RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564123.6

BBS2-208, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 2, human

TSL 3

Gene BBS2, Length 395 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS2-208	ENST00000564123	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
BBS2-208	ENST00000564123	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BBS2-208	ENST00000564123	SUCO	Q9UBS9	1254 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
BBS2-208	ENST00000564123	WASH4P	A8MWX3	477 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-208	ENST00000564123		C9IYK1	514 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-208	ENST00000564123	LRRN2	O75325	713 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-208	ENST00000564123	RNF4	P78317	190 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-208	ENST00000564123	SLC7A5	Q01650	507 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-208	ENST00000564123	SFRP5	Q5T4F7	317 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-208	ENST00000564123	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-208	ENST00000564123	KIAA1211L	Q6NV74	962 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-208	ENST00000564123	LILRA6	Q6PI73	481 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-208	ENST00000564123	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-208	ENST00000564123	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-208	ENST00000564123	SRPK1	Q96SB4	655 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-208	ENST00000564123	PIF1	Q9H611	641 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-208	ENST00000564123	NSUN3	Q9H649	340 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-208	ENST00000564123	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-208	ENST00000564123	ZNF214	Q9UL59	606 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-208	ENST00000564123	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	TSPAN15	O95858	294 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	CYP7A1	P22680	504 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	ERVFC1	P60507	584 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	BBS9	Q3SYG4	887 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	DCAF15	Q66K64	600 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	MRM1	Q6IN84	353 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	BHLHE22	Q8NFJ8	381 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	RNF141	Q8WVD5	230 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	KLHL6	Q8WZ60	621 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	DEPDC7	Q96QD5	511 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	SNTG2	Q9NY99	539 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	CLCN7	P51798	805 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	RASA3	Q14644	834 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	NCAPH	Q15003	741 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	UBE2F	Q969M7	185 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	MRFAP1L1	Q96HT8	127 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	HAUS7	Q99871	368 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	ASPN	Q9BXN1	380 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	KRTAP4-5	Q9BYR2	181 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	FBXL21	Q9UKT6	434 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	FAM221B	A6H8Z2	402 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	NFIB	O00712	420 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	EPHX1	P07099	455 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	GDNF	P39905	211 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	NFE2L2	Q16236	605 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	RALGPS1	Q5JS13	557 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	HEATR6	Q6AI08	1181 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	MFSD4A	Q8N468	514 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	PPP1R14A	Q96A00	147 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123		Q96M66	194 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	FGD4	Q96M96	766 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	MSRB2	Q9Y3D2	182 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	PCDHB12	Q9Y5F1	795 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	ST14	Q9Y5Y6	855 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	PDPK1	O15530	556 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	CBFA2T2	O43439	604 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	SUSD5	O60279	629 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	TRHR	P34981	398 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	BUD31	P41223	144 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	MTERF2	Q49AM1	385 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	ATG14	Q6ZNE5	492 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	ADAT2	Q7Z6V5	191 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	DTWD2	Q8NBA8	298 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	FBXO15	Q8NCQ5	510 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	ADCY4	Q8NFM4	1077 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	MKL1	Q969V6	931 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	VWCE	Q96DN2	955 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	GFOD1	Q9NXC2	390 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	SLAMF8	Q9P0V8	285 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	PFDN2	Q9UHV9	154 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	CAPN6	Q9Y6Q1	641 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123		B8ZZF3	427 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	ETV2	O00321	342 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	MEIS1	O00470	390 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	PRRG2	O14669	202 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	SHOX	O15266	292 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	TMEM253	P0C7T8	217 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	KIR3DL1	P43629	444 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	HK2	P52789	917 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	RASGRF1	Q13972	1273 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	TCEAL1	Q15170	157 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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