RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514178.5

PGGT1B-205, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 4

Gene PGGT1B, Length 553 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-205ENST00000514178 LRRN2O75325 713 aa10.65□□□□□ -0.7
PGGT1B-205ENST00000514178 WFS1O76024 890 aa10.65□□□□□ -0.7
PGGT1B-205ENST00000514178 GFRA1P56159 465 aa10.65□□□□□ -0.7
PGGT1B-205ENST00000514178 GABREP78334 506 aa10.65□□□□□ -0.7
PGGT1B-205ENST00000514178 ODR4Q5SWX8 454 aa10.65□□□□□ -0.7
PGGT1B-205ENST00000514178 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
PGGT1B-205ENST00000514178 GSTCDQ8NEC7 633 aa10.65□□□□□ -0.7
PGGT1B-205ENST00000514178 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
PGGT1B-205ENST00000514178 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
PGGT1B-205ENST00000514178 GFOD1Q9NXC2 390 aa10.65□□□□□ -0.7
PGGT1B-205ENST00000514178 CHPF2Q9P2E5 772 aa10.65□□□□□ -0.7
PGGT1B-205ENST00000514178 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
PGGT1B-205ENST00000514178 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa10.64□□□□□ -0.71
PGGT1B-205ENST00000514178 MAP4K2Q12851 820 aa10.64□□□□□ -0.71
PGGT1B-205ENST00000514178 CDK5R2Q13319 367 aa10.64□□□□□ -0.71
PGGT1B-205ENST00000514178 GRB10Q13322 594 aa10.64□□□□□ -0.71
PGGT1B-205ENST00000514178 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
PGGT1B-205ENST00000514178 JDP2Q8WYK2 163 aa10.64□□□□□ -0.71
PGGT1B-205ENST00000514178 KCTD13Q8WZ19 329 aa10.64□□□□□ -0.71
PGGT1B-205ENST00000514178 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
PGGT1B-205ENST00000514178 CEP89Q96ST8 783 aa10.64□□□□□ -0.71
PGGT1B-205ENST00000514178 PRR13Q9NZ81 148 aa10.64□□□□□ -0.71
PGGT1B-205ENST00000514178 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
PGGT1B-205ENST00000514178 NTRK3Q16288 839 aa10.63□□□□□ -0.71
PGGT1B-205ENST00000514178 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa10.63□□□□□ -0.71
PGGT1B-205ENST00000514178 FGD2Q7Z6J4 655 aa10.63□□□□□ -0.71
PGGT1B-205ENST00000514178 PPM1KQ8N3J5 372 aa10.63□□□□□ -0.71
PGGT1B-205ENST00000514178 TOP6BLQ8N6T0 577 aa10.63□□□□□ -0.71
PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM145Q8NBT3 493 aa10.63□□□□□ -0.71
PGGT1B-205ENST00000514178 ZDHHC15Q96MV8 337 aa10.63□□□□□ -0.71
PGGT1B-205ENST00000514178 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa10.63□□□□□ -0.71
PGGT1B-205ENST00000514178 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
PGGT1B-205ENST00000514178 EFCAB14O75071 495 aa10.62□□□□□ -0.71
PGGT1B-205ENST00000514178 EOMESO95936 686 aa10.62□□□□□ -0.71
PGGT1B-205ENST00000514178 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
PGGT1B-205ENST00000514178 NOS3P29474 1203 aa10.62□□□□□ -0.71
PGGT1B-205ENST00000514178 HOXC12P31275 282 aa10.62□□□□□ -0.71
PGGT1B-205ENST00000514178 KCNJ6P48051 423 aa10.62□□□□□ -0.71
PGGT1B-205ENST00000514178 GPAT2Q6NUI2 795 aa10.62□□□□□ -0.71
PGGT1B-205ENST00000514178 STRA8Q7Z7C7 330 aa10.62□□□□□ -0.71
PGGT1B-205ENST00000514178 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
PGGT1B-205ENST00000514178 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
PGGT1B-205ENST00000514178 ALG1L2C9J202 215 aa10.61□□□□□ -0.71
PGGT1B-205ENST00000514178 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa10.61□□□□□ -0.71
PGGT1B-205ENST00000514178 PMLP29590 882 aa10.61□□□□□ -0.71
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF460Q14592 562 aa10.61□□□□□ -0.71
PGGT1B-205ENST00000514178 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
PGGT1B-205ENST00000514178 CCDC181Q5TID7 509 aa10.61□□□□□ -0.71
PGGT1B-205ENST00000514178 TMC3Q7Z5M5 1100 aa10.61□□□□□ -0.71
PGGT1B-205ENST00000514178 ATL2Q8NHH9 583 aa10.61□□□□□ -0.71
PGGT1B-205ENST00000514178 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
PGGT1B-205ENST00000514178 WFDC12Q8WWY7 111 aa10.61□□□□□ -0.71
PGGT1B-205ENST00000514178 PTPRN2Q92932 1015 aa10.61□□□□□ -0.71
PGGT1B-205ENST00000514178 C1orf159Q96HA4 380 aa10.61□□□□□ -0.71
PGGT1B-205ENST00000514178 SCLYQ96I15 445 aa10.61□□□□□ -0.71
PGGT1B-205ENST00000514178 CCDC140Q96MF4 163 aa10.61□□□□□ -0.71
PGGT1B-205ENST00000514178 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
PGGT1B-205ENST00000514178 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa10.6□□□□□ -0.71
PGGT1B-205ENST00000514178 VAMP4O75379 141 aa10.6□□□□□ -0.71
PGGT1B-205ENST00000514178 SCG5P05408 212 aa10.6□□□□□ -0.71
PGGT1B-205ENST00000514178 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
PGGT1B-205ENST00000514178 CYP7A1P22680 504 aa10.6□□□□□ -0.71
PGGT1B-205ENST00000514178 RXRBP28702 533 aa10.6□□□□□ -0.71
PGGT1B-205ENST00000514178 IREB2P48200 963 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
PGGT1B-205ENST00000514178 AMPD2Q01433 879 aa10.6□□□□□ -0.71
PGGT1B-205ENST00000514178 PRSS53Q2L4Q9 553 aa10.6□□□□□ -0.71
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa10.6□□□□□ -0.71
PGGT1B-205ENST00000514178 WWC2Q6AWC2 1192 aa10.6□□□□□ -0.71
PGGT1B-205ENST00000514178 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
PGGT1B-205ENST00000514178 DSCC1Q9BVC3 393 aa10.6□□□□□ -0.71
PGGT1B-205ENST00000514178 C1GALT1Q9NS00 363 aa10.6□□□□□ -0.71
PGGT1B-205ENST00000514178 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
PGGT1B-205ENST00000514178 SIGLEC6O43699 453 aa10.59□□□□□ -0.71
PGGT1B-205ENST00000514178 OPA1O60313 960 aa10.59□□□□□ -0.71
PGGT1B-205ENST00000514178 ASLP04424 464 aa10.59□□□□□ -0.71
PGGT1B-205ENST00000514178 BMP3P12645 472 aa10.59□□□□□ -0.71
PGGT1B-205ENST00000514178 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
PGGT1B-205ENST00000514178 CYP4F3Q08477 520 aa10.59□□□□□ -0.71
PGGT1B-205ENST00000514178 UVSSAQ2YD98 709 aa10.59□□□□□ -0.71
PGGT1B-205ENST00000514178 PKN3Q6P5Z2 889 aa10.59□□□□□ -0.71
PGGT1B-205ENST00000514178 AHI1Q8N157 1196 aa10.59□□□□□ -0.71
PGGT1B-205ENST00000514178 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
PGGT1B-205ENST00000514178 MYRFLQ96LU7 910 aa10.59□□□□□ -0.71
PGGT1B-205ENST00000514178 DUSP23Q9BVJ7 150 aa10.59□□□□□ -0.71
PGGT1B-205ENST00000514178 CYP26B1Q9NR63 512 aa10.59□□□□□ -0.71
PGGT1B-205ENST00000514178 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
PGGT1B-205ENST00000514178 H0Y8X5 98 aa10.58□□□□□ -0.72
PGGT1B-205ENST00000514178 LEFTY1O75610 366 aa10.58□□□□□ -0.72
PGGT1B-205ENST00000514178 PRAMEF1O95521 474 aa10.58□□□□□ -0.72
PGGT1B-205ENST00000514178 EYA4O95677 639 aa10.58□□□□□ -0.72
PGGT1B-205ENST00000514178 ECI1P42126 302 aa10.58□□□□□ -0.72
PGGT1B-205ENST00000514178 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
PGGT1B-205ENST00000514178 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP10.58□□□□□ -0.72
PGGT1B-205ENST00000514178 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
PGGT1B-205ENST00000514178 DTWD2Q8NBA8 298 aa10.58□□□□□ -0.72
PGGT1B-205ENST00000514178 Q96M66 194 aa10.58□□□□□ -0.72
PGGT1B-205ENST00000514178 CHST7Q9NS84 486 aa10.58□□□□□ -0.72
PGGT1B-205ENST00000514178 MINPP1Q9UNW1 487 aa10.58□□□□□ -0.72
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.9 ms