RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447402.7

SELENBP1-208, Transcript of selenium binding protein 1, human

TSL 2 BASIC

Gene SELENBP1, Length 1,530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SELENBP1-208	ENST00000447402	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	15.95	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		15.95	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	ATG4C	Q96DT6	458 aa		15.95	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	MAP3K14	Q99558	947 aa		15.95	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		15.95	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		15.95	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	CPA4	Q9UI42	421 aa		15.95	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		15.95	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	15.94	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	15.94	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	RTN1	Q16799	776 aa		15.94	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	SYDE2	Q5VT97	1194 aa		15.94	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		15.94	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	15.94	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		15.94	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	TLR2	O60603	784 aa		15.94	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	PEX10	O60683	326 aa		15.94	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZBED4	O75132	1171 aa		15.94	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	SLC4A3	P48751	1232 aa		15.94	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	SNAP25	P60880	206 aa		15.94	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	PLS1	Q14651	629 aa		15.94	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	15.94	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	15.94	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		15.94	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	WBP1L	Q9NX94	342 aa		15.94	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	TSKS	Q9UJT2	592 aa		15.94	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		15.94	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		15.93	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		15.93	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	VWA5A	O00534	786 aa		15.93	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	PLA2G6	O60733	806 aa		15.93	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	15.93	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	15.93	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	GNAQ	P50148	359 aa		15.93	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	EVC	P57679	992 aa		15.93	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		15.93	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		15.93	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	JMY	Q8N9B5	988 aa		15.93	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		15.93	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	15.93	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	15.93	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		15.93	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		15.93	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	MYPN	Q86TC9	1320 aa		15.92	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	15.92	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		15.92	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	CDC27	P30260	824 aa		15.92	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	RCAN1	P53805	252 aa		15.92	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	CCDC174	Q6PII3	467 aa		15.92	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	NBPF11	Q86T75	865 aa		15.92	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	CPXCR1	Q8N123	301 aa		15.92	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	GTF3C2	Q8WUA4	911 aa	Predicted RBP	15.92	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		15.92	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		15.92	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	CPLX1	O14810	134 aa		15.91	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	PPP2R5B	Q15173	497 aa		15.91	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	ME3	Q16798	604 aa		15.91	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	LBX2	Q6XYB7	198 aa		15.91	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	HOMER1	Q86YM7	354 aa		15.91	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	15.91	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	MB21D1	Q8N884	522 aa		15.91	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	NECAB1	Q8N987	351 aa		15.91	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	IL27	Q8NEV9	243 aa		15.91	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		15.91	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		15.91	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	BTBD7	Q9P203	1132 aa		15.91	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		15.91	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	PPFIA3	O75145	1194 aa		15.9	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	15.9	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	LARGE1	O95461	756 aa		15.9	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	FDX1	P10109	184 aa		15.9	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		15.9	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	POTEE	Q6S8J3	1075 aa		15.9	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	C17orf99	Q6UX52	265 aa		15.9	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		15.9	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	15.9	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		15.9	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		15.9	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		15.9	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	15.9	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	15.9	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		15.9	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	ERVK-9	P63128	1117 aa		15.89	■□□□□ 0.13
SELENBP1-208	ENST00000447402	ERVK-24	P63145	666 aa		15.89	■□□□□ 0.13
SELENBP1-208	ENST00000447402	SCRN1	Q12765	414 aa		15.89	■□□□□ 0.13
SELENBP1-208	ENST00000447402		Q3C1V9	767 aa		15.89	■□□□□ 0.13
SELENBP1-208	ENST00000447402	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		15.89	■□□□□ 0.13
SELENBP1-208	ENST00000447402	CYTH3	O43739	400 aa		15.89	■□□□□ 0.13
SELENBP1-208	ENST00000447402	PFKFB2	O60825	505 aa		15.89	■□□□□ 0.13
SELENBP1-208	ENST00000447402	CNMD	O75829	334 aa		15.89	■□□□□ 0.13
SELENBP1-208	ENST00000447402	MCM2	P49736	904 aa		15.89	■□□□□ 0.13
SELENBP1-208	ENST00000447402	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	15.89	■□□□□ 0.13
SELENBP1-208	ENST00000447402	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		15.89	■□□□□ 0.13
SELENBP1-208	ENST00000447402	WDR78	Q5VTH9	848 aa		15.89	■□□□□ 0.13
SELENBP1-208	ENST00000447402	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	15.89	■□□□□ 0.13
SELENBP1-208	ENST00000447402	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	15.89	■□□□□ 0.13
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	15.89	■□□□□ 0.13
SELENBP1-208	ENST00000447402	PIGS	Q96S52	555 aa		15.89	■□□□□ 0.13
SELENBP1-208	ENST00000447402	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		15.89	■□□□□ 0.13
SELENBP1-208	ENST00000447402	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		15.89	■□□□□ 0.13

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