RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487411.5

STX4-210, Transcript of syntaxin 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene STX4, Length 1,290 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4-210ENST00000487411 FAM160B2Q86V87 743 aa26.65■■□□□ 1.86
STX4-210ENST00000487411 NPLOC4Q8TAT6 608 aa26.65■■□□□ 1.86
STX4-210ENST00000487411 TEX13BQ9BXU2 312 aa26.65■■□□□ 1.86
STX4-210ENST00000487411 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa26.65■■□□□ 1.86
STX4-210ENST00000487411 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
STX4-210ENST00000487411 PLA2G6O60733 806 aa26.64■■□□□ 1.86
STX4-210ENST00000487411 ZBED4O75132 1171 aa26.64■■□□□ 1.86
STX4-210ENST00000487411 CHURC1Q8WUH1 139 aa26.64■■□□□ 1.86
STX4-210ENST00000487411 TTC14Q96N46 770 aa26.64■■□□□ 1.86
STX4-210ENST00000487411 DEFB118Q96PH6 123 aa26.64■■□□□ 1.86
STX4-210ENST00000487411 TMEM47Q9BQJ4 181 aa26.64■■□□□ 1.86
STX4-210ENST00000487411 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
STX4-210ENST00000487411 FDX1P10109 184 aa26.63■■□□□ 1.85
STX4-210ENST00000487411 FCER1AP12319 257 aa26.63■■□□□ 1.85
STX4-210ENST00000487411 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
STX4-210ENST00000487411 RCSD1Q6JBY9 416 aa26.63■■□□□ 1.85
STX4-210ENST00000487411 RASGRP2Q7LDG7 609 aa26.63■■□□□ 1.85
STX4-210ENST00000487411 DPP9Q86TI2 863 aa26.63■■□□□ 1.85
STX4-210ENST00000487411 DCAF4Q8WV16 495 aa26.63■■□□□ 1.85
STX4-210ENST00000487411 FLRT1Q9NZU1 646 aa26.63■■□□□ 1.85
STX4-210ENST00000487411 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
STX4-210ENST00000487411 COBLO75128 1261 aa26.62■■□□□ 1.85
STX4-210ENST00000487411 OAZ1P54368 228 aa26.62■■□□□ 1.85
STX4-210ENST00000487411 PTH1RQ03431 593 aa26.62■■□□□ 1.85
STX4-210ENST00000487411 MFSD14CQ5VZR4 134 aa26.62■■□□□ 1.85
STX4-210ENST00000487411 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
STX4-210ENST00000487411 SKAP1Q86WV1 359 aa26.62■■□□□ 1.85
STX4-210ENST00000487411 CCDC136Q96JN2 1154 aa26.62■■□□□ 1.85
STX4-210ENST00000487411 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa26.62■■□□□ 1.85
STX4-210ENST00000487411 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
STX4-210ENST00000487411 B4E1Z4 1266 aa26.61■■□□□ 1.85
STX4-210ENST00000487411 KDM4AO75164 1064 aa26.61■■□□□ 1.85
STX4-210ENST00000487411 IGHA2P01877 340 aa26.61■■□□□ 1.85
STX4-210ENST00000487411 BMP2KLQ5H9B9 411 aa26.61■■□□□ 1.85
STX4-210ENST00000487411 OLFML2BQ68BL8 750 aa26.61■■□□□ 1.85
STX4-210ENST00000487411 KCTD1Q719H9 257 aa26.61■■□□□ 1.85
STX4-210ENST00000487411 IQCA1Q86XH1 822 aa26.61■■□□□ 1.85
STX4-210ENST00000487411 MMP19Q99542 508 aa26.61■■□□□ 1.85
STX4-210ENST00000487411 KRT23Q9C075 422 aa26.61■■□□□ 1.85
STX4-210ENST00000487411 CNNM2Q9H8M5 875 aa26.61■■□□□ 1.85
STX4-210ENST00000487411 SLC5A4Q9NY91 659 aa26.61■■□□□ 1.85
STX4-210ENST00000487411 MTMR7Q9Y216 660 aa26.61■■□□□ 1.85
STX4-210ENST00000487411 NEFLP07196 543 aa26.6■■□□□ 1.85
STX4-210ENST00000487411 IKQ13123 557 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
STX4-210ENST00000487411 CCDC96Q2M329 555 aa26.6■■□□□ 1.85
STX4-210ENST00000487411 CCDC178Q5BJE1 867 aa26.6■■□□□ 1.85
STX4-210ENST00000487411 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa26.6■■□□□ 1.85
STX4-210ENST00000487411 DGKHQ86XP1 1220 aa26.6■■□□□ 1.85
STX4-210ENST00000487411 CPXCR1Q8N123 301 aa26.6■■□□□ 1.85
STX4-210ENST00000487411 CHMP4CQ96CF2 233 aa26.6■■□□□ 1.85
