RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460766.5

IMP4-208, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IMP4, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-208ENST00000460766 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
IMP4-208ENST00000460766 GDAQ9Y2T3 454 aa23.13■■□□□ 1.29
IMP4-208ENST00000460766 MRFAP1Q9Y605 127 aa23.13■■□□□ 1.29
IMP4-208ENST00000460766 ADGRG1Q9Y653 693 aa23.13■■□□□ 1.29
IMP4-208ENST00000460766 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP23.12■■□□□ 1.29
IMP4-208ENST00000460766 GSTO1P78417 241 aa23.12■■□□□ 1.29
IMP4-208ENST00000460766 ANKS1AQ92625 1134 aa23.12■■□□□ 1.29
IMP4-208ENST00000460766 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
IMP4-208ENST00000460766 DISC1Q9NRI5 854 aa23.12■■□□□ 1.29
IMP4-208ENST00000460766 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
IMP4-208ENST00000460766 PPP2R3AQ06190 1150 aa23.12■■□□□ 1.29
IMP4-208ENST00000460766 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa23.12■■□□□ 1.29
IMP4-208ENST00000460766 TAB2Q9NYJ8 693 aa23.12■■□□□ 1.29
IMP4-208ENST00000460766 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
IMP4-208ENST00000460766 PCDHA6Q9UN73 950 aa23.12■■□□□ 1.29
IMP4-208ENST00000460766 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa23.12■■□□□ 1.29
IMP4-208ENST00000460766 MAST2Q6P0Q8 1798 aa23.11■■□□□ 1.29
IMP4-208ENST00000460766 PP2D1A8MPX8 630 aa23.11■■□□□ 1.29
IMP4-208ENST00000460766 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
IMP4-208ENST00000460766 INF2Q27J81 1249 aa23.11■■□□□ 1.29
IMP4-208ENST00000460766 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa23.11■■□□□ 1.29
IMP4-208ENST00000460766 CCDC148Q8NFR7 591 aa23.11■■□□□ 1.29
IMP4-208ENST00000460766 FAM53CQ9NYF3 392 aa23.11■■□□□ 1.29
IMP4-208ENST00000460766 LEMD3Q9Y2U8 911 aa23.11■■□□□ 1.29
IMP4-208ENST00000460766 ITIH6Q6UXX5 1313 aa23.11■■□□□ 1.29
IMP4-208ENST00000460766 CYTH3O43739 400 aa23.11■■□□□ 1.29
IMP4-208ENST00000460766 PRCPP42785 496 aa23.11■■□□□ 1.29
IMP4-208ENST00000460766 SPAG1Q07617 926 aa23.11■■□□□ 1.29
IMP4-208ENST00000460766 GRAPQ13588 217 aa23.11■■□□□ 1.29
IMP4-208ENST00000460766 SLC35G1Q2M3R5 365 aa23.11■■□□□ 1.29
IMP4-208ENST00000460766 CCDC178Q5BJE1 867 aa23.11■■□□□ 1.29
IMP4-208ENST00000460766 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
IMP4-208ENST00000460766 A0A0U1RQJ8 604 aa23.1■■□□□ 1.29
IMP4-208ENST00000460766 KCNJ18B7U540 433 aa23.1■■□□□ 1.29
IMP4-208ENST00000460766 M0R2N6 131 aa23.1■■□□□ 1.29
IMP4-208ENST00000460766 GOLGA8HP0CJ92 632 aa23.1■■□□□ 1.29
IMP4-208ENST00000460766 RFC4P35249 363 aa23.1■■□□□ 1.29
IMP4-208ENST00000460766 KCNJ12Q14500 433 aa23.1■■□□□ 1.29
IMP4-208ENST00000460766 TCP11X2Q5H9J9 407 aa23.1■■□□□ 1.29
IMP4-208ENST00000460766 ZNF804AQ7Z570 1209 aa23.1■■□□□ 1.29
IMP4-208ENST00000460766 ATRIPQ8WXE1 791 aa23.1■■□□□ 1.29
IMP4-208ENST00000460766 EPC1Q9H2F5 836 aa23.1■■□□□ 1.29
IMP4-208ENST00000460766 TMEM60Q9H2L4 133 aa23.1■■□□□ 1.29
IMP4-208ENST00000460766 COPB1P53618 953 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
IMP4-208ENST00000460766 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
IMP4-208ENST00000460766 VPS72Q15906 364 aa23.09■■□□□ 1.29
IMP4-208ENST00000460766 TMCO3Q6UWJ1 677 aa23.09■■□□□ 1.29
IMP4-208ENST00000460766 PLIN2Q99541 437 aa23.09■■□□□ 1.29
IMP4-208ENST00000460766 TMEM47Q9BQJ4 181 aa23.09■■□□□ 1.29
