RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558982.5

MIR9-3HG-206, Transcript of MIR9-3 host gene, humanhuman

TSL 4

Gene MIR9-3HG, Length 569 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIR9-3HG-206ENST00000558982 FEM1BQ9UK73 627 aa22.25■■□□□ 1.15
MIR9-3HG-206ENST00000558982 RIPK3Q9Y572 518 aa22.25■■□□□ 1.15
MIR9-3HG-206ENST00000558982 HIP1O00291 1037 aa22.24■■□□□ 1.15
MIR9-3HG-206ENST00000558982 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
MIR9-3HG-206ENST00000558982 KIFC2Q96AC6 838 aa22.24■■□□□ 1.15
MIR9-3HG-206ENST00000558982 CHMP4CQ96CF2 233 aa22.24■■□□□ 1.15
MIR9-3HG-206ENST00000558982 GMCL1Q96IK5 515 aa22.24■■□□□ 1.15
MIR9-3HG-206ENST00000558982 TEX13BQ9BXU2 312 aa22.24■■□□□ 1.15
MIR9-3HG-206ENST00000558982 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa22.24■■□□□ 1.15
MIR9-3HG-206ENST00000558982 CEP290O15078 2479 aa22.23■■□□□ 1.15
MIR9-3HG-206ENST00000558982 ATP2A1O14983 1001 aa22.23■■□□□ 1.15
MIR9-3HG-206ENST00000558982 CYBAP13498 195 aa22.23■■□□□ 1.15
MIR9-3HG-206ENST00000558982 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa22.23■■□□□ 1.15
MIR9-3HG-206ENST00000558982 AKNAD1Q5T1N1 836 aa22.23■■□□□ 1.15
MIR9-3HG-206ENST00000558982 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
MIR9-3HG-206ENST00000558982 STAG1Q8WVM7 1258 aa22.23■■□□□ 1.15
MIR9-3HG-206ENST00000558982 DPF3Q92784 378 aa22.23■■□□□ 1.15
MIR9-3HG-206ENST00000558982 MAML3Q96JK9 1138 aa22.23■■□□□ 1.15
MIR9-3HG-206ENST00000558982 MMP19Q99542 508 aa22.23■■□□□ 1.15
MIR9-3HG-206ENST00000558982 HTATIP2Q9BUP3 242 aa22.23■■□□□ 1.15
MIR9-3HG-206ENST00000558982 TOMM22Q9NS69 142 aa22.23■■□□□ 1.15
MIR9-3HG-206ENST00000558982 TMEM232C9JQI7 657 aa22.22■■□□□ 1.15
MIR9-3HG-206ENST00000558982 H0YGN5 161 aa22.22■■□□□ 1.15
MIR9-3HG-206ENST00000558982 PGK2P07205 417 aa22.22■■□□□ 1.15
MIR9-3HG-206ENST00000558982 MCCP23508 829 aa22.22■■□□□ 1.15
MIR9-3HG-206ENST00000558982 NECAB2Q7Z6G3 386 aa22.22■■□□□ 1.15
MIR9-3HG-206ENST00000558982 CPXCR1Q8N123 301 aa22.22■■□□□ 1.15
MIR9-3HG-206ENST00000558982 ZBED4O75132 1171 aa22.21■■□□□ 1.15
MIR9-3HG-206ENST00000558982 COPB2P35606 906 aa22.21■■□□□ 1.15
MIR9-3HG-206ENST00000558982 SLC1A4P43007 532 aa22.21■■□□□ 1.15
MIR9-3HG-206ENST00000558982 STAT2P52630 851 aa22.21■■□□□ 1.15
MIR9-3HG-206ENST00000558982 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
MIR9-3HG-206ENST00000558982 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa22.21■■□□□ 1.15
MIR9-3HG-206ENST00000558982 SLC5A4Q9NY91 659 aa22.21■■□□□ 1.15
MIR9-3HG-206ENST00000558982 NEDD4P46934 1319 aa22.21■■□□□ 1.15
MIR9-3HG-206ENST00000558982 KCTD2Q14681 263 aa22.2■■□□□ 1.14
MIR9-3HG-206ENST00000558982 ZNF792Q3KQV3 632 aa22.2■■□□□ 1.14
MIR9-3HG-206ENST00000558982 MFSD6Q6ZSS7 791 aa22.2■■□□□ 1.14
MIR9-3HG-206ENST00000558982 KCTD1Q719H9 257 aa22.2■■□□□ 1.14
MIR9-3HG-206ENST00000558982 DSCC1Q9BVC3 393 aa22.2■■□□□ 1.14
MIR9-3HG-206ENST00000558982 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
MIR9-3HG-206ENST00000558982 DNAH12Q6ZR08 3092 aa22.2■■□□□ 1.14
MIR9-3HG-206ENST00000558982 ZNF213O14771 459 aa22.19■■□□□ 1.14
MIR9-3HG-206ENST00000558982 PLA2G6O60733 806 aa22.19■■□□□ 1.14
MIR9-3HG-206ENST00000558982 PCP11498 1178 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
MIR9-3HG-206ENST00000558982 RCSD1Q6JBY9 416 aa22.19■■□□□ 1.14
MIR9-3HG-206ENST00000558982 TMEM47Q9BQJ4 181 aa22.19■■□□□ 1.14
MIR9-3HG-206ENST00000558982 SMCHD1A6NHR9 2005 aa22.19■■□□□ 1.14
MIR9-3HG-206ENST00000558982 PFASO15067 1338 aa22.18■■□□□ 1.14
MIR9-3HG-206ENST00000558982 ZNF536O15090 1300 aa22.18■■□□□ 1.14
