RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540101.2

C16orf62-211, Transcript of UPF0505 protein C16orf62, humanhuman

TSL 3

Gene C16orf62, Length 461 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf62-211ENST00000540101 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 MTMR8Q96EF0 704 aa9.11□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 SLC10A4Q96EP9 437 aa9.11□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 SPZ1Q9BXG8 430 aa9.11□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 CPVLQ9H3G5 476 aa9.11□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 RIOX1Q9H6W3 641 aa9.11□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 GOPCQ9HD26 462 aa9.11□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 HTTP42858 3142 aa9.11□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa9.1□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 PTPDC1A2A3K4 754 aa9.1□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 SNAPC2Q13487 334 aa9.1□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 PKN1Q16512 942 aa9.1□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 TREML2Q5T2D2 321 aa9.1□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa9.1□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 KCTD1Q719H9 257 aa9.1□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 BRI3BPQ8WY22 251 aa9.1□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 SHISA4Q96DD7 197 aa9.1□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 CFHR5Q9BXR6 569 aa9.1□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 FBXO28Q9NVF7 368 aa9.1□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa9.1□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 PHIPQ8WWQ0 1821 aa9.1□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 STK36Q9NRP7 1315 aa9.09□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa9.09□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 TMEM232C9JQI7 657 aa9.09□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP9.09□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 FKTNO75072 461 aa9.09□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 SLC16A2P36021 539 aa9.09□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 SLC4A3P48751 1232 aa9.09□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 GNAQP50148 359 aa9.09□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 BECN1Q14457 450 aa9.09□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 CCDC96Q2M329 555 aa9.09□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 IFNL1Q8IU54 200 aa9.09□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 PHKBQ93100 1093 aa9.09□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 CHMP4CQ96CF2 233 aa9.09□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 PTPN18Q99952 460 aa9.09□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 LZTS2Q9BRK4 669 aa9.09□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 UBA5Q9GZZ9 404 aa9.09□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 JMJD4Q9H9V9 463 aa9.09□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 GPCPD1Q9NPB8 672 aa9.09□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 PRR12Q9ULL5 1215 aa9.09□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa9.09□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 MTMR7Q9Y216 660 aa9.09□□□□□ -0.95
C16orf62-211ENST00000540101 MYPNQ86TC9 1320 aa9.08□□□□□ -0.96
C16orf62-211ENST00000540101 ATAD5Q96QE3 1844 aa9.08□□□□□ -0.96
C16orf62-211ENST00000540101 CENPFP49454 3210 aa9.08□□□□□ -0.96
C16orf62-211ENST00000540101 BTBD19C9JJ37 291 aa9.08□□□□□ -0.96
C16orf62-211ENST00000540101 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
C16orf62-211ENST00000540101 PPFIA3O75145 1194 aa9.08□□□□□ -0.96
C16orf62-211ENST00000540101 CETPP11597 493 aa9.08□□□□□ -0.96
C16orf62-211ENST00000540101 STAT2P52630 851 aa9.08□□□□□ -0.96
C16orf62-211ENST00000540101 GTF2A2P52657 109 aa9.08□□□□□ -0.96
C16orf62-211ENST00000540101 SYDE2Q5VT97 1194 aa9.08□□□□□ -0.96
C16orf62-211ENST00000540101 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
C16orf62-211ENST00000540101 LBX2Q6XYB7 198 aa9.08□□□□□ -0.96
C16orf62-211ENST00000540101 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa9.08□□□□□ -0.96
C16orf62-211ENST00000540101 ADGRF4Q8IZF3 695 aa9.08□□□□□ -0.96
C16orf62-211ENST00000540101 REPS2Q8NFH8 660 aa9.08□□□□□ -0.96
C16orf62-211ENST00000540101 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
C16orf62-211ENST00000540101 TMOD4Q9NZQ9 345 aa9.08□□□□□ -0.96
C16orf62-211ENST00000540101 FEM1BQ9UK73 627 aa9.08□□□□□ -0.96
C16orf62-211ENST00000540101 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa9.08□□□□□ -0.96
C16orf62-211ENST00000540101 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa9.08□□□□□ -0.96
C16orf62-211ENST00000540101 LOC285556D6RIA3 1793 aa9.08□□□□□ -0.96
C16orf62-211ENST00000540101 BRCA2P51587 3418 aa9.08□□□□□ -0.96
C16orf62-211ENST00000540101 ZNF536O15090 1300 aa9.07□□□□□ -0.96
C16orf62-211ENST00000540101 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
C16orf62-211ENST00000540101 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa9.07□□□□□ -0.96
C16orf62-211ENST00000540101 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
C16orf62-211ENST00000540101 USP17L15C9J2P7 530 aa9.07□□□□□ -0.96
C16orf62-211ENST00000540101 USP17L13C9JLJ4 530 aa9.07□□□□□ -0.96
C16orf62-211ENST00000540101 USP17L11C9JVI0 530 aa9.07□□□□□ -0.96
C16orf62-211ENST00000540101 USP17L18D6R9N7 530 aa9.07□□□□□ -0.96
C16orf62-211ENST00000540101 USP17L22D6RA61 530 aa9.07□□□□□ -0.96
C16orf62-211ENST00000540101 USP17L17D6RBQ6 530 aa9.07□□□□□ -0.96
C16orf62-211ENST00000540101 USP17L19D6RCP7 530 aa9.07□□□□□ -0.96
C16orf62-211ENST00000540101 USP17L20D6RJB6 530 aa9.07□□□□□ -0.96
C16orf62-211ENST00000540101 CPLX1O14810 134 aa9.07□□□□□ -0.96
C16orf62-211ENST00000540101 CDKL5O76039 1030 aa9.07□□□□□ -0.96
C16orf62-211ENST00000540101 ALDH1A1P00352 501 aa9.07□□□□□ -0.96
C16orf62-211ENST00000540101 DSG3P32926 999 aa9.07□□□□□ -0.96
C16orf62-211ENST00000540101 INHBEP58166 350 aa9.07□□□□□ -0.96
C16orf62-211ENST00000540101 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
C16orf62-211ENST00000540101 USP17L24Q0WX57 530 aa9.07□□□□□ -0.96
C16orf62-211ENST00000540101 CCL15Q16663 113 aa9.07□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms