RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522344.1

CPEB4-210, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene CPEB4, Length 481 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB4-210ENST00000522344 BBS9Q3SYG4 887 aa6.94□□□□□ -1.3
CPEB4-210ENST00000522344 ZPBP2Q6X784 338 aa6.94□□□□□ -1.3
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
CPEB4-210ENST00000522344 MRVI1Q9Y6F6 885 aa6.94□□□□□ -1.3
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa6.93□□□□□ -1.3
CPEB4-210ENST00000522344 SHOXO15266 292 aa6.93□□□□□ -1.3
CPEB4-210ENST00000522344 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP6.93□□□□□ -1.3
CPEB4-210ENST00000522344 CRTC3Q6UUV7 619 aa6.93□□□□□ -1.3
CPEB4-210ENST00000522344 LINC00116Q8NCU8 138 aa6.93□□□□□ -1.3
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CPEB4-210ENST00000522344 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa6.93□□□□□ -1.3
CPEB4-210ENST00000522344 FITM1A5D6W6 292 aa6.92□□□□□ -1.3
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CPEB4-210ENST00000522344 CD247P20963 164 aa6.92□□□□□ -1.3
CPEB4-210ENST00000522344 CTSKP43235 329 aa6.92□□□□□ -1.3
CPEB4-210ENST00000522344 TCEAL1Q15170 157 aa6.92□□□□□ -1.3
CPEB4-210ENST00000522344 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CPEB4-210ENST00000522344 SPPL2CQ8IUH8 684 aa6.92□□□□□ -1.3
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CPEB4-210ENST00000522344 CDADC1Q9BWV3 514 aa6.92□□□□□ -1.3
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CPEB4-210ENST00000522344 GPR160Q9UJ42 338 aa6.92□□□□□ -1.3
CPEB4-210ENST00000522344 STRIP2Q9ULQ0 834 aa6.92□□□□□ -1.3
CPEB4-210ENST00000522344 TMEM82A0PJX8 343 aa6.91□□□□□ -1.3
CPEB4-210ENST00000522344 H0Y8X5 98 aa6.91□□□□□ -1.3
CPEB4-210ENST00000522344 ITGA4P13612 1032 aa6.91□□□□□ -1.3
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF445P59923 1031 aa6.91□□□□□ -1.3
CPEB4-210ENST00000522344 SLC7A5Q01650 507 aa6.91□□□□□ -1.3
CPEB4-210ENST00000522344 CHRNEQ04844 493 aa6.91□□□□□ -1.3
CPEB4-210ENST00000522344 SLC14A2Q15849 920 aa6.91□□□□□ -1.3
CPEB4-210ENST00000522344 TIGD5Q53EQ6 642 aa6.91□□□□□ -1.3
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
CPEB4-210ENST00000522344 PRR23BQ6ZRT6 265 aa6.91□□□□□ -1.3
CPEB4-210ENST00000522344 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
CPEB4-210ENST00000522344 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
CPEB4-210ENST00000522344 ADCY4Q8NFM4 1077 aa6.91□□□□□ -1.3
CPEB4-210ENST00000522344 DIRC2Q96SL1 478 aa6.91□□□□□ -1.3
CPEB4-210ENST00000522344 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP6.91□□□□□ -1.3
CPEB4-210ENST00000522344 RNF32Q9H0A6 362 aa6.91□□□□□ -1.3
CPEB4-210ENST00000522344 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
CPEB4-210ENST00000522344 FAM53CQ9NYF3 392 aa6.91□□□□□ -1.3
CPEB4-210ENST00000522344 GSNP06396 782 aa6.9□□□□□ -1.3
CPEB4-210ENST00000522344 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
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CPEB4-210ENST00000522344 GALK1P51570 392 aa6.9□□□□□ -1.3
CPEB4-210ENST00000522344 PPP2R5DQ14738 602 aa6.9□□□□□ -1.3
CPEB4-210ENST00000522344 ANKRD39Q53RE8 183 aa6.9□□□□□ -1.3
CPEB4-210ENST00000522344 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
