RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486539.1

CACNA2D1-211, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1, humanhuman

TSL 5

Gene CACNA2D1, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1-211ENST00000486539 FAN1Q9Y2M0 1017 aa6.61□□□□□ -1.35
CACNA2D1-211ENST00000486539 TMEM82A0PJX8 343 aa6.6□□□□□ -1.35
CACNA2D1-211ENST00000486539 CELA3AP09093 270 aa6.6□□□□□ -1.35
CACNA2D1-211ENST00000486539 YARSP54577 528 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CACNA2D1-211ENST00000486539 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CACNA2D1-211ENST00000486539 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CACNA2D1-211ENST00000486539 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CACNA2D1-211ENST00000486539 PRDM14Q9GZV8 571 aa6.6□□□□□ -1.35
CACNA2D1-211ENST00000486539 TCFL5Q9UL49 500 aa6.6□□□□□ -1.35
CACNA2D1-211ENST00000486539 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CACNA2D1-211ENST00000486539 INHBEP58166 350 aa6.59□□□□□ -1.35
CACNA2D1-211ENST00000486539 DAGLBQ8NCG7 672 aa6.59□□□□□ -1.35
CACNA2D1-211ENST00000486539 LINC00116Q8NCU8 138 aa6.59□□□□□ -1.35
CACNA2D1-211ENST00000486539 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CACNA2D1-211ENST00000486539 FOXP3Q9BZS1 431 aa6.59□□□□□ -1.35
CACNA2D1-211ENST00000486539 RNF38Q9H0F5 515 aa6.59□□□□□ -1.35
CACNA2D1-211ENST00000486539 FADS2P1A8MWK0 482 aa6.58□□□□□ -1.36
CACNA2D1-211ENST00000486539 PRKCAP17252 672 aa6.58□□□□□ -1.36
CACNA2D1-211ENST00000486539 LMNB1P20700 586 aa6.58□□□□□ -1.36
CACNA2D1-211ENST00000486539 KLF10Q13118 480 aa6.58□□□□□ -1.36
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
CACNA2D1-211ENST00000486539 KREMEN1Q96MU8 473 aa6.58□□□□□ -1.36
CACNA2D1-211ENST00000486539 HDAC8Q9BY41 377 aa6.58□□□□□ -1.36
CACNA2D1-211ENST00000486539 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa6.58□□□□□ -1.36
CACNA2D1-211ENST00000486539 TNNI2P48788 182 aa6.57□□□□□ -1.36
CACNA2D1-211ENST00000486539 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
CACNA2D1-211ENST00000486539 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
CACNA2D1-211ENST00000486539 SV2BQ7L1I2 683 aa6.57□□□□□ -1.36
CACNA2D1-211ENST00000486539 RBCK1Q9BYM8 510 aa6.57□□□□□ -1.36
CACNA2D1-211ENST00000486539 ACSL6Q9UKU0 697 aa6.57□□□□□ -1.36
CACNA2D1-211ENST00000486539 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
CACNA2D1-211ENST00000486539 A0A1W2PQY0 241 aa6.56□□□□□ -1.36
CACNA2D1-211ENST00000486539 GIPC1O14908 333 aa6.56□□□□□ -1.36
CACNA2D1-211ENST00000486539 RPS26P62854 115 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
CACNA2D1-211ENST00000486539 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
CACNA2D1-211ENST00000486539 CDSNQ15517 529 aa6.56□□□□□ -1.36
CACNA2D1-211ENST00000486539 TTBK2Q6IQ55 1244 aa6.56□□□□□ -1.36
CACNA2D1-211ENST00000486539 GLB1LQ6UWU2 654 aa6.56□□□□□ -1.36
CACNA2D1-211ENST00000486539 NTMQ9P121 344 aa6.56□□□□□ -1.36
CACNA2D1-211ENST00000486539 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa6.56□□□□□ -1.36
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CACNA2D1-211ENST00000486539 FAM13CQ8NE31 585 aa6.55□□□□□ -1.36
CACNA2D1-211ENST00000486539 NUP43Q8NFH3 380 aa6.55□□□□□ -1.36
CACNA2D1-211ENST00000486539 TCTN2Q96GX1 697 aa6.55□□□□□ -1.36
CACNA2D1-211ENST00000486539 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CACNA2D1-211ENST00000486539 AMHP03971 560 aa6.54□□□□□ -1.36
CACNA2D1-211ENST00000486539 SARSP49591 514 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CACNA2D1-211ENST00000486539 MVKQ03426 396 aa6.54□□□□□ -1.36
CACNA2D1-211ENST00000486539 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
CACNA2D1-211ENST00000486539 KIAA2012Q0VF49 1180 aa6.53□□□□□ -1.36
CACNA2D1-211ENST00000486539 KIR3DS1Q14943 382 aa6.53□□□□□ -1.36
