RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578093.1

PTPRM-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 3

Gene PTPRM, Length 464 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-206	ENST00000578093	CYP2C8	P10632	490 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	CCL5	P13501	91 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	PSMC4	P43686	418 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	PRKCZ	Q05513	592 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	PPIL2	Q13356	520 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	SNAPC2	Q13487	334 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	LRRC24	Q50LG9	513 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	C6orf118	Q5T5N4	469 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	NBPF11	Q86T75	865 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	ERO1B	Q86YB8	467 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	RETREG2	Q8NC44	543 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	POLM	Q9NP87	494 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	SRRD	Q9UH36	339 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	ZMIZ1	Q9ULJ6	1067 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	PDHX	O00330	501 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	DLL1	O00548	723 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	VAMP4	O75379	141 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	FARP2	O94887	1054 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	PROC	P04070	461 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	BCR	P11274	1271 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	CETP	P11597	493 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	ELN	P15502	786 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	GRK4	P32298	578 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	GPC1	P35052	558 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	GJA8	P48165	433 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	TNNI2	P48788	182 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	SMTN	P53814	917 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	NFIA	Q12857	509 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	UBE4A	Q14139	1066 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	TLR1	Q15399	786 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	CCDC27	Q2M243	656 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	TMEM164	Q5U3C3	297 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	FAM83A	Q86UY5	434 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	KDF1	Q8NAX2	398 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	DPF3	Q92784	378 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	IL16	Q14005	1332 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	LTBP2	Q14767	1821 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093		A6NJY4	79 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	DKK1	O94907	266 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	IL2RA	P01589	272 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	GJB1	P08034	283 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	PRDX5	P30044	214 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	RNF144A	P50876	292 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	PRMT2	P55345	433 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	CENPC	Q03188	943 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	PPAT	Q06203	517 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	TCP10	Q12799	353 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	KIF22	Q14807	665 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	TMEM214	Q6NUQ4	689 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	KANK3	Q6NY19	840 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093		Q7L0L9	218 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	RAET1E	Q8TD07	263 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	STK32A	Q8WU08	396 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	TEKT1	Q969V4	418 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	INSM2	Q96T92	566 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	RNF208	Q9H0X6	261 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-206	ENST00000578093	TTLL8	A6PVC2	850 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	CDK2AP1	O14519	115 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	STAU1	O95793	577 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	BMP1	P13497	986 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	FGFR2	P21802	821 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	FLT3LG	P49771	235 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	ARHGEF6	Q15052	776 aa		4.96	□□□□□ -1.62

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