CPEB4-210ENST00000522344 VHLLQ6RSH7 139 aa6.9□□□□□ -1.3
CPEB4-210ENST00000522344 CEP128Q6ZU80 1094 aa6.9□□□□□ -1.3
CPEB4-210ENST00000522344 SIRT2Q8IXJ6 389 aa6.9□□□□□ -1.3
CPEB4-210ENST00000522344 LILRA2Q8N149 483 aa6.9□□□□□ -1.3
CPEB4-210ENST00000522344 FIBCD1Q8N539 461 aa6.9□□□□□ -1.3
CPEB4-210ENST00000522344 LINC01599Q8WXQ3 324 aa6.9□□□□□ -1.3
CPEB4-210ENST00000522344 FGD4Q96M96 766 aa6.9□□□□□ -1.3
CPEB4-210ENST00000522344 HAUS7Q99871 368 aa6.9□□□□□ -1.3
CPEB4-210ENST00000522344 G6PC3Q9BUM1 346 aa6.9□□□□□ -1.3
CPEB4-210ENST00000522344 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.9□□□□□ -1.3
CPEB4-210ENST00000522344 AP5S1Q9NUS5 200 aa6.9□□□□□ -1.3
CPEB4-210ENST00000522344 PRR13Q9NZ81 148 aa6.9□□□□□ -1.3
CPEB4-210ENST00000522344 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CPEB4-210ENST00000522344 CBFA2T2O43439 604 aa6.89□□□□□ -1.31
CPEB4-210ENST00000522344 PSPNO60542 156 aa6.89□□□□□ -1.31
CPEB4-210ENST00000522344 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CPEB4-210ENST00000522344 GSTM1P09488 218 aa6.89□□□□□ -1.31
CPEB4-210ENST00000522344 VAV1P15498 845 aa6.89□□□□□ -1.31
CPEB4-210ENST00000522344 KIAA1211LQ6NV74 962 aa6.89□□□□□ -1.31
CPEB4-210ENST00000522344 MAP6Q96JE9 813 aa6.89□□□□□ -1.31
CPEB4-210ENST00000522344 ZDHHC15Q96MV8 337 aa6.89□□□□□ -1.31
CPEB4-210ENST00000522344 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CPEB4-210ENST00000522344 SP110Q9HB58 689 aa6.89□□□□□ -1.31
CPEB4-210ENST00000522344 FHOD1Q9Y613 1164 aa6.89□□□□□ -1.31
CPEB4-210ENST00000522344 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CPEB4-210ENST00000522344 EPHX1P07099 455 aa6.88□□□□□ -1.31
CPEB4-210ENST00000522344 CASP7P55210 303 aa6.88□□□□□ -1.31
CPEB4-210ENST00000522344 ARID5AQ03989 594 aa6.88□□□□□ -1.31
CPEB4-210ENST00000522344 NAT16Q8N8M0 369 aa6.88□□□□□ -1.31
CPEB4-210ENST00000522344 HHIPL1Q96JK4 782 aa6.88□□□□□ -1.31
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CPEB4-210ENST00000522344 TINF2Q9BSI4 451 aa6.88□□□□□ -1.31
CPEB4-210ENST00000522344 GBP3Q9H0R5 595 aa6.88□□□□□ -1.31
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF281Q9Y2X9 895 aa6.88□□□□□ -1.31
CPEB4-210ENST00000522344 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa6.88□□□□□ -1.31
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF205O95201 554 aa6.87□□□□□ -1.31
CPEB4-210ENST00000522344 CD3EP07766 207 aa6.87□□□□□ -1.31
CPEB4-210ENST00000522344 NR0B2Q15466 257 aa6.87□□□□□ -1.31
CPEB4-210ENST00000522344 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
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CPEB4-210ENST00000522344 POU5F2Q8N7G0 328 aa6.87□□□□□ -1.31
CPEB4-210ENST00000522344 KLHL6Q8WZ60 621 aa6.87□□□□□ -1.31
CPEB4-210ENST00000522344 KCNK12Q9HB15 430 aa6.87□□□□□ -1.31
CPEB4-210ENST00000522344 WHRNQ9P202 907 aa6.87□□□□□ -1.31
CPEB4-210ENST00000522344 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
CPEB4-210ENST00000522344 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
CPEB4-210ENST00000522344 PPM1BO75688 479 aa6.86□□□□□ -1.31
CPEB4-210ENST00000522344 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
CPEB4-210ENST00000522344 PDE6BP35913 854 aa6.86□□□□□ -1.31
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