CACNA2D1-211ENST00000486539 SLCO6A1Q86UG4 719 aa6.53□□□□□ -1.36
CACNA2D1-211ENST00000486539 SLFN12Q8IYM2 578 aa6.53□□□□□ -1.36
CACNA2D1-211ENST00000486539 LGI4Q8N135 537 aa6.53□□□□□ -1.36
CACNA2D1-211ENST00000486539 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
CACNA2D1-211ENST00000486539 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
CACNA2D1-211ENST00000486539 NCAM1P13591 858 aa6.52□□□□□ -1.37
CACNA2D1-211ENST00000486539 ATF2P15336 505 aa6.52□□□□□ -1.37
CACNA2D1-211ENST00000486539 BBS9Q3SYG4 887 aa6.52□□□□□ -1.37
CACNA2D1-211ENST00000486539 FBF1Q8TES7 1133 aa6.52□□□□□ -1.37
CACNA2D1-211ENST00000486539 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CACNA2D1-211ENST00000486539 KLC2Q9H0B6 622 aa6.52□□□□□ -1.37
CACNA2D1-211ENST00000486539 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CACNA2D1-211ENST00000486539 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa6.52□□□□□ -1.37
CACNA2D1-211ENST00000486539 LTBP3Q9NS15 1303 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D1-211ENST00000486539 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D1-211ENST00000486539 FKTNO75072 461 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D1-211ENST00000486539 SYPP08247 313 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D1-211ENST00000486539 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D1-211ENST00000486539 CHMP4BP1P59074 171 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D1-211ENST00000486539 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D1-211ENST00000486539 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D1-211ENST00000486539 BORAQ6PGQ7 559 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D1-211ENST00000486539 PAQR3Q6TCH7 311 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D1-211ENST00000486539 TTLL7Q6ZT98 887 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D1-211ENST00000486539 SERPINA10Q9UK55 444 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF536O15090 1300 aa6.5□□□□□ -1.37
CACNA2D1-211ENST00000486539 SRGAP3O43295 1099 aa6.5□□□□□ -1.37
CACNA2D1-211ENST00000486539 CYBBP04839 570 aa6.5□□□□□ -1.37
CACNA2D1-211ENST00000486539 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CACNA2D1-211ENST00000486539 SEPT6Q14141 434 aa6.5□□□□□ -1.37
CACNA2D1-211ENST00000486539 FHL2Q14192 279 aa6.5□□□□□ -1.37
CACNA2D1-211ENST00000486539 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CACNA2D1-211ENST00000486539 FAM124AQ86V42 546 aa6.5□□□□□ -1.37
CACNA2D1-211ENST00000486539 CCDC74BQ96LY2 380 aa6.5□□□□□ -1.37
CACNA2D1-211ENST00000486539 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D1-211ENST00000486539 TMEM201Q5SNT2 666 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D1-211ENST00000486539 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D1-211ENST00000486539 UPK3BL1B0FP48 263 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D1-211ENST00000486539 UPK3BL2E5RIL1 263 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D1-211ENST00000486539 SERPINB4P48594 390 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D1-211ENST00000486539 RNF4P78317 190 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D1-211ENST00000486539 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZPBP2Q6X784 338 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D1-211ENST00000486539 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D1-211ENST00000486539 A0A1W2PQ27 194 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D1-211ENST00000486539 A0A1W2PQ64 194 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D1-211ENST00000486539 A0A1W2PQC6 194 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D1-211ENST00000486539 A0A1W2PQD8 194 aa6.47□□□□□ -1.37
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