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		27.33	■■□□□ 1.97
CIRBP-231	ENST00000591097	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	27.33	■■□□□ 1.97
CIRBP-231	ENST00000591097	MROH8	Q9H579	483 aa		27.33	■■□□□ 1.97
CIRBP-231	ENST00000591097	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		27.33	■■□□□ 1.97
CIRBP-231	ENST00000591097	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		27.33	■■□□□ 1.97
CIRBP-231	ENST00000591097	PRC1	O43663	620 aa		27.32	■■□□□ 1.96
CIRBP-231	ENST00000591097	ZBED4	O75132	1171 aa		27.32	■■□□□ 1.96
CIRBP-231	ENST00000591097	SLC25A27	O95847	323 aa		27.32	■■□□□ 1.96
CIRBP-231	ENST00000591097	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	27.32	■■□□□ 1.96
CIRBP-231	ENST00000591097	PTPRE	P23469	700 aa		27.32	■■□□□ 1.96
CIRBP-231	ENST00000591097	SLC16A2	P36021	539 aa		27.32	■■□□□ 1.96
CIRBP-231	ENST00000591097	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		27.32	■■□□□ 1.96
CIRBP-231	ENST00000591097	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		27.32	■■□□□ 1.96
CIRBP-231	ENST00000591097	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		27.32	■■□□□ 1.96
CIRBP-231	ENST00000591097	ZNF536	O15090	1300 aa		27.32	■■□□□ 1.96
CIRBP-231	ENST00000591097	ERICH2	A1L162	156 aa		27.31	■■□□□ 1.96
CIRBP-231	ENST00000591097	GRK4	P32298	578 aa		27.31	■■□□□ 1.96
CIRBP-231	ENST00000591097	WDR78	Q5VTH9	848 aa		27.31	■■□□□ 1.96
CIRBP-231	ENST00000591097	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		27.31	■■□□□ 1.96
CIRBP-231	ENST00000591097	PXYLP1	Q8TE99	480 aa		27.31	■■□□□ 1.96
CIRBP-231	ENST00000591097	ZNF333	Q96JL9	665 aa		27.31	■■□□□ 1.96
CIRBP-231	ENST00000591097	LY9	Q9HBG7	655 aa		27.31	■■□□□ 1.96
CIRBP-231	ENST00000591097	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	27.31	■■□□□ 1.96
CIRBP-231	ENST00000591097	RIPK3	Q9Y572	518 aa		27.31	■■□□□ 1.96
CIRBP-231	ENST00000591097	SLC15A5	A6NIM6	579 aa		27.31	■■□□□ 1.96
CIRBP-231	ENST00000591097	ADCY3	O60266	1144 aa		27.31	■■□□□ 1.96
CIRBP-231	ENST00000591097	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		27.31	■■□□□ 1.96
CIRBP-231	ENST00000591097	WTAP	Q15007	396 aa		27.31	■■□□□ 1.96
CIRBP-231	ENST00000591097	SYDE2	Q5VT97	1194 aa		27.31	■■□□□ 1.96
CIRBP-231	ENST00000591097	SNRNP48	Q6IEG0	339 aa	Known RBP	27.31	■■□□□ 1.96
CIRBP-231	ENST00000591097	SLAIN1	Q8ND83	568 aa		27.31	■■□□□ 1.96
CIRBP-231	ENST00000591097	NEK1	Q96PY6	1258 aa		27.31	■■□□□ 1.96
CIRBP-231	ENST00000591097	USP26	Q9BXU7	913 aa		27.31	■■□□□ 1.96
CIRBP-231	ENST00000591097	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	27.31	■■□□□ 1.96
CIRBP-231	ENST00000591097	STRN	O43815	780 aa		27.3	■■□□□ 1.96
CIRBP-231	ENST00000591097	XRCC5	P13010	732 aa	Known RBP	27.3	■■□□□ 1.96
CIRBP-231	ENST00000591097	ELN	P15502	786 aa		27.3	■■□□□ 1.96
CIRBP-231	ENST00000591097	KRT32	Q14532	448 aa		27.3	■■□□□ 1.96
CIRBP-231	ENST00000591097	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		27.3	■■□□□ 1.96
CIRBP-231	ENST00000591097	CPXCR1	Q8N123	301 aa		27.3	■■□□□ 1.96
