RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462042.5

RABGGTB-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 569 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF227Q86WZ6 799 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGGTB-205ENST00000462042 FIBCD1Q8N539 461 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGGTB-205ENST00000462042 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGGTB-205ENST00000462042 ADCY4Q8NFM4 1077 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGGTB-205ENST00000462042 BRF1Q92994 677 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGGTB-205ENST00000462042 MISP3Q96FF7 219 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGGTB-205ENST00000462042 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
RABGGTB-205ENST00000462042 HDAC8Q9BY41 377 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGGTB-205ENST00000462042 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
RABGGTB-205ENST00000462042 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
RABGGTB-205ENST00000462042 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
RABGGTB-205ENST00000462042 A0A1W2PQU0 124 aa8.21□□□□□ -1.1
RABGGTB-205ENST00000462042 ENPP3O14638 875 aa8.21□□□□□ -1.1
RABGGTB-205ENST00000462042 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
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RABGGTB-205ENST00000462042 CDKAL1Q5VV42 579 aa8.21□□□□□ -1.1
RABGGTB-205ENST00000462042 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
RABGGTB-205ENST00000462042 HOMER1Q86YM7 354 aa8.21□□□□□ -1.1
RABGGTB-205ENST00000462042 TRIM59Q8IWR1 403 aa8.21□□□□□ -1.1
RABGGTB-205ENST00000462042 SYNPOQ8N3V7 929 aa8.21□□□□□ -1.1
RABGGTB-205ENST00000462042 MRGPRX3Q96LB0 322 aa8.21□□□□□ -1.1
RABGGTB-205ENST00000462042 CCDC140Q96MF4 163 aa8.21□□□□□ -1.1
RABGGTB-205ENST00000462042 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
RABGGTB-205ENST00000462042 TRAV20A0A0B4J274 112 aa8.2□□□□□ -1.1
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RABGGTB-205ENST00000462042 AMPD2Q01433 879 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGGTB-205ENST00000462042 TMEM67Q5HYA8 995 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGGTB-205ENST00000462042 PRSS36Q5K4E3 855 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGGTB-205ENST00000462042 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGGTB-205ENST00000462042 APPBP2Q92624 585 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGGTB-205ENST00000462042 HSPA12BQ96MM6 686 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGGTB-205ENST00000462042 TMEM260Q9NX78 707 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGGTB-205ENST00000462042 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
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RABGGTB-205ENST00000462042 SHISA3A0PJX4 238 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGGTB-205ENST00000462042 ADCY3O60266 1144 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGGTB-205ENST00000462042 FURINP09958 794 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGGTB-205ENST00000462042 BMP8BP34820 402 aa8.19□□□□□ -1.1
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RABGGTB-205ENST00000462042 PPP2R5DQ14738 602 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGGTB-205ENST00000462042 STK11IPQ8N1F8 1099 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGGTB-205ENST00000462042 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
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RABGGTB-205ENST00000462042 HRASLS5Q96KN8 279 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGGTB-205ENST00000462042 SEMA6BQ9H3T3 888 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGGTB-205ENST00000462042 ZSWIM5Q9P217 1185 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGGTB-205ENST00000462042 VAV3Q9UKW4 847 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGGTB-205ENST00000462042 H3BS24 57 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGGTB-205ENST00000462042 KCNH1O95259 989 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGGTB-205ENST00000462042 FGFR1P11362 822 aa8.18□□□□□ -1.1
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RABGGTB-205ENST00000462042 SEMA3GQ9NS98 782 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGGTB-205ENST00000462042 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGGTB-205ENST00000462042 U3KQE9 123 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGGTB-205ENST00000462042 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGGTB-205ENST00000462042 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGGTB-205ENST00000462042 COBLO75128 1261 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGGTB-205ENST00000462042 CDC45O75419 566 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGGTB-205ENST00000462042 CPP00450 1065 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGGTB-205ENST00000462042 TGFB1P01137 390 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM153BP0C7A2 387 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGGTB-205ENST00000462042 HOXC12P31275 282 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGGTB-205ENST00000462042 GAB4Q2WGN9 574 aa8.17□□□□□ -1.1
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RABGGTB-205ENST00000462042 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGGTB-205ENST00000462042 SCUBE1Q8IWY4 988 aa8.17□□□□□ -1.1
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RABGGTB-205ENST00000462042 DUSP13Q9UII6 198 aa8.17□□□□□ -1.1
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RABGGTB-205ENST00000462042 H0Y8X5 98 aa8.16□□□□□ -1.1
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RABGGTB-205ENST00000462042 SQSTM1Q13501 440 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGGTB-205ENST00000462042 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGGTB-205ENST00000462042 C16orf86Q6ZW13 317 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
RABGGTB-205ENST00000462042 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGGTB-205ENST00000462042 FANCLQ9NW38 375 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGGTB-205ENST00000462042 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGGTB-205ENST00000462042 MEIS1O00470 390 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGGTB-205ENST00000462042 CTSKP43235 329 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGGTB-205ENST00000462042 RBM10P98175 930 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
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RABGGTB-205ENST00000462042 MSMPQ1L6U9 139 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGGTB-205ENST00000462042 NSMFQ6X4W1 530 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGGTB-205ENST00000462042 KCTD13Q8WZ19 329 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGGTB-205ENST00000462042 DHRS4Q9BTZ2 278 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGGTB-205ENST00000462042 TMX1Q9H3N1 280 aa8.15□□□□□ -1.1
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