MIR9-3HG-206ENST00000558982 CNGA1P29973 690 aa22.18■■□□□ 1.14
MIR9-3HG-206ENST00000558982 SLC4A3P48751 1232 aa22.18■■□□□ 1.14
MIR9-3HG-206ENST00000558982 OAZ1P54368 228 aa22.18■■□□□ 1.14
MIR9-3HG-206ENST00000558982 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa22.18■■□□□ 1.14
MIR9-3HG-206ENST00000558982 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP22.18■■□□□ 1.14
MIR9-3HG-206ENST00000558982 FAM160B2Q86V87 743 aa22.18■■□□□ 1.14
MIR9-3HG-206ENST00000558982 CHURC1Q8WUH1 139 aa22.18■■□□□ 1.14
MIR9-3HG-206ENST00000558982 C11orf49Q9H6J7 331 aa22.18■■□□□ 1.14
MIR9-3HG-206ENST00000558982 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
MIR9-3HG-206ENST00000558982 MTMR7Q9Y216 660 aa22.18■■□□□ 1.14
MIR9-3HG-206ENST00000558982 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
MIR9-3HG-206ENST00000558982 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa22.17■■□□□ 1.14
MIR9-3HG-206ENST00000558982 FDX1P10109 184 aa22.17■■□□□ 1.14
MIR9-3HG-206ENST00000558982 TOP1P11387 765 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
MIR9-3HG-206ENST00000558982 COL6A1P12109 1028 aa22.17■■□□□ 1.14
MIR9-3HG-206ENST00000558982 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
MIR9-3HG-206ENST00000558982 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
MIR9-3HG-206ENST00000558982 MSCO60682 206 aa22.16■■□□□ 1.14
MIR9-3HG-206ENST00000558982 DCAF4Q8WV16 495 aa22.16■■□□□ 1.14
MIR9-3HG-206ENST00000558982 TINF2Q9BSI4 451 aa22.16■■□□□ 1.14
MIR9-3HG-206ENST00000558982 PRR12Q9ULL5 1215 aa22.16■■□□□ 1.14
MIR9-3HG-206ENST00000558982 MCM3APO60318 1980 aa22.16■■□□□ 1.14
MIR9-3HG-206ENST00000558982 SEPT4O43236 478 aa22.15■■□□□ 1.14
MIR9-3HG-206ENST00000558982 CHMLP26374 656 aa22.15■■□□□ 1.14
MIR9-3HG-206ENST00000558982 SNAP25P60880 206 aa22.15■■□□□ 1.14
MIR9-3HG-206ENST00000558982 IKQ13123 557 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
MIR9-3HG-206ENST00000558982 ANO1Q5XXA6 986 aa22.15■■□□□ 1.14
MIR9-3HG-206ENST00000558982 TTBK2Q6IQ55 1244 aa22.15■■□□□ 1.14
MIR9-3HG-206ENST00000558982 ESR2Q92731 530 aa22.15■■□□□ 1.14
MIR9-3HG-206ENST00000558982 AGBL1Q96MI9 1066 aa22.15■■□□□ 1.14
MIR9-3HG-206ENST00000558982 TTC14Q96N46 770 aa22.15■■□□□ 1.14
MIR9-3HG-206ENST00000558982 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa22.15■■□□□ 1.14
MIR9-3HG-206ENST00000558982 EVI5O60447 810 aa22.14■■□□□ 1.13
MIR9-3HG-206ENST00000558982 CCDC96Q2M329 555 aa22.14■■□□□ 1.13
MIR9-3HG-206ENST00000558982 CHST13Q8NET6 341 aa22.14■■□□□ 1.13
MIR9-3HG-206ENST00000558982 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
MIR9-3HG-206ENST00000558982 NR2E3Q9Y5X4 410 aa22.14■■□□□ 1.13
MIR9-3HG-206ENST00000558982 RAD50Q92878 1312 aa22.13■■□□□ 1.13
MIR9-3HG-206ENST00000558982 KDM4AO75164 1064 aa22.13■■□□□ 1.13
MIR9-3HG-206ENST00000558982 PDHBP11177 359 aa22.13■■□□□ 1.13
MIR9-3HG-206ENST00000558982 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
MIR9-3HG-206ENST00000558982 SLC16A2P36021 539 aa22.13■■□□□ 1.13
MIR9-3HG-206ENST00000558982 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
MIR9-3HG-206ENST00000558982 BTNL9Q6UXG8 535 aa22.13■■□□□ 1.13
MIR9-3HG-206ENST00000558982 DDX11Q96FC9 970 aa22.13■■□□□ 1.13
MIR9-3HG-206ENST00000558982 FGD4Q96M96 766 aa22.13■■□□□ 1.13
MIR9-3HG-206ENST00000558982 HOMER2Q9NSB8 354 aa22.13■■□□□ 1.13
MIR9-3HG-206ENST00000558982 LCTP09848 1927 aa22.13■■□□□ 1.13
MIR9-3HG-206ENST00000558982 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
MIR9-3HG-206ENST00000558982 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms