RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476502.1

TRBV1-201, Transcript of T cell receptor beta variable 1 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene TRBV1, Length 284 nt, Biotype TR V pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV1-201ENST00000476502 Q96M66 194 aa4.91□□□□□ -1.62
TRBV1-201ENST00000476502 FERD3LQ96RJ6 166 aa4.91□□□□□ -1.62
TRBV1-201ENST00000476502 KIF2CQ99661 725 aa4.91□□□□□ -1.62
TRBV1-201ENST00000476502 TM9SF2Q99805 663 aa4.91□□□□□ -1.62
TRBV1-201ENST00000476502 SLC6A17Q9H1V8 727 aa4.91□□□□□ -1.62
TRBV1-201ENST00000476502 A0A1W2PQH9 124 aa4.9□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 SHOXO15266 292 aa4.9□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 BMP7P18075 431 aa4.9□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 YARSP54577 528 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 EIF6P56537 245 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 RBL2Q08999 1139 aa4.9□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 UNC5AQ6ZN44 842 aa4.9□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 SPPL2CQ8IUH8 684 aa4.9□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 LILRA2Q8N149 483 aa4.9□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 OR6P1Q8NGX9 317 aa4.9□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa4.9□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 KLHL6Q8WZ60 621 aa4.9□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP4.9□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 DUSP13Q9UII6 198 aa4.9□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 CEP131Q9UPN4 1083 aa4.9□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 MRVI1Q9Y6F6 885 aa4.9□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 CCNFP41002 786 aa4.89□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 SERINC3Q13530 473 aa4.89□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 NFIXQ14938 502 aa4.89□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa4.89□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 ARMC5Q96C12 935 aa4.89□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 BORCS6Q96GS4 357 aa4.89□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 CCDC74BQ96LY2 380 aa4.89□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 KCNK12Q9HB15 430 aa4.89□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 C19orf73Q9NVV2 129 aa4.89□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 PRKAG3Q9UGI9 489 aa4.89□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 ST14Q9Y5Y6 855 aa4.89□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa4.88□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 C9IYK1 514 aa4.88□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 EGR3Q06889 387 aa4.88□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 TNK2Q07912 1038 aa4.88□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 DUSP4Q13115 394 aa4.88□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 ZNF385BQ569K4 471 aa4.88□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 ZNF605Q86T29 641 aa4.88□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa4.88□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 ANAPC16Q96DE5 110 aa4.88□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 KREMEN1Q96MU8 473 aa4.88□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 SLC6A18Q96N87 628 aa4.88□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 TANGO6Q9C0B7 1094 aa4.88□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa4.87□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa4.87□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 FITM1A5D6W6 292 aa4.87□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 SRFP11831 508 aa4.87□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 RAG1P15918 1043 aa4.87□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 RALGPS1Q5JS13 557 aa4.87□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 TMEM151BQ8IW70 566 aa4.87□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 PDZD8Q8NEN9 1154 aa4.87□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 RNF141Q8WVD5 230 aa4.87□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 ADAMTS10Q9H324 1103 aa4.87□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 SUSD2Q9UGT4 822 aa4.87□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 GPR160Q9UJ42 338 aa4.87□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 CBFA2T2O43439 604 aa4.86□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 IGSF3O75054 1194 aa4.86□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 LRRN2O75325 713 aa4.86□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 HPXP02790 462 aa4.86□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 PMS1P54277 932 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 CHRNEQ04844 493 aa4.86□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 TCERG1LQ5VWI1 586 aa4.86□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 VPS37DQ86XT2 251 aa4.86□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 IRF2BP1Q8IU81 584 aa4.86□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 DTWD2Q8NBA8 298 aa4.86□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 MSRB2Q9Y3D2 182 aa4.86□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 SHISA3A0PJX4 238 aa4.85□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 B2RBV5 119 aa4.85□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 SEMA7AO75326 666 aa4.85□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 SASH1O94885 1247 aa4.85□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP4.85□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 ERVFC1P60507 584 aa4.85□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 RAB33AQ14088 237 aa4.85□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 FBXW10Q5XX13 1052 aa4.85□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 OLFML2BQ68BL8 750 aa4.85□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 ANKS3Q6ZW76 656 aa4.85□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 GGNQ86UU5 652 aa4.85□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 PHACTR4Q8IZ21 702 aa4.85□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 KCNC2Q96PR1 638 aa4.85□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 ASPNQ9BXN1 380 aa4.85□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP4.85□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.3 ms