RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550672.5

SLC8B1-211, Transcript of solute carrier family 8 member B1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SLC8B1, Length 2,925 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8B1-211ENST00000550672 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa14.68□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 TDO2P48775 406 aa14.68□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 AMPD2Q01433 879 aa14.68□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 CTDSPL2Q05D32 466 aa14.68□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 TUBB2AQ13885 445 aa14.68□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 CLEC4GQ6UXB4 293 aa14.68□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP14.68□□□□□ -0.061e-6■■□□□ 13.8
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SLC8B1-211ENST00000550672 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
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SLC8B1-211ENST00000550672 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa14.68□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 SETQ01105 290 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 C2orf54Q08AI8 447 aa14.67□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 SEMA3FQ13275 785 aa14.67□□□□□ -0.06
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SLC8B1-211ENST00000550672 ABHD10Q9NUJ1 306 aa14.67□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 ABCF2Q9UG63 623 aa14.67□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 SAR1BQ9Y6B6 198 aa14.67□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 NDUFAB1O14561 156 aa14.67□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 GNPATO15228 680 aa14.67□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 GUCY1A2P33402 732 aa14.67□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 TUBB4BP68371 445 aa14.67□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 NR5A1Q13285 461 aa14.67□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 PDCLQ13371 301 aa14.67□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 GBP6Q6ZN66 633 aa14.67□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa14.67□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 VIPAS39Q9H9C1 493 aa14.67□□□□□ -0.06
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SLC8B1-211ENST00000550672 LRP2BPQ9P2M1 347 aa14.67□□□□□ -0.06
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SLC8B1-211ENST00000550672 SPATA1Q5VX52 437 aa14.66□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 TMTC1Q8IUR5 882 aa14.66□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 IFNL3Q8IZI9 196 aa14.66□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 LCORLQ8N3X6 602 aa14.66□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 CEP120Q8N960 986 aa14.66□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 JADE2Q9NQC1 790 aa14.66□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 CTNND2Q9UQB3 1225 aa14.66□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 TACC3Q9Y6A5 838 aa14.66□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 ATRNO75882 1429 aa14.66□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 TUBBP07437 444 aa14.66□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 USP8P40818 1118 aa14.66□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 CYP26C1Q6V0L0 522 aa14.66□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 FBXL16Q8N461 479 aa14.66□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 EPSTI1Q96J88 318 aa14.66□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 PSMB7Q99436 277 aa14.66□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 CSRNP2Q9H175 543 aa14.66□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 SARSP49591 514 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 SLC7A5Q01650 507 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 ADGRA1Q86SQ6 560 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 SH2D3CQ8N5H7 860 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 OTUD6BQ8N6M0 293 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 HDAC7Q8WUI4 952 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
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SLC8B1-211ENST00000550672 GOLGA8AA7E2F4 631 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 KIAA0754O94854 1291 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 SCP2P22307 547 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 PPARAQ07869 468 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 GPIHBP1Q8IV16 184 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 NOSTRINQ8IVI9 506 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 JAKMIP2Q96AA8 810 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 NAPBQ9H115 298 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 ARAP2Q8WZ64 1704 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC8B1-211ENST00000550672 ZMYM6O95789 1325 aa14.65□□□□□ -0.06
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SLC8B1-211ENST00000550672 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa14.64□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 MACROD2A1Z1Q3 448 aa14.64□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 SMIM22K7EJ46 135 aa14.64□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 CDKL5O76039 1030 aa14.64□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 KLRK1P26718 216 aa14.64□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 KRT31Q15323 416 aa14.64□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa14.64□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 RTL9Q8NET4 1388 aa14.64□□□□□ -0.07
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