RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546935.5

CSRNP2-202, Transcript of cysteine and serine rich nuclear protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene CSRNP2, Length 681 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP2-202ENST00000546935 ALG1Q9BT22 464 aa25.3■■□□□ 1.64
CSRNP2-202ENST00000546935 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa25.3■■□□□ 1.64
CSRNP2-202ENST00000546935 MTMR7Q9Y216 660 aa25.3■■□□□ 1.64
CSRNP2-202ENST00000546935 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa25.29■■□□□ 1.64
CSRNP2-202ENST00000546935 SLC1A4P43007 532 aa25.29■■□□□ 1.64
CSRNP2-202ENST00000546935 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
CSRNP2-202ENST00000546935 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa25.29■■□□□ 1.64
CSRNP2-202ENST00000546935 C8orf76Q96K31 380 aa25.29■■□□□ 1.64
CSRNP2-202ENST00000546935 AS3MTQ9HBK9 375 aa25.29■■□□□ 1.64
CSRNP2-202ENST00000546935 PICK1Q9NRD5 415 aa25.29■■□□□ 1.64
CSRNP2-202ENST00000546935 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa25.29■■□□□ 1.64
CSRNP2-202ENST00000546935 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
CSRNP2-202ENST00000546935 CLEC17AQ6ZS10 378 aa25.28■■□□□ 1.64
CSRNP2-202ENST00000546935 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
CSRNP2-202ENST00000546935 AIFM3Q96NN9 605 aa25.28■■□□□ 1.64
CSRNP2-202ENST00000546935 CSADQ9Y600 493 aa25.28■■□□□ 1.64
CSRNP2-202ENST00000546935 V9GY48 417 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
CSRNP2-202ENST00000546935 BMP3P12645 472 aa25.27■■□□□ 1.64
CSRNP2-202ENST00000546935 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
CSRNP2-202ENST00000546935 CCDC96Q2M329 555 aa25.27■■□□□ 1.64
CSRNP2-202ENST00000546935 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa25.27■■□□□ 1.64
CSRNP2-202ENST00000546935 BTNL9Q6UXG8 535 aa25.27■■□□□ 1.64
CSRNP2-202ENST00000546935 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
CSRNP2-202ENST00000546935 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
CSRNP2-202ENST00000546935 F13A1P00488 732 aa25.26■■□□□ 1.63
CSRNP2-202ENST00000546935 VGLL4Q14135 290 aa25.26■■□□□ 1.63
CSRNP2-202ENST00000546935 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
CSRNP2-202ENST00000546935 ZNF280CQ8ND82 737 aa25.26■■□□□ 1.63
CSRNP2-202ENST00000546935 LPAR1Q92633 364 aa25.26■■□□□ 1.63
CSRNP2-202ENST00000546935 MTMR8Q96EF0 704 aa25.26■■□□□ 1.63
CSRNP2-202ENST00000546935 GPCPD1Q9NPB8 672 aa25.26■■□□□ 1.63
CSRNP2-202ENST00000546935 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
CSRNP2-202ENST00000546935 USP17L10C9JJH3 530 aa25.25■■□□□ 1.63
CSRNP2-202ENST00000546935 H3BQV1 296 aa25.25■■□□□ 1.63
CSRNP2-202ENST00000546935 PLA2G6O60733 806 aa25.25■■□□□ 1.63
CSRNP2-202ENST00000546935 SCG2P13521 617 aa25.25■■□□□ 1.63
CSRNP2-202ENST00000546935 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
CSRNP2-202ENST00000546935 TTBK2Q6IQ55 1244 aa25.25■■□□□ 1.63
CSRNP2-202ENST00000546935 KCTD1Q719H9 257 aa25.25■■□□□ 1.63
CSRNP2-202ENST00000546935 USP14P54578 494 aa25.24■■□□□ 1.63
CSRNP2-202ENST00000546935 KRT40Q6A162 431 aa25.24■■□□□ 1.63
CSRNP2-202ENST00000546935 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa25.24■■□□□ 1.63
CSRNP2-202ENST00000546935 OPTNQ96CV9 577 aa25.24■■□□□ 1.63
CSRNP2-202ENST00000546935 C12orf42Q96LP6 360 aa25.24■■□□□ 1.63
CSRNP2-202ENST00000546935 FEZ1Q99689 392 aa25.24■■□□□ 1.63
CSRNP2-202ENST00000546935 UBA5Q9GZZ9 404 aa25.24■■□□□ 1.63
CSRNP2-202ENST00000546935 CPVLQ9H3G5 476 aa25.24■■□□□ 1.63
