RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580019.1

KPNB1-208, Transcript of karyopherin subunit beta 1, human

TSL 2

Gene KPNB1, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KPNB1-208	ENST00000580019	C8orf37	Q96NL8	207 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KPNB1-208	ENST00000580019	DPH2	Q9BQC3	489 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
KPNB1-208	ENST00000580019	PLCD4	Q9BRC7	762 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KPNB1-208	ENST00000580019	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KPNB1-208	ENST00000580019	CYP8B1	Q9UNU6	501 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KPNB1-208	ENST00000580019	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
KPNB1-208	ENST00000580019	TCF3	P15923	654 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KPNB1-208	ENST00000580019	ZNF16	P17020	682 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
KPNB1-208	ENST00000580019	LMO1	P25800	156 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KPNB1-208	ENST00000580019	HTRA3	P83110	453 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KPNB1-208	ENST00000580019	PDE3B	Q13370	1112 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KPNB1-208	ENST00000580019	CDCP2	Q5VXM1	449 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KPNB1-208	ENST00000580019	RNF111	Q6ZNA4	994 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KPNB1-208	ENST00000580019	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KPNB1-208	ENST00000580019	SREK1	Q8WXA9	508 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
KPNB1-208	ENST00000580019	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KPNB1-208	ENST00000580019	CEP44	Q9C0F1	390 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KPNB1-208	ENST00000580019	ENC1	O14682	589 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KPNB1-208	ENST00000580019	PAGE1	O75459	146 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KPNB1-208	ENST00000580019	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
KPNB1-208	ENST00000580019	RTP1	P59025	263 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KPNB1-208	ENST00000580019	FOXO4	P98177	505 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KPNB1-208	ENST00000580019	MVK	Q03426	396 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KPNB1-208	ENST00000580019	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
KPNB1-208	ENST00000580019	WIPI1	Q5MNZ9	446 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
KPNB1-208	ENST00000580019	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KPNB1-208	ENST00000580019	SLC6A19	Q695T7	634 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KPNB1-208	ENST00000580019	GALNT18	Q6P9A2	607 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KPNB1-208	ENST00000580019	GLB1L	Q6UWU2	654 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KPNB1-208	ENST00000580019	DNAJC14	Q6Y2X3	702 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
KPNB1-208	ENST00000580019	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KPNB1-208	ENST00000580019	BCO2	Q9BYV7	579 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KPNB1-208	ENST00000580019	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
KPNB1-208	ENST00000580019	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
KPNB1-208	ENST00000580019	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KPNB1-208	ENST00000580019	RASIP1	Q5U651	963 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KPNB1-208	ENST00000580019	RPTN	Q6XPR3	784 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KPNB1-208	ENST00000580019	CHFR	Q96EP1	664 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KPNB1-208	ENST00000580019	SPATA32	Q96LK8	384 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KPNB1-208	ENST00000580019	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
KPNB1-208	ENST00000580019	BCL11A	Q9H165	835 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KPNB1-208	ENST00000580019	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KPNB1-208	ENST00000580019	TJP2	Q9UDY2	1190 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KPNB1-208	ENST00000580019	KRTAP10-9	P60411	292 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KPNB1-208	ENST00000580019	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
KPNB1-208	ENST00000580019	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
KPNB1-208	ENST00000580019	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
KPNB1-208	ENST00000580019	PLEKHN1	Q494U1	663 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
KPNB1-208	ENST00000580019	ZC3H14	Q6PJT7	736 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
KPNB1-208	ENST00000580019	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KPNB1-208	ENST00000580019	GIPC2	Q8TF65	315 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KPNB1-208	ENST00000580019	RNF141	Q8WVD5	230 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KPNB1-208	ENST00000580019	UBXN4	Q92575	508 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KPNB1-208	ENST00000580019	TMEM87B	Q96K49	555 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KPNB1-208	ENST00000580019	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KPNB1-208	ENST00000580019	KLC2	Q9H0B6	622 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KPNB1-208	ENST00000580019	TNFRSF12A	Q9NP84	129 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KPNB1-208	ENST00000580019	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KPNB1-208	ENST00000580019	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
KPNB1-208	ENST00000580019	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
KPNB1-208	ENST00000580019	LRRN2	O75325	713 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KPNB1-208	ENST00000580019	PPFIA2	O75334	1257 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KPNB1-208	ENST00000580019	VAMP1	P23763	118 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KPNB1-208	ENST00000580019	MAPKAPK2	P49137	400 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KPNB1-208	ENST00000580019	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
KPNB1-208	ENST00000580019	CSRP2	Q16527	193 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KPNB1-208	ENST00000580019	FAM129B	Q96TA1	746 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KPNB1-208	ENST00000580019	FAN1	Q9Y2M0	1017 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KPNB1-208	ENST00000580019	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KPNB1-208	ENST00000580019	SHISA3	A0PJX4	238 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KPNB1-208	ENST00000580019	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
KPNB1-208	ENST00000580019	CYP4F8	P98187	520 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KPNB1-208	ENST00000580019	NR1I3	Q14994	352 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KPNB1-208	ENST00000580019	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
KPNB1-208	ENST00000580019	ZNF761	Q86XN6	746 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
KPNB1-208	ENST00000580019	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KPNB1-208	ENST00000580019	ZNF536	O15090	1300 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KPNB1-208	ENST00000580019	SOWAHD	A6NJG2	315 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KPNB1-208	ENST00000580019	NDUFB5	O43674	189 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KPNB1-208	ENST00000580019	ABL1	P00519	1130 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KPNB1-208	ENST00000580019	PGR	P06401	933 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KPNB1-208	ENST00000580019	KIR3DS1	Q14943	382 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KPNB1-208	ENST00000580019	HSF5	Q4G112	596 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
KPNB1-208	ENST00000580019	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KPNB1-208	ENST00000580019	CEP89	Q96ST8	783 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KPNB1-208	ENST00000580019	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KPNB1-208	ENST00000580019	DLL4	Q9NR61	685 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KPNB1-208	ENST00000580019	TNFRSF10D	Q9UBN6	386 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KPNB1-208	ENST00000580019	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
KPNB1-208	ENST00000580019	SSU72P8	A0A1W2PR75	194 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KPNB1-208	ENST00000580019	TMEM82	A0PJX8	343 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KPNB1-208	ENST00000580019	ATF2	P15336	505 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KPNB1-208	ENST00000580019	PRKCA	P17252	672 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KPNB1-208	ENST00000580019	SSFA2	P28290	1259 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KPNB1-208	ENST00000580019	CDK8	P49336	464 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KPNB1-208	ENST00000580019	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KPNB1-208	ENST00000580019	PI16	Q6UXB8	463 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KPNB1-208	ENST00000580019	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KPNB1-208	ENST00000580019	LGI4	Q8N135	537 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KPNB1-208	ENST00000580019	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		4.52	□□□□□ -1.69

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