RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582955.5

SMARCE1-218, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 5

Gene SMARCE1, Length 621 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-218ENST00000582955 MTFR1Q15390 333 aa14.82□□□□□ -0.04
SMARCE1-218ENST00000582955 CCDC178Q5BJE1 867 aa14.82□□□□□ -0.04
SMARCE1-218ENST00000582955 MORN1Q5T089 497 aa14.82□□□□□ -0.04
SMARCE1-218ENST00000582955 RCSD1Q6JBY9 416 aa14.82□□□□□ -0.04
SMARCE1-218ENST00000582955 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
SMARCE1-218ENST00000582955 FAM160B2Q86V87 743 aa14.82□□□□□ -0.04
SMARCE1-218ENST00000582955 CHURC1Q8WUH1 139 aa14.82□□□□□ -0.04
SMARCE1-218ENST00000582955 DCAF4Q8WV16 495 aa14.82□□□□□ -0.04
SMARCE1-218ENST00000582955 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
SMARCE1-218ENST00000582955 UBAC1Q9BSL1 405 aa14.82□□□□□ -0.04
SMARCE1-218ENST00000582955 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
SMARCE1-218ENST00000582955 MROH8Q9H579 483 aa14.82□□□□□ -0.04
SMARCE1-218ENST00000582955 ZSWIM5Q9P217 1185 aa14.82□□□□□ -0.04
SMARCE1-218ENST00000582955 PLXNB2O15031 1838 aa14.82□□□□□ -0.04
SMARCE1-218ENST00000582955 SLC25A27O95847 323 aa14.81□□□□□ -0.04
SMARCE1-218ENST00000582955 HMGCRP04035 888 aa14.81□□□□□ -0.04
SMARCE1-218ENST00000582955 CCL5P13501 91 aa14.81□□□□□ -0.04
SMARCE1-218ENST00000582955 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
SMARCE1-218ENST00000582955 STAT3P40763 770 aa14.81□□□□□ -0.04
SMARCE1-218ENST00000582955 DGKHQ86XP1 1220 aa14.81□□□□□ -0.04
SMARCE1-218ENST00000582955 RIOX2Q8IUF8 465 aa14.81□□□□□ -0.04
SMARCE1-218ENST00000582955 CPXCR1Q8N123 301 aa14.81□□□□□ -0.04
SMARCE1-218ENST00000582955 REPS2Q8NFH8 660 aa14.81□□□□□ -0.04
SMARCE1-218ENST00000582955 USP6NLQ92738 828 aa14.81□□□□□ -0.04
SMARCE1-218ENST00000582955 APBA2Q99767 749 aa14.81□□□□□ -0.04
SMARCE1-218ENST00000582955 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
SMARCE1-218ENST00000582955 TNKSO95271 1327 aa14.81□□□□□ -0.04
SMARCE1-218ENST00000582955 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
SMARCE1-218ENST00000582955 E7EWF7 191 aa14.8□□□□□ -0.04
SMARCE1-218ENST00000582955 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
SMARCE1-218ENST00000582955 ADORA2AP29274 412 aa14.8□□□□□ -0.04
SMARCE1-218ENST00000582955 GRB14Q14449 540 aa14.8□□□□□ -0.04
SMARCE1-218ENST00000582955 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
SMARCE1-218ENST00000582955 TRIB2Q92519 343 aa14.8□□□□□ -0.04
SMARCE1-218ENST00000582955 TEX13BQ9BXU2 312 aa14.8□□□□□ -0.04
SMARCE1-218ENST00000582955 RNF208Q9H0X6 261 aa14.8□□□□□ -0.04
SMARCE1-218ENST00000582955 KAT14Q9H8E8 782 aa14.8□□□□□ -0.04
SMARCE1-218ENST00000582955 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa14.8□□□□□ -0.04
SMARCE1-218ENST00000582955 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
SMARCE1-218ENST00000582955 GPCPD1Q9NPB8 672 aa14.8□□□□□ -0.04
SMARCE1-218ENST00000582955 TAF6LQ9Y6J9 622 aa14.8□□□□□ -0.04
SMARCE1-218ENST00000582955 STRNO43815 780 aa14.79□□□□□ -0.04
SMARCE1-218ENST00000582955 FDX1P10109 184 aa14.79□□□□□ -0.04
SMARCE1-218ENST00000582955 PDHBP11177 359 aa14.79□□□□□ -0.04
SMARCE1-218ENST00000582955 FCER1AP12319 257 aa14.79□□□□□ -0.04
SMARCE1-218ENST00000582955 COPB2P35606 906 aa14.79□□□□□ -0.04
SMARCE1-218ENST00000582955 RGS19P49795 217 aa14.79□□□□□ -0.04
SMARCE1-218ENST00000582955 CCL14Q16627 93 aa14.79□□□□□ -0.04
SMARCE1-218ENST00000582955 CYB5R4Q7L1T6 521 aa14.79□□□□□ -0.04
SMARCE1-218ENST00000582955 DPP9Q86TI2 863 aa14.79□□□□□ -0.04