IMP4-208ENST00000460766 ROBO3Q96MS0 1386 aa23.09■■□□□ 1.29
IMP4-208ENST00000460766 LRRC10BA6NIK2 292 aa23.09■■□□□ 1.29
IMP4-208ENST00000460766 NT5C2P49902 561 aa23.09■■□□□ 1.29
IMP4-208ENST00000460766 COL24A1Q17RW2 1714 aa23.09■■□□□ 1.29
IMP4-208ENST00000460766 TEX35Q5T0J7 233 aa23.09■■□□□ 1.29
IMP4-208ENST00000460766 CCDC51Q96ER9 411 aa23.09■■□□□ 1.29
IMP4-208ENST00000460766 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
IMP4-208ENST00000460766 BARHL2Q9NY43 387 aa23.09■■□□□ 1.29
IMP4-208ENST00000460766 STXBP3O00186 592 aa23.08■■□□□ 1.29
IMP4-208ENST00000460766 UBA7P41226 1012 aa23.08■■□□□ 1.29
IMP4-208ENST00000460766 FHOD1Q9Y613 1164 aa23.08■■□□□ 1.29
IMP4-208ENST00000460766 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa23.08■■□□□ 1.29
IMP4-208ENST00000460766 KIF5CO60282 957 aa23.08■■□□□ 1.29
IMP4-208ENST00000460766 NAALADL2Q58DX5 795 aa23.08■■□□□ 1.29
IMP4-208ENST00000460766 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa23.08■■□□□ 1.29
IMP4-208ENST00000460766 RASA1P20936 1047 aa23.07■■□□□ 1.28
IMP4-208ENST00000460766 RASGRP2Q7LDG7 609 aa23.07■■□□□ 1.28
IMP4-208ENST00000460766 CPVLQ9H3G5 476 aa23.07■■□□□ 1.28
IMP4-208ENST00000460766 TRIM49BA6NDI0 452 aa23.07■■□□□ 1.28
IMP4-208ENST00000460766 LDHCP07864 332 aa23.07■■□□□ 1.28
IMP4-208ENST00000460766 PPP4CP60510 307 aa23.07■■□□□ 1.28
IMP4-208ENST00000460766 GALNT17Q6IS24 598 aa23.07■■□□□ 1.28
IMP4-208ENST00000460766 CNBD1Q8NA66 436 aa23.07■■□□□ 1.28
IMP4-208ENST00000460766 DAGLBQ8NCG7 672 aa23.07■■□□□ 1.28
IMP4-208ENST00000460766 ABHD10Q9NUJ1 306 aa23.07■■□□□ 1.28
IMP4-208ENST00000460766 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
IMP4-208ENST00000460766 KLRF2D3W0D1 207 aa23.06■■□□□ 1.28
IMP4-208ENST00000460766 ZBTB22O15209 634 aa23.06■■□□□ 1.28
IMP4-208ENST00000460766 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
IMP4-208ENST00000460766 BTDP43251 543 aa23.06■■□□□ 1.28
IMP4-208ENST00000460766 UBXN1Q04323 297 aa23.06■■□□□ 1.28
IMP4-208ENST00000460766 TRAPPC3LQ5T215 181 aa23.06■■□□□ 1.28
IMP4-208ENST00000460766 ACRBPQ8NEB7 543 aa23.06■■□□□ 1.28
IMP4-208ENST00000460766 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
IMP4-208ENST00000460766 ST7Q9NRC1 585 aa23.06■■□□□ 1.28
IMP4-208ENST00000460766 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
IMP4-208ENST00000460766 TMTC1Q8IUR5 882 aa23.05■■□□□ 1.28
IMP4-208ENST00000460766 ADSSL1Q8N142 457 aa23.05■■□□□ 1.28
IMP4-208ENST00000460766 ZNF287Q9HBT7 754 aa23.05■■□□□ 1.28
IMP4-208ENST00000460766 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
IMP4-208ENST00000460766 H7C1D1 291 aa23.05■■□□□ 1.28
IMP4-208ENST00000460766 NAPAP54920 295 aa23.05■■□□□ 1.28
IMP4-208ENST00000460766 ERVK-24P63145 666 aa23.05■■□□□ 1.28
IMP4-208ENST00000460766 ZNF569Q5MCW4 686 aa23.05■■□□□ 1.28
IMP4-208ENST00000460766 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
IMP4-208ENST00000460766 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
IMP4-208ENST00000460766 EYA3Q99504 573 aa23.05■■□□□ 1.28
IMP4-208ENST00000460766 PES1O00541 588 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
IMP4-208ENST00000460766 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
IMP4-208ENST00000460766 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
IMP4-208ENST00000460766 TRIM14Q14142 442 aa23.04■■□□□ 1.28
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