RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458961.1

SNORD109B-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 109B, humanhuman

BASIC

Gene SNORD109B, Length 67 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleolus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD109B-201ENST00000458961 RIPK3Q9Y572 518 aa3.26□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 TACC3Q9Y6A5 838 aa3.26□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 MYO9BQ13459 2157 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 ZBED9Q6R2W3 1325 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 GBF1Q92538 1859 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 MYADML2A6NDP7 307 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 GRXCR1A8MXD5 290 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 DCDC2CA8MYV0 355 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 F5H6K3 240 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 M0R2C6 588 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 KIAA0355O15063 1070 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 ZBED4O75132 1171 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 ADAMTS4O75173 837 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 PRDM1O75626 825 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 TIMP1P01033 207 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 APPP05067 770 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 ACRP10323 421 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 MS4A1P11836 297 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 RASA1P20936 1047 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 DNAJB2P25686 324 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 COPB2P35606 906 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 TDO2P48775 406 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 ACLYP53396 1101 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 FPGSQ05932 587 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 KLRC3Q07444 240 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 FAAP100Q0VG06 881 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 GRIN2CQ14957 1233 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 UBE3CQ15386 1083 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 KCNA10Q16322 511 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 C1orf53Q5VUE5 145 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 TSHZ3Q63HK5 1081 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 SLFN13Q68D06 897 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 ANKRD35Q8N283 1001 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 KLHDC9Q8NEP7 349 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 NUP133Q8WUM0 1156 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 PPM1EQ8WY54 764 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 OSBP2Q969R2 916 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 TEX13BQ9BXU2 312 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 LRRCC1Q9C099 1032 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 PRDM6Q9NQX0 595 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 STARD7Q9NQZ5 370 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 HOMER2Q9NSB8 354 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 NYAP2Q9P242 653 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 CLIP2Q9UDT6 1046 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 NRBP1Q9UHY1 535 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 FAM184BQ9ULE4 1060 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 DDX19BQ9UMR2 479 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 MTMR7Q9Y216 660 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa3.24□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa3.24□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa3.24□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 MOXD2PA6NHM9 499 aa3.24□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 GSG1L2A8MUP6 293 aa3.24□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 ARVCFO00192 962 aa3.24□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 GPAA1O43292 621 aa3.24□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 ADCY6O43306 1168 aa3.24□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 ASGR1P07306 291 aa3.24□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 TSPY3P0CV98 308 aa3.24□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 TSPY8P0CW00 308 aa3.24□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 BMP3P12645 472 aa3.24□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 CSF2RAP15509 400 aa3.24□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 PTGS1P23219 599 aa3.24□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 CYP2C18P33260 490 aa3.24□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 PBX2P40425 430 aa3.24□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 SNAP25P60880 206 aa3.24□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 BEX3Q00994 111 aa3.24□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 CNTN2Q02246 1040 aa3.24□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 IKQ13123 557 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP3.24□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 ACVR2BQ13705 512 aa3.24□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 CCDC144BQ3MJ40 725 aa3.24□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 SBK1Q52WX2 424 aa3.24□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 GNASQ5JWF2 1037 aa3.24□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 TMEM240Q5SV17 173 aa3.24□□□□□ -1.89
SNORD109B-201ENST00000458961 C20orf194Q5TEA3 1177 aa3.24□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.9 ms