SMARCE1-218ENST00000582955 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
SMARCE1-218ENST00000582955 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
SMARCE1-218ENST00000582955 PNMA1Q8ND90 353 aa14.79□□□□□ -0.04
SMARCE1-218ENST00000582955 NCOA7Q8NI08 942 aa14.79□□□□□ -0.04
SMARCE1-218ENST00000582955 MMP19Q99542 508 aa14.79□□□□□ -0.04
SMARCE1-218ENST00000582955 UNC93B1Q9H1C4 597 aa14.79□□□□□ -0.04
SMARCE1-218ENST00000582955 PRR12Q9ULL5 1215 aa14.79□□□□□ -0.04
SMARCE1-218ENST00000582955 PLA2G6O60733 806 aa14.78□□□□□ -0.04
SMARCE1-218ENST00000582955 EN2P19622 333 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
SMARCE1-218ENST00000582955 SLC16A2P36021 539 aa14.78□□□□□ -0.04
SMARCE1-218ENST00000582955 SNAP25P60880 206 aa14.78□□□□□ -0.04
SMARCE1-218ENST00000582955 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
SMARCE1-218ENST00000582955 TRIM32Q13049 653 aa14.78□□□□□ -0.04
SMARCE1-218ENST00000582955 KCTD2Q14681 263 aa14.78□□□□□ -0.04
SMARCE1-218ENST00000582955 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
SMARCE1-218ENST00000582955 TTBK2Q6IQ55 1244 aa14.78□□□□□ -0.04
SMARCE1-218ENST00000582955 STOX1Q6ZVD7 989 aa14.78□□□□□ -0.04
SMARCE1-218ENST00000582955 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
SMARCE1-218ENST00000582955 ERICH2A1L162 156 aa14.77□□□□□ -0.05
SMARCE1-218ENST00000582955 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
SMARCE1-218ENST00000582955 SLC27A2O14975 620 aa14.77□□□□□ -0.05
SMARCE1-218ENST00000582955 ATP2A1O14983 1001 aa14.77□□□□□ -0.05
SMARCE1-218ENST00000582955 HOXC6P09630 235 aa14.77□□□□□ -0.05
SMARCE1-218ENST00000582955 OAZ1P54368 228 aa14.77□□□□□ -0.05
SMARCE1-218ENST00000582955 ZNF543Q08ER8 600 aa14.77□□□□□ -0.05
SMARCE1-218ENST00000582955 SYDE2Q5VT97 1194 aa14.77□□□□□ -0.05
SMARCE1-218ENST00000582955 CREB3L3Q68CJ9 461 aa14.77□□□□□ -0.05
SMARCE1-218ENST00000582955 CCDC174Q6PII3 467 aa14.77□□□□□ -0.05
SMARCE1-218ENST00000582955 ABRAQ8N0Z2 381 aa14.77□□□□□ -0.05
SMARCE1-218ENST00000582955 NPLOC4Q8TAT6 608 aa14.77□□□□□ -0.05
SMARCE1-218ENST00000582955 ANKS1AQ92625 1134 aa14.77□□□□□ -0.05
SMARCE1-218ENST00000582955 HOMER2Q9NSB8 354 aa14.77□□□□□ -0.05
SMARCE1-218ENST00000582955 SLC5A4Q9NY91 659 aa14.77□□□□□ -0.05
SMARCE1-218ENST00000582955 RIPK3Q9Y572 518 aa14.77□□□□□ -0.05
SMARCE1-218ENST00000582955 ZNF236Q9UL36 1845 aa14.77□□□□□ -0.05
SMARCE1-218ENST00000582955 BRCA2P51587 3418 aa14.77□□□□□ -0.05
SMARCE1-218ENST00000582955 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
SMARCE1-218ENST00000582955 GJB1P08034 283 aa14.76□□□□□ -0.05
SMARCE1-218ENST00000582955 GOLGA8HP0CJ92 632 aa14.76□□□□□ -0.05
SMARCE1-218ENST00000582955 SNHG28P0DPA3 235 aa14.76□□□□□ -0.05
SMARCE1-218ENST00000582955 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
SMARCE1-218ENST00000582955 SART3Q15020 963 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
SMARCE1-218ENST00000582955 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
SMARCE1-218ENST00000582955 RNF20Q5VTR2 975 aa14.76□□□□□ -0.05
SMARCE1-218ENST00000582955 MFSD14CQ5VZR4 134 aa14.76□□□□□ -0.05
SMARCE1-218ENST00000582955 CHST3Q7LGC8 479 aa14.76□□□□□ -0.05
SMARCE1-218ENST00000582955 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP14.76□□□□□ -0.05
SMARCE1-218ENST00000582955 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
SMARCE1-218ENST00000582955 FLRT1Q9NZU1 646 aa14.76□□□□□ -0.05
SMARCE1-218ENST00000582955 RPTORQ8N122 1335 aa14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms