RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489581.1

TOP3B-217, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 789 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-217ENST00000489581 TMEM39AQ9NV64 488 aa20.36■□□□□ 0.85
TOP3B-217ENST00000489581 ADAMTS4O75173 837 aa20.35■□□□□ 0.85
TOP3B-217ENST00000489581 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa20.35■□□□□ 0.85
TOP3B-217ENST00000489581 DDX11Q96FC9 970 aa20.35■□□□□ 0.85
TOP3B-217ENST00000489581 SLF1Q9BQI6 1058 aa20.35■□□□□ 0.85
TOP3B-217ENST00000489581 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
TOP3B-217ENST00000489581 RIPK3Q9Y572 518 aa20.35■□□□□ 0.85
TOP3B-217ENST00000489581 ROBO3Q96MS0 1386 aa20.34■□□□□ 0.85
TOP3B-217ENST00000489581 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
TOP3B-217ENST00000489581 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
TOP3B-217ENST00000489581 FOSL2P15408 326 aa20.34■□□□□ 0.85
TOP3B-217ENST00000489581 RASA1P20936 1047 aa20.34■□□□□ 0.85
TOP3B-217ENST00000489581 FAAP100Q0VG06 881 aa20.34■□□□□ 0.85
TOP3B-217ENST00000489581 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
TOP3B-217ENST00000489581 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
TOP3B-217ENST00000489581 TEX13BQ9BXU2 312 aa20.34■□□□□ 0.85
TOP3B-217ENST00000489581 STARD7Q9NQZ5 370 aa20.34■□□□□ 0.85
TOP3B-217ENST00000489581 FAM184BQ9ULE4 1060 aa20.34■□□□□ 0.85
TOP3B-217ENST00000489581 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa20.33■□□□□ 0.85
TOP3B-217ENST00000489581 DCDC2CA8MYV0 355 aa20.33■□□□□ 0.85
TOP3B-217ENST00000489581 F5H6K3 240 aa20.33■□□□□ 0.85
TOP3B-217ENST00000489581 ACLYP53396 1101 aa20.33■□□□□ 0.85
TOP3B-217ENST00000489581 FPGSQ05932 587 aa20.33■□□□□ 0.85
TOP3B-217ENST00000489581 KLRC3Q07444 240 aa20.33■□□□□ 0.85
TOP3B-217ENST00000489581 KCNA10Q16322 511 aa20.33■□□□□ 0.85
TOP3B-217ENST00000489581 CPXCR1Q8N123 301 aa20.33■□□□□ 0.85
TOP3B-217ENST00000489581 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
TOP3B-217ENST00000489581 MKNK2Q9HBH9 465 aa20.33■□□□□ 0.85
TOP3B-217ENST00000489581 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
TOP3B-217ENST00000489581 GSG1L2A8MUP6 293 aa20.32■□□□□ 0.84
TOP3B-217ENST00000489581 MINDY4BA8MYZ0 360 aa20.32■□□□□ 0.84
TOP3B-217ENST00000489581 NDUFB10O96000 172 aa20.32■□□□□ 0.84
TOP3B-217ENST00000489581 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
TOP3B-217ENST00000489581 SBK1Q52WX2 424 aa20.32■□□□□ 0.84
TOP3B-217ENST00000489581 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa20.32■□□□□ 0.84
TOP3B-217ENST00000489581 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
TOP3B-217ENST00000489581 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
TOP3B-217ENST00000489581 KLHDC9Q8NEP7 349 aa20.32■□□□□ 0.84
TOP3B-217ENST00000489581 NUP133Q8WUM0 1156 aa20.32■□□□□ 0.84
TOP3B-217ENST00000489581 TOX2Q96NM4 488 aa20.32■□□□□ 0.84
TOP3B-217ENST00000489581 LRRCC1Q9C099 1032 aa20.32■□□□□ 0.84
TOP3B-217ENST00000489581 NYAP2Q9P242 653 aa20.32■□□□□ 0.84
TOP3B-217ENST00000489581 CLIP2Q9UDT6 1046 aa20.32■□□□□ 0.84
TOP3B-217ENST00000489581 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa20.31■□□□□ 0.84
TOP3B-217ENST00000489581 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa20.31■□□□□ 0.84
TOP3B-217ENST00000489581 MYADML2A6NDP7 307 aa20.31■□□□□ 0.84
TOP3B-217ENST00000489581 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa20.31■□□□□ 0.84
TOP3B-217ENST00000489581 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
TOP3B-217ENST00000489581 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
TOP3B-217ENST00000489581 TTC28Q96AY4 2481 aa20.31■□□□□ 0.84
TOP3B-217ENST00000489581 MOXD2PA6NHM9 499 aa20.3■□□□□ 0.84
TOP3B-217ENST00000489581 ZBED4O75132 1171 aa20.3■□□□□ 0.84
TOP3B-217ENST00000489581 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
TOP3B-217ENST00000489581 OSBP2Q969R2 916 aa20.3■□□□□ 0.84
TOP3B-217ENST00000489581 KIFC2Q96AC6 838 aa20.3■□□□□ 0.84
TOP3B-217ENST00000489581 TMEM265A0A087WTH1 108 aa20.29■□□□□ 0.84
TOP3B-217ENST00000489581 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
TOP3B-217ENST00000489581 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
TOP3B-217ENST00000489581 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
TOP3B-217ENST00000489581 TIMP1P01033 207 aa20.29■□□□□ 0.84
TOP3B-217ENST00000489581 ACVR2BQ13705 512 aa20.29■□□□□ 0.84
TOP3B-217ENST00000489581 GRIN2CQ14957 1233 aa20.29■□□□□ 0.84
TOP3B-217ENST00000489581 VTI1AQ96AJ9 217 aa20.29■□□□□ 0.84
TOP3B-217ENST00000489581 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
TOP3B-217ENST00000489581 ATP2A1O14983 1001 aa20.28■□□□□ 0.84
TOP3B-217ENST00000489581 ADCY6O43306 1168 aa20.28■□□□□ 0.84
TOP3B-217ENST00000489581 PRDM1O75626 825 aa20.28■□□□□ 0.84
TOP3B-217ENST00000489581 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
TOP3B-217ENST00000489581 DNAJB2P25686 324 aa20.28■□□□□ 0.84
TOP3B-217ENST00000489581 GIMAP6Q6P9H5 292 aa20.28■□□□□ 0.84
TOP3B-217ENST00000489581 ANKRD35Q8N283 1001 aa20.28■□□□□ 0.84
TOP3B-217ENST00000489581 GLT1D1Q96MS3 346 aa20.28■□□□□ 0.84
TOP3B-217ENST00000489581 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP20.28■□□□□ 0.846e-10■■■□□ 18
TOP3B-217ENST00000489581 ECHDC1Q9NTX5 307 aa20.28■□□□□ 0.84
TOP3B-217ENST00000489581 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
TOP3B-217ENST00000489581 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa20.27■□□□□ 0.84
TOP3B-217ENST00000489581 ASGR1P07306 291 aa20.27■□□□□ 0.84
TOP3B-217ENST00000489581 CCDC144BQ3MJ40 725 aa20.27■□□□□ 0.84
TOP3B-217ENST00000489581 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
TOP3B-217ENST00000489581 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
TOP3B-217ENST00000489581 KBTBD3Q8NAB2 608 aa20.27■□□□□ 0.84
TOP3B-217ENST00000489581 FGD4Q96M96 766 aa20.27■□□□□ 0.84
TOP3B-217ENST00000489581 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa20.27■□□□□ 0.84
TOP3B-217ENST00000489581 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
TOP3B-217ENST00000489581 TBX21Q9UL17 535 aa20.27■□□□□ 0.84
TOP3B-217ENST00000489581 ELP1O95163 1332 aa20.27■□□□□ 0.83
TOP3B-217ENST00000489581 CST5P28325 142 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
TOP3B-217ENST00000489581 TDO2P48775 406 aa20.26■□□□□ 0.83
TOP3B-217ENST00000489581 CDK7P50613 346 aa20.26■□□□□ 0.83
TOP3B-217ENST00000489581 TSHZ3Q63HK5 1081 aa20.26■□□□□ 0.83
TOP3B-217ENST00000489581 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
TOP3B-217ENST00000489581 APPBP2Q92624 585 aa20.26■□□□□ 0.83
TOP3B-217ENST00000489581 CEP95Q96GE4 821 aa20.26■□□□□ 0.83
TOP3B-217ENST00000489581 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa20.26■□□□□ 0.83
TOP3B-217ENST00000489581 ZNF576Q9H609 170 aa20.26■□□□□ 0.83
TOP3B-217ENST00000489581 SPC25Q9HBM1 224 aa20.26■□□□□ 0.83
TOP3B-217ENST00000489581 FEM1BQ9UK73 627 aa20.26■□□□□ 0.83
TOP3B-217ENST00000489581 MROH7Q68CQ1 1323 aa20.26■□□□□ 0.83
TOP3B-217ENST00000489581 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
TOP3B-217ENST00000489581 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
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