RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515159.5

SLC38A9-222, Transcript of solute carrier family 38 member 9, human

TSL 2

Gene SLC38A9, Length 3,509 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC38A9-222	ENST00000515159	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	RESP18	Q5W5W9	173 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	C14orf37	Q86TY3	774 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	OLIG1	Q8TAK6	271 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	ARL8A	Q96BM9	186 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	DTNBP1	Q96EV8	351 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	NOD2	Q9HC29	1040 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	SLC24A3	Q9HC58	644 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	TAF1	P21675	1872 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	MFAP3L	O75121	409 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	RAB11FIP3	O75154	756 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	NEBL	O76041	1014 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	GYPC	P04921	128 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	CNGA1	P29973	690 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	NDUFA8	P51970	172 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	GRM2	Q14416	872 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	ITIH4	Q14624	930 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	CAMK4	Q16566	473 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	THEMIS2	Q5TEJ8	643 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	WDR59	Q6PJI9	974 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	ENOX1	Q8TC92	643 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	DGCR8	Q8WYQ5	773 aa	Known RBP eCLIP	5.06	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	CYFIP2	Q96F07	1278 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	MTR	Q99707	1265 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	STK31	Q9BXU1	1019 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	SDAD1	Q9NVU7	687 aa	Known RBP eCLIP	5.06	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	STK25	O00506	426 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	TRAFD1	O14545	582 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	AP1G1	O43747	822 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	PPP1R37	O75864	691 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	CAPNS1	P04632	268 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	RARA	P10276	462 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	5.05	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	CMA1	P23946	247 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	SKIV2L2	P42285	1042 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	GPSM2	P81274	684 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	APBA1	Q02410	837 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	UAP1	Q16222	522 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	DHRS4L2	Q6PKH6	230 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	ARHGAP22	Q7Z5H3	698 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	TRIM58	Q8NG06	486 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	CCDC51	Q96ER9	411 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	USP28	Q96RU2	1077 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	TSGA10	Q9BZW7	698 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	GBP3	Q9H0R5	595 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	PIDD1	Q9HB75	910 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	TMBIM4	Q9HC24	238 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	HESX1	Q9UBX0	185 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	TMCO1	Q9UM00	188 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	CAPN7	Q9Y6W3	813 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	ACADS	P16219	412 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	KRT9	P35527	623 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	USP11	P51784	963 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	GSTM4	Q03013	218 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	LSAMP	Q13449	338 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	ZNF579	Q8NAF0	562 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	MMS19	Q96T76	1030 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	SYT15	Q9BQS2	421 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	MFRP	Q9BY79	579 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	WDR37	Q9Y2I8	494 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	NUMBL	Q9Y6R0	609 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159		A0A1B0GVL5	298 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	AKR1B15	C9JRZ8	316 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	ASAP2	O43150	1006 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	PPP6R2	O75170	966 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	CPA3	P15088	417 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	PDC	P20941	246 aa		5.05	□□□□□ -1.6

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