STX4-210ENST00000487411 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
STX4-210ENST00000487411 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
STX4-210ENST00000487411 KCTD2Q14681 263 aa26.59■■□□□ 1.85
STX4-210ENST00000487411 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP26.59■■□□□ 1.85
STX4-210ENST00000487411 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa26.59■■□□□ 1.85
STX4-210ENST00000487411 RIPK3Q9Y572 518 aa26.59■■□□□ 1.85
STX4-210ENST00000487411 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa26.58■■□□□ 1.85
STX4-210ENST00000487411 PDHBP11177 359 aa26.58■■□□□ 1.85
STX4-210ENST00000487411 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
STX4-210ENST00000487411 TFRCP02786 760 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
STX4-210ENST00000487411 CYP21A2P08686 494 aa26.57■■□□□ 1.84
STX4-210ENST00000487411 BTNL9Q6UXG8 535 aa26.57■■□□□ 1.84
STX4-210ENST00000487411 ANKS1AQ92625 1134 aa26.57■■□□□ 1.84
STX4-210ENST00000487411 ZSWIM5Q9P217 1185 aa26.57■■□□□ 1.84
STX4-210ENST00000487411 PRR12Q9ULL5 1215 aa26.57■■□□□ 1.84
STX4-210ENST00000487411 SNHG28P0DPA3 235 aa26.56■■□□□ 1.84
STX4-210ENST00000487411 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
STX4-210ENST00000487411 CYP2C19P33261 490 aa26.56■■□□□ 1.84
STX4-210ENST00000487411 CHST13Q8NET6 341 aa26.56■■□□□ 1.84
STX4-210ENST00000487411 MAP4K1Q92918 833 aa26.56■■□□□ 1.84
STX4-210ENST00000487411 MAML3Q96JK9 1138 aa26.56■■□□□ 1.84
STX4-210ENST00000487411 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
STX4-210ENST00000487411 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
STX4-210ENST00000487411 ZNF536O15090 1300 aa26.56■■□□□ 1.84
STX4-210ENST00000487411 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa26.55■■□□□ 1.84
STX4-210ENST00000487411 FBXO40Q9UH90 709 aa26.55■■□□□ 1.84
STX4-210ENST00000487411 TNKSO95271 1327 aa26.55■■□□□ 1.84
STX4-210ENST00000487411 PGK2P07205 417 aa26.54■■□□□ 1.84
STX4-210ENST00000487411 CYBAP13498 195 aa26.54■■□□□ 1.84
STX4-210ENST00000487411 SLC4A3P48751 1232 aa26.54■■□□□ 1.84
STX4-210ENST00000487411 ZNF543Q08ER8 600 aa26.54■■□□□ 1.84
STX4-210ENST00000487411 ZNF792Q3KQV3 632 aa26.54■■□□□ 1.84
STX4-210ENST00000487411 TTBK2Q6IQ55 1244 aa26.54■■□□□ 1.84
STX4-210ENST00000487411 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
STX4-210ENST00000487411 ANKLE1Q8NAG6 615 aa26.54■■□□□ 1.84
STX4-210ENST00000487411 OGDHLQ9ULD0 1010 aa26.54■■□□□ 1.84
STX4-210ENST00000487411 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
STX4-210ENST00000487411 TRDNQ13061 729 aa26.53■■□□□ 1.84
STX4-210ENST00000487411 SYDE2Q5VT97 1194 aa26.53■■□□□ 1.84
STX4-210ENST00000487411 PNMA1Q8ND90 353 aa26.53■■□□□ 1.84
STX4-210ENST00000487411 UBAC1Q9BSL1 405 aa26.53■■□□□ 1.84
STX4-210ENST00000487411 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
STX4-210ENST00000487411 KAT14Q9H8E8 782 aa26.53■■□□□ 1.84
STX4-210ENST00000487411 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
STX4-210ENST00000487411 SLC16A2P36021 539 aa26.52■■□□□ 1.84
STX4-210ENST00000487411 TKFCQ3LXA3 575 aa26.52■■□□□ 1.84
STX4-210ENST00000487411 LHX8Q68G74 356 aa26.52■■□□□ 1.84
STX4-210ENST00000487411 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa26.52■■□□□ 1.84
STX4-210ENST00000487411 TRPV1Q8NER1 839 aa26.52■■□□□ 1.84
STX4-210ENST00000487411 AGBL1Q96MI9 1066 aa26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 90.6 ms