CSRNP2-202ENST00000546935 PTPRFP10586 1907 aa25.24■■□□□ 1.63
CSRNP2-202ENST00000546935 MYH15Q9Y2K3 1946 aa25.24■■□□□ 1.63
CSRNP2-202ENST00000546935 SPDYE5A6NIY4 337 aa25.23■■□□□ 1.63
CSRNP2-202ENST00000546935 BACE1P56817 501 aa25.23■■□□□ 1.63
CSRNP2-202ENST00000546935 IFNL1Q8IU54 200 aa25.23■■□□□ 1.63
CSRNP2-202ENST00000546935 SHISA4Q96DD7 197 aa25.23■■□□□ 1.63
CSRNP2-202ENST00000546935 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
CSRNP2-202ENST00000546935 ABHD8Q96I13 439 aa25.23■■□□□ 1.63
CSRNP2-202ENST00000546935 ELP3Q9H9T3 547 aa25.23■■□□□ 1.63
CSRNP2-202ENST00000546935 JMJD4Q9H9V9 463 aa25.23■■□□□ 1.63
CSRNP2-202ENST00000546935 SH3GLB2Q9NR46 395 aa25.23■■□□□ 1.63
CSRNP2-202ENST00000546935 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa25.23■■□□□ 1.63
CSRNP2-202ENST00000546935 C19orf81C9J6K1 198 aa25.22■■□□□ 1.63
CSRNP2-202ENST00000546935 WDR46O15213 610 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
CSRNP2-202ENST00000546935 GJA5P36382 358 aa25.22■■□□□ 1.63
CSRNP2-202ENST00000546935 SPP2Q13103 211 aa25.22■■□□□ 1.63
CSRNP2-202ENST00000546935 RESTQ13127 1097 aa25.22■■□□□ 1.63
CSRNP2-202ENST00000546935 ERO1BQ86YB8 467 aa25.22■■□□□ 1.63
CSRNP2-202ENST00000546935 ADGRF4Q8IZF3 695 aa25.22■■□□□ 1.63
CSRNP2-202ENST00000546935 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
CSRNP2-202ENST00000546935 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
CSRNP2-202ENST00000546935 GJB4Q9NTQ9 266 aa25.22■■□□□ 1.63
CSRNP2-202ENST00000546935 ZHX2Q9Y6X8 837 aa25.22■■□□□ 1.63
CSRNP2-202ENST00000546935 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
CSRNP2-202ENST00000546935 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa25.21■■□□□ 1.63
CSRNP2-202ENST00000546935 hCG_1984214I3L0E3 225 aa25.21■■□□□ 1.63
CSRNP2-202ENST00000546935 XBP1P17861 261 aa25.21■■□□□ 1.63
CSRNP2-202ENST00000546935 GTF2A2P52657 109 aa25.21■■□□□ 1.63
CSRNP2-202ENST00000546935 FOSBP53539 338 aa25.21■■□□□ 1.63
CSRNP2-202ENST00000546935 MTMR2Q13614 643 aa25.21■■□□□ 1.63
CSRNP2-202ENST00000546935 TRIM29Q14134 588 aa25.21■■□□□ 1.63
CSRNP2-202ENST00000546935 SH3D19Q5HYK7 790 aa25.21■■□□□ 1.63
CSRNP2-202ENST00000546935 SPICE1Q8N0Z3 855 aa25.21■■□□□ 1.63
CSRNP2-202ENST00000546935 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
CSRNP2-202ENST00000546935 EMILIN3Q9NT22 766 aa25.21■■□□□ 1.63
CSRNP2-202ENST00000546935 PARP14Q460N5 1801 aa25.21■■□□□ 1.63
CSRNP2-202ENST00000546935 LOC285556D6RIA3 1793 aa25.21■■□□□ 1.63
CSRNP2-202ENST00000546935 TMEM232C9JQI7 657 aa25.2■■□□□ 1.62
CSRNP2-202ENST00000546935 RAD21O60216 631 aa25.2■■□□□ 1.62
CSRNP2-202ENST00000546935 MMP1P03956 469 aa25.2■■□□□ 1.62
CSRNP2-202ENST00000546935 PPATQ06203 517 aa25.2■■□□□ 1.62
CSRNP2-202ENST00000546935 FAM83BQ5T0W9 1011 aa25.2■■□□□ 1.62
CSRNP2-202ENST00000546935 PIGSQ96S52 555 aa25.2■■□□□ 1.62
CSRNP2-202ENST00000546935 PHF20Q9BVI0 1012 aa25.2■■□□□ 1.62
CSRNP2-202ENST00000546935 MCOLN1Q9GZU1 580 aa25.2■■□□□ 1.62
CSRNP2-202ENST00000546935 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa25.2■■□□□ 1.62
CSRNP2-202ENST00000546935 SLC16A2P36021 539 aa25.19■■□□□ 1.62
CSRNP2-202ENST00000546935 STAT2P52630 851 aa25.19■■□□□ 1.62
CSRNP2-202ENST00000546935 GUCY1B3Q02153 619 aa25.19■■□□□ 1.62
CSRNP2-202ENST00000546935 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
CSRNP2-202ENST00000546935 SYDE2Q5VT97 1194 aa25.19■■□□□ 1.62
CSRNP2-202ENST00000546935 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
CSRNP2-202ENST00000546935 FAM160B2Q86V87 743 aa25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms