RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517924.5

LAPTM4B-202, Transcript of lysosomal protein transmembrane 4 beta, humanhuman

TSL 5

Gene LAPTM4B, Length 618 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4B-202ENST00000517924 HTATIP2Q9BUP3 242 aa29.21■■■□□ 2.27
LAPTM4B-202ENST00000517924 IL25Q9H293 177 aa29.21■■■□□ 2.27
LAPTM4B-202ENST00000517924 PGK2P07205 417 aa29.2■■■□□ 2.26
LAPTM4B-202ENST00000517924 BMP3P12645 472 aa29.2■■■□□ 2.26
LAPTM4B-202ENST00000517924 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.26
LAPTM4B-202ENST00000517924 MMP19Q99542 508 aa29.2■■■□□ 2.26
LAPTM4B-202ENST00000517924 FEM1BQ9UK73 627 aa29.2■■■□□ 2.26
LAPTM4B-202ENST00000517924 MCCP23508 829 aa29.19■■■□□ 2.26
LAPTM4B-202ENST00000517924 SLC4A3P48751 1232 aa29.19■■■□□ 2.26
LAPTM4B-202ENST00000517924 TTC22Q5TAA0 569 aa29.19■■■□□ 2.26
LAPTM4B-202ENST00000517924 OLFML2BQ68BL8 750 aa29.19■■■□□ 2.26
LAPTM4B-202ENST00000517924 CPXCR1Q8N123 301 aa29.19■■■□□ 2.26
LAPTM4B-202ENST00000517924 ANKLE1Q8NAG6 615 aa29.19■■■□□ 2.26
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LAPTM4B-202ENST00000517924 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
LAPTM4B-202ENST00000517924 MTMR7Q9Y216 660 aa29.19■■■□□ 2.26
LAPTM4B-202ENST00000517924 TMEM232C9JQI7 657 aa29.18■■■□□ 2.26
LAPTM4B-202ENST00000517924 CYBAP13498 195 aa29.18■■■□□ 2.26
LAPTM4B-202ENST00000517924 CAPN2P17655 700 aa29.18■■■□□ 2.26
LAPTM4B-202ENST00000517924 CNGA1P29973 690 aa29.18■■■□□ 2.26
LAPTM4B-202ENST00000517924 NOVP48745 357 aa29.18■■■□□ 2.26
LAPTM4B-202ENST00000517924 NECAB2Q7Z6G3 386 aa29.18■■■□□ 2.26
LAPTM4B-202ENST00000517924 MAML3Q96JK9 1138 aa29.18■■■□□ 2.26
LAPTM4B-202ENST00000517924 TEX13BQ9BXU2 312 aa29.18■■■□□ 2.26
LAPTM4B-202ENST00000517924 SMCHD1A6NHR9 2005 aa29.18■■■□□ 2.26
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LAPTM4B-202ENST00000517924 GMCL1Q96IK5 515 aa29.17■■■□□ 2.26
LAPTM4B-202ENST00000517924 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa29.17■■■□□ 2.26
LAPTM4B-202ENST00000517924 ZBED4O75132 1171 aa29.16■■■□□ 2.26
LAPTM4B-202ENST00000517924 SLC1A4P43007 532 aa29.16■■■□□ 2.26
LAPTM4B-202ENST00000517924 AKNAD1Q5T1N1 836 aa29.16■■■□□ 2.26
LAPTM4B-202ENST00000517924 KCTD1Q719H9 257 aa29.16■■■□□ 2.26
LAPTM4B-202ENST00000517924 NEDD4P46934 1319 aa29.16■■■□□ 2.26
LAPTM4B-202ENST00000517924 STAG1Q8WVM7 1258 aa29.15■■■□□ 2.26
LAPTM4B-202ENST00000517924 SLC5A4Q9NY91 659 aa29.15■■■□□ 2.26
LAPTM4B-202ENST00000517924 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
LAPTM4B-202ENST00000517924 PFASO15067 1338 aa29.15■■■□□ 2.26
LAPTM4B-202ENST00000517924 MCM3APO60318 1980 aa29.14■■■□□ 2.26
LAPTM4B-202ENST00000517924 HIP1O00291 1037 aa29.14■■■□□ 2.26
LAPTM4B-202ENST00000517924 ATP2A1O14983 1001 aa29.14■■■□□ 2.26
LAPTM4B-202ENST00000517924 SNAP25P60880 206 aa29.14■■■□□ 2.26
LAPTM4B-202ENST00000517924 KCTD2Q14681 263 aa29.14■■■□□ 2.26
LAPTM4B-202ENST00000517924 ZNF792Q3KQV3 632 aa29.14■■■□□ 2.26
LAPTM4B-202ENST00000517924 MFSD6Q6ZSS7 791 aa29.14■■■□□ 2.26
LAPTM4B-202ENST00000517924 C11orf49Q9H6J7 331 aa29.14■■■□□ 2.26
LAPTM4B-202ENST00000517924 COPB2P35606 906 aa29.13■■■□□ 2.25
LAPTM4B-202ENST00000517924 STAT2P52630 851 aa29.13■■■□□ 2.25
LAPTM4B-202ENST00000517924 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa29.13■■■□□ 2.25
LAPTM4B-202ENST00000517924 ANO1Q5XXA6 986 aa29.13■■■□□ 2.25
LAPTM4B-202ENST00000517924 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
LAPTM4B-202ENST00000517924 EVI5O60447 810 aa29.12■■■□□ 2.25
LAPTM4B-202ENST00000517924 IKQ13123 557 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
LAPTM4B-202ENST00000517924 RCSD1Q6JBY9 416 aa29.12■■■□□ 2.25
LAPTM4B-202ENST00000517924 TMEM47Q9BQJ4 181 aa29.12■■■□□ 2.25
LAPTM4B-202ENST00000517924 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
LAPTM4B-202ENST00000517924 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa29.11■■■□□ 2.25
LAPTM4B-202ENST00000517924 ZNF536O15090 1300 aa29.11■■■□□ 2.25
LAPTM4B-202ENST00000517924 ZNF213O14771 459 aa29.1■■■□□ 2.25
LAPTM4B-202ENST00000517924 COL6A1P12109 1028 aa29.1■■■□□ 2.25
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LAPTM4B-202ENST00000517924 FAM160B2Q86V87 743 aa29.1■■■□□ 2.25
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LAPTM4B-202ENST00000517924 AGBL1Q96MI9 1066 aa29.1■■■□□ 2.25
LAPTM4B-202ENST00000517924 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa29.1■■■□□ 2.25
LAPTM4B-202ENST00000517924 DSCC1Q9BVC3 393 aa29.1■■■□□ 2.25
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LAPTM4B-202ENST00000517924 DNAH12Q6ZR08 3092 aa29.1■■■□□ 2.25
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LAPTM4B-202ENST00000517924 PRR12Q9ULL5 1215 aa29.09■■■□□ 2.25
LAPTM4B-202ENST00000517924 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa29.08■■■□□ 2.25
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LAPTM4B-202ENST00000517924 SLC16A2P36021 539 aa29.08■■■□□ 2.25
LAPTM4B-202ENST00000517924 OAZ1P54368 228 aa29.08■■■□□ 2.25
LAPTM4B-202ENST00000517924 C7orf61Q8IZ16 206 aa29.08■■■□□ 2.25
LAPTM4B-202ENST00000517924 TINF2Q9BSI4 451 aa29.08■■■□□ 2.25
LAPTM4B-202ENST00000517924 PCDH10Q9P2E7 1040 aa29.08■■■□□ 2.25
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LAPTM4B-202ENST00000517924 MSCO60682 206 aa29.07■■■□□ 2.24
LAPTM4B-202ENST00000517924 PLA2G6O60733 806 aa29.07■■■□□ 2.24
LAPTM4B-202ENST00000517924 PCP11498 1178 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
LAPTM4B-202ENST00000517924 CCDC174Q6PII3 467 aa29.07■■■□□ 2.24
LAPTM4B-202ENST00000517924 CHRDL2Q6WN34 429 aa29.07■■■□□ 2.24
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LAPTM4B-202ENST00000517924 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
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LAPTM4B-202ENST00000517924 GPCPD1Q9NPB8 672 aa29.06■■■□□ 2.24
LAPTM4B-202ENST00000517924 LCTP09848 1927 aa29.05■■■□□ 2.24
LAPTM4B-202ENST00000517924 B4E1Z4 1266 aa29.05■■■□□ 2.24
LAPTM4B-202ENST00000517924 KDM4AO75164 1064 aa29.05■■■□□ 2.24
LAPTM4B-202ENST00000517924 SLC34A2O95436 690 aa29.05■■■□□ 2.24
LAPTM4B-202ENST00000517924 CHMLP26374 656 aa29.05■■■□□ 2.24
LAPTM4B-202ENST00000517924 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
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