RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587324.1

UBXN6-204, Transcript of UBX domain protein 6, humanhuman

TSL 3

Gene UBXN6, Length 712 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6-204ENST00000587324 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
UBXN6-204ENST00000587324 FPGSQ05932 587 aa22.56■■□□□ 1.2
UBXN6-204ENST00000587324 CTR9Q6PD62 1173 aa22.56■■□□□ 1.2
UBXN6-204ENST00000587324 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa22.56■■□□□ 1.2
UBXN6-204ENST00000587324 KLHDC9Q8NEP7 349 aa22.56■■□□□ 1.2
UBXN6-204ENST00000587324 KANSL2Q9H9L4 492 aa22.56■■□□□ 1.2
UBXN6-204ENST00000587324 LRRC37A2A6NM11 1700 aa22.56■■□□□ 1.2
UBXN6-204ENST00000587324 DNAJB2P25686 324 aa22.55■■□□□ 1.2
UBXN6-204ENST00000587324 ACLYP53396 1101 aa22.55■■□□□ 1.2
UBXN6-204ENST00000587324 FGD4Q96M96 766 aa22.55■■□□□ 1.2
UBXN6-204ENST00000587324 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
UBXN6-204ENST00000587324 HAUS7Q99871 368 aa22.55■■□□□ 1.2
UBXN6-204ENST00000587324 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
UBXN6-204ENST00000587324 TMEM39AQ9NV64 488 aa22.55■■□□□ 1.2
UBXN6-204ENST00000587324 TBX21Q9UL17 535 aa22.55■■□□□ 1.2
UBXN6-204ENST00000587324 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa22.54■■□□□ 1.2
UBXN6-204ENST00000587324 ATP5JP18859 108 aa22.54■■□□□ 1.2
UBXN6-204ENST00000587324 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
UBXN6-204ENST00000587324 GOPCQ9HD26 462 aa22.54■■□□□ 1.2
UBXN6-204ENST00000587324 STARD7Q9NQZ5 370 aa22.54■■□□□ 1.2
UBXN6-204ENST00000587324 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa22.54■■□□□ 1.2
UBXN6-204ENST00000587324 LCTP09848 1927 aa22.53■■□□□ 1.2
UBXN6-204ENST00000587324 RAD21O60216 631 aa22.53■■□□□ 1.2
UBXN6-204ENST00000587324 RASA1P20936 1047 aa22.53■■□□□ 1.2
UBXN6-204ENST00000587324 UBE3CQ15386 1083 aa22.53■■□□□ 1.2
UBXN6-204ENST00000587324 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
UBXN6-204ENST00000587324 TOX2Q96NM4 488 aa22.53■■□□□ 1.2
UBXN6-204ENST00000587324 SLF1Q9BQI6 1058 aa22.53■■□□□ 1.2
UBXN6-204ENST00000587324 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP22.53■■□□□ 1.26e-8■□□□□ 9.5
UBXN6-204ENST00000587324 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
UBXN6-204ENST00000587324 CNPY2Q9Y2B0 182 aa22.53■■□□□ 1.2
UBXN6-204ENST00000587324 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa22.53■■□□□ 1.2
UBXN6-204ENST00000587324 KCNA10Q16322 511 aa22.52■■□□□ 1.2
UBXN6-204ENST00000587324 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa22.52■■□□□ 1.2
UBXN6-204ENST00000587324 C16orf59Q7L2K0 433 aa22.52■■□□□ 1.2
UBXN6-204ENST00000587324 TEX13BQ9BXU2 312 aa22.52■■□□□ 1.2
UBXN6-204ENST00000587324 PRDM6Q9NQX0 595 aa22.52■■□□□ 1.2
UBXN6-204ENST00000587324 NDUFB10O96000 172 aa22.51■■□□□ 1.19
UBXN6-204ENST00000587324 COPB2P35606 906 aa22.51■■□□□ 1.19
UBXN6-204ENST00000587324 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
UBXN6-204ENST00000587324 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP22.51■■□□□ 1.195e-6■■□□□ 13.3
UBXN6-204ENST00000587324 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa22.51■■□□□ 1.19
UBXN6-204ENST00000587324 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
UBXN6-204ENST00000587324 TRANK1O15050 2925 aa22.5■■□□□ 1.19
UBXN6-204ENST00000587324 MOXD2PA6NHM9 499 aa22.5■■□□□ 1.19
UBXN6-204ENST00000587324 TIMP1P01033 207 aa22.5■■□□□ 1.19
UBXN6-204ENST00000587324 PBX2P40425 430 aa22.5■■□□□ 1.19
UBXN6-204ENST00000587324 AMOTL1Q8IY63 956 aa22.5■■□□□ 1.19