CIRBP-231	ENST00000591097	TMEM87B	Q96K49	555 aa		27.3	■■□□□ 1.96
CIRBP-231	ENST00000591097	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	27.3	■■□□□ 1.96
CIRBP-231	ENST00000591097	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	27.3	■■□□□ 1.96
CIRBP-231	ENST00000591097	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		27.3	■■□□□ 1.96
CIRBP-231	ENST00000591097	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		27.3	■■□□□ 1.96
CIRBP-231	ENST00000591097	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	27.29	■■□□□ 1.96
CIRBP-231	ENST00000591097	COPB2	P35606	906 aa		27.29	■■□□□ 1.96
CIRBP-231	ENST00000591097	TROAP	Q12815	778 aa		27.29	■■□□□ 1.96
CIRBP-231	ENST00000591097	MAP2K5	Q13163	448 aa		27.29	■■□□□ 1.96
CIRBP-231	ENST00000591097	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		27.29	■■□□□ 1.96
CIRBP-231	ENST00000591097	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		27.28	■■□□□ 1.96
CIRBP-231	ENST00000591097	HOXC6	P09630	235 aa		27.28	■■□□□ 1.96
CIRBP-231	ENST00000591097	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	27.28	■■□□□ 1.96
CIRBP-231	ENST00000591097	NBPF11	Q86T75	865 aa		27.28	■■□□□ 1.96
CIRBP-231	ENST00000591097	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	27.27	■■□□□ 1.96
CIRBP-231	ENST00000591097	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		27.27	■■□□□ 1.96
CIRBP-231	ENST00000591097	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	27.27	■■□□□ 1.96
CIRBP-231	ENST00000591097	CYP2B6	P20813	491 aa		27.27	■■□□□ 1.96
CIRBP-231	ENST00000591097	ADORA2A	P29274	412 aa		27.27	■■□□□ 1.96
CIRBP-231	ENST00000591097	RGS2	P41220	211 aa		27.27	■■□□□ 1.96
CIRBP-231	ENST00000591097	SNAP25	P60880	206 aa		27.27	■■□□□ 1.96
CIRBP-231	ENST00000591097	APBA2	Q99767	749 aa		27.27	■■□□□ 1.96
CIRBP-231	ENST00000591097	CPVL	Q9H3G5	476 aa		27.27	■■□□□ 1.96
CIRBP-231	ENST00000591097	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	27.27	■■□□□ 1.96
CIRBP-231	ENST00000591097	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	27.27	■■□□□ 1.96
CIRBP-231	ENST00000591097	LIFR	P42702	1097 aa		27.26	■■□□□ 1.96
CIRBP-231	ENST00000591097	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	27.26	■■□□□ 1.96
CIRBP-231	ENST00000591097	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	27.26	■■□□□ 1.96
CIRBP-231	ENST00000591097	AGBL1	Q96MI9	1066 aa		27.26	■■□□□ 1.96
CIRBP-231	ENST00000591097	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		27.26	■■□□□ 1.96
CIRBP-231	ENST00000591097	FCER1A	P12319	257 aa		27.26	■■□□□ 1.95
CIRBP-231	ENST00000591097	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		27.26	■■□□□ 1.95
CIRBP-231	ENST00000591097	TRIB2	Q92519	343 aa		27.26	■■□□□ 1.95
CIRBP-231	ENST00000591097	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		27.26	■■□□□ 1.95
CIRBP-231	ENST00000591097	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	27.25	■■□□□ 1.95
CIRBP-231	ENST00000591097	GRM4	Q14833	912 aa		27.25	■■□□□ 1.95
CIRBP-231	ENST00000591097	IFFO2	Q5TF58	517 aa		27.25	■■□□□ 1.95

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