RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 PHACTR1Q9C0D0 580 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 LCMT1Q9UIC8 334 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 PDE4BQ07343 736 aa5.2□□□□□ -1.58
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RABGGTB-213ENST00000496055 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 TMED1Q13445 227 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 CCDC80Q76M96 950 aa5.2□□□□□ -1.58
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RABGGTB-213ENST00000496055 TEX11Q8IYF3 940 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 STK11IPQ8N1F8 1099 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 GOLGA1Q92805 767 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 POM121Q96HA1 1249 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 SPC25Q9HBM1 224 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 SEC31BQ9NQW1 1179 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 TRIM17Q9Y577 477 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 LAMB4A4D0S4 1761 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 PLIN1O60240 522 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 ITGA6P23229 1130 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 CHMLP26374 656 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 PRPHP41219 470 aa5.2□□□□□ -1.58
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RABGGTB-213ENST00000496055 USP4Q13107 963 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 MPP3Q13368 585 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 LLGL2Q6P1M3 1020 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 NEK10Q6ZWH5 1172 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 C3orf20Q8ND61 904 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 GPT2Q8TD30 523 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 CSRNP1Q96S65 589 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 CAPS2Q9BXY5 557 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 DCAF16Q9NXF7 216 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 TBK1Q9UHD2 729 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 E2F6O75461 281 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 PRMT2P55345 433 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP5.19□□□□□ -1.582e-23■■■■■ 43.2
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RABGGTB-213ENST00000496055 TOMM20Q15388 145 aa5.19□□□□□ -1.58
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RABGGTB-213ENST00000496055 CDHR1Q96JP9 859 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 MRS2Q9HD23 443 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 MINPP1Q9UNW1 487 aa5.19□□□□□ -1.58
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RABGGTB-213ENST00000496055 SLC34A2O95436 690 aa5.19□□□□□ -1.58
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RABGGTB-213ENST00000496055 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 DCLK2Q8N568 766 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 SVIPQ8NHG7 77 aa5.19□□□□□ -1.58
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RABGGTB-213ENST00000496055 EPAS1Q99814 870 aa5.19□□□□□ -1.58
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RABGGTB-213ENST00000496055 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 MRFAP1Q9Y605 127 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 RTL9Q8NET4 1388 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 PRSS47A8MTI9 375 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 MCM5P33992 734 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 GTF2A2P52657 109 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 CCDC144BQ3MJ40 725 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
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RABGGTB-213ENST00000496055 STAG1Q8WVM7 1258 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 ZFPM2Q8WW38 1151 aa5.19□□□□□ -1.58
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RABGGTB-213ENST00000496055 F8W031 263 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC26A4O43511 780 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 ALDH1L1O75891 902 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 TBC1D8O95759 1140 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 TM4SF4P48230 202 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 ADCY1Q08828 1119 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC4A10Q6U841 1118 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 MIGA1Q8NAN2 632 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 TTLL11Q8NHH1 800 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 NKX2-3Q8TAU0 364 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 CLIP3Q96DZ5 547 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
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