UBXN6-204ENST00000587324 STK11IPQ8N1F8 1099 aa22.5■■□□□ 1.19
UBXN6-204ENST00000587324 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
UBXN6-204ENST00000587324 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
UBXN6-204ENST00000587324 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
UBXN6-204ENST00000587324 GRXCR1A8MXD5 290 aa22.49■■□□□ 1.19
UBXN6-204ENST00000587324 DCDC2CA8MYV0 355 aa22.49■■□□□ 1.19
UBXN6-204ENST00000587324 RAB11FIP3O75154 756 aa22.49■■□□□ 1.19
UBXN6-204ENST00000587324 CST5P28325 142 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
UBXN6-204ENST00000587324 CDK7P50613 346 aa22.49■■□□□ 1.19
UBXN6-204ENST00000587324 RASIP1Q5U651 963 aa22.49■■□□□ 1.19
UBXN6-204ENST00000587324 ZNF576Q9H609 170 aa22.49■■□□□ 1.19
UBXN6-204ENST00000587324 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
UBXN6-204ENST00000587324 FAM184BQ9ULE4 1060 aa22.49■■□□□ 1.19
UBXN6-204ENST00000587324 COG6Q9Y2V7 657 aa22.49■■□□□ 1.19
UBXN6-204ENST00000587324 XIRP2A4UGR9 3374 aa22.49■■□□□ 1.19
UBXN6-204ENST00000587324 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa22.48■■□□□ 1.19
UBXN6-204ENST00000587324 F5H6K3 240 aa22.48■■□□□ 1.19
UBXN6-204ENST00000587324 CTAGE5O15320 804 aa22.48■■□□□ 1.19
UBXN6-204ENST00000587324 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
UBXN6-204ENST00000587324 KLRC3Q07444 240 aa22.48■■□□□ 1.19
UBXN6-204ENST00000587324 TMEM240Q5SV17 173 aa22.48■■□□□ 1.19
UBXN6-204ENST00000587324 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP22.48■■□□□ 1.19
UBXN6-204ENST00000587324 NUP133Q8WUM0 1156 aa22.48■■□□□ 1.19
UBXN6-204ENST00000587324 TIFAQ96CG3 184 aa22.48■■□□□ 1.19
UBXN6-204ENST00000587324 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
UBXN6-204ENST00000587324 KATNBL1Q9H079 304 aa22.48■■□□□ 1.19
UBXN6-204ENST00000587324 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
UBXN6-204ENST00000587324 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
UBXN6-204ENST00000587324 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
UBXN6-204ENST00000587324 NYAP2Q9P242 653 aa22.48■■□□□ 1.19
UBXN6-204ENST00000587324 GSG1L2A8MUP6 293 aa22.47■■□□□ 1.19
UBXN6-204ENST00000587324 ATP2A1O14983 1001 aa22.47■■□□□ 1.19
UBXN6-204ENST00000587324 HMMRO75330 724 aa22.47■■□□□ 1.19
UBXN6-204ENST00000587324 ASGR1P07306 291 aa22.47■■□□□ 1.19
UBXN6-204ENST00000587324 ACVR2BQ13705 512 aa22.47■■□□□ 1.19
UBXN6-204ENST00000587324 MFSD5Q6N075 450 aa22.47■■□□□ 1.19
UBXN6-204ENST00000587324 CPXCR1Q8N123 301 aa22.47■■□□□ 1.19
UBXN6-204ENST00000587324 PBX4Q9BYU1 374 aa22.47■■□□□ 1.19
UBXN6-204ENST00000587324 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
UBXN6-204ENST00000587324 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
UBXN6-204ENST00000587324 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
UBXN6-204ENST00000587324 SLC4A3P48751 1232 aa22.46■■□□□ 1.19
UBXN6-204ENST00000587324 SBK1Q52WX2 424 aa22.46■■□□□ 1.19
UBXN6-204ENST00000587324 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
UBXN6-204ENST00000587324 DDX11Q96FC9 970 aa22.46■■□□□ 1.19
UBXN6-204ENST00000587324 DDRGK1Q96HY6 314 aa22.46■■□□□ 1.19
UBXN6-204ENST00000587324 ELP1O95163 1332 aa22.46■■□□□ 1.19
UBXN6-204ENST00000587324 ACRP10323 421 aa22.45■■□□□ 1.18
UBXN6-204ENST00000587324 CSF2RAP15509 400 aa22.45■■□□□ 1.18
UBXN6-204ENST00000587324 GJA9P57773 515 aa22.45■■□□□ 1.18
UBXN6-204ENST00000587324 CCDC144BQ3MJ40 725 aa22.45■■□□□ 1.18
UBXN6-204ENST00000587324 TJAP1Q5JTD0 557 aa22.45■■□□□ 1.18
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