RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440289.6

PTPRJ-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 3,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-202ENST00000440289 ALX1Q15699 326 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 SLC44A5Q8NCS7 719 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 TANGO6Q9C0B7 1094 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 KCPQ6ZWJ8 1503 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 RTL9Q8NET4 1388 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 GLI3P10071 1580 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 CDKAL1Q5VV42 579 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 FERMT2Q96AC1 680 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 CRACR2AQ9BSW2 395 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 ACTN2P35609 894 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 ASIC1P78348 528 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 PIP4K2BP78356 416 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 ARID5AQ03989 594 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 C3orf67Q6ZVT6 689 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 USP17L3A6NCW0 530 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 USP17L4A6NCW7 530 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 MYO1BO43795 1136 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 RNF40O75150 1001 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 SCG2P13521 617 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 SEC23AQ15436 765 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 TYW1BQ6NUM6 668 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 USP17L1Q7RTZ2 530 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 JAKMIP2Q96AA8 810 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 LACRTQ9GZZ8 138 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 MKNK2Q9HBH9 465 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP20.49■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 DYMQ7RTS9 669 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 OR8K1Q8NGG5 319 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 TMEM60Q9H2L4 133 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 RASSF4Q9H2L5 321 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 KAT14Q9H8E8 782 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 FAM205AQ6ZU69 1335 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 KCNQ2O43526 872 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 ARHGAP25P42331 645 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 TROAPQ12815 778 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 DTHD1Q6ZMT9 781 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 MMRN2Q9H8L6 949 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 L1RE1Q9UN81 338 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 SAR1BQ9Y6B6 198 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 USP5P45974 858 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 TFAP4Q01664 338 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 CDHR2Q9BYE9 1310 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 TMTC3Q6ZXV5 915 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 PTF1AQ7RTS3 328 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 KANSL2Q9H9L4 492 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 MYH15Q9Y2K3 1946 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 FCER1AP12319 257 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 PDE4DQ08499 809 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 SLC39A2Q9NP94 309 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 CRKLP46109 303 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 EXOC4Q96A65 974 aa20.47■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 EHD4Q9H223 541 aa20.47■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 RCCD1A6NED2 376 aa20.46■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 STIM1Q13586 685 aa20.46■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 ERFEQ4G0M1 354 aa20.46■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 GOLGA5Q8TBA6 731 aa20.46■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 CENPHQ9H3R5 247 aa20.46■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 LMTK3Q96Q04 1460 aa20.46■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 ATP8B1O43520 1251 aa20.46■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 LRWD1Q9UFC0 647 aa20.46■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 PSMA7O14818 248 aa20.46■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 BUB1O43683 1085 aa20.46■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 MYBL2P10244 700 aa20.46■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 TECP42680 631 aa20.46■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa20.46■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 MLXIPQ9HAP2 919 aa20.46■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 RWDD2AQ9UIY3 292 aa20.46■□□□□ 0.87
PTPRJ-202ENST00000440289 EIF6P56537 245 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
PTPRJ-202ENST00000440289 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP20.45■□□□□ 0.86
PTPRJ-202ENST00000440289 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
PTPRJ-202ENST00000440289 C2CD5Q86YS7 1000 aa20.45■□□□□ 0.86
PTPRJ-202ENST00000440289 BLIDQ8IZY5 108 aa20.45■□□□□ 0.86
PTPRJ-202ENST00000440289 MB21D1Q8N884 522 aa20.45■□□□□ 0.86
PTPRJ-202ENST00000440289 SPATA20Q8TB22 786 aa20.45■□□□□ 0.86
PTPRJ-202ENST00000440289 ZHX3Q9H4I2 956 aa20.45■□□□□ 0.86
PTPRJ-202ENST00000440289 NCK2O43639 380 aa20.45■□□□□ 0.86
PTPRJ-202ENST00000440289 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
PTPRJ-202ENST00000440289 SPAG1Q07617 926 aa20.45■□□□□ 0.86
PTPRJ-202ENST00000440289 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms