RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429798.1

LIMD1-AS1-202, LIMD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LIMD1-AS1, Length 955 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CCDC102AQ96A19 550 aa11.91□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C12orf42Q96LP6 360 aa11.91□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GPCPD1Q9NPB8 672 aa11.91□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HPS5Q9UPZ3 1129 aa11.91□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SMC3Q9UQE7 1217 aa11.91□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KLRF2D3W0D1 207 aa11.9□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GOLGA8HP0CJ92 632 aa11.9□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 VCAM1P19320 739 aa11.9□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 APLP1P51693 650 aa11.9□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NUBP1P53384 320 aa11.9□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SH3D19Q5HYK7 790 aa11.9□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FAM83BQ5T0W9 1011 aa11.9□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TMTC3Q6ZXV5 915 aa11.9□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KCTD1Q719H9 257 aa11.9□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 WASF1Q92558 559 aa11.9□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HHIPL1Q96JK4 782 aa11.9□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MAD2L2Q9UI95 211 aa11.9□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FEM1BQ9UK73 627 aa11.9□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KCNH4Q9UQ05 1017 aa11.9□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PTPDC1A2A3K4 754 aa11.89□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TMEM232C9JQI7 657 aa11.89□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FLOT1O75955 427 aa11.89□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IFNAR1P17181 557 aa11.89□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 XBP1P17861 261 aa11.89□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ADD1P35611 737 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CUL4AQ13619 759 aa11.89□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SPRYD7Q5W111 196 aa11.89□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SPZ1Q9BXG8 430 aa11.89□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SLC26A6Q9BXS9 759 aa11.89□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PNMA3Q9UL41 463 aa11.89□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 STK36Q9NRP7 1315 aa11.88□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PHIPQ8WWQ0 1821 aa11.88□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 USP17L15C9J2P7 530 aa11.88□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 USP17L13C9JLJ4 530 aa11.88□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 USP17L11C9JVI0 530 aa11.88□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 USP17L18D6R9N7 530 aa11.88□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 USP17L22D6RA61 530 aa11.88□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 USP17L17D6RBQ6 530 aa11.88□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 USP17L19D6RCP7 530 aa11.88□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 USP17L20D6RJB6 530 aa11.88□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PLEKHA8P1O95397 391 aa11.88□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PDCP20941 246 aa11.88□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OSBPP22059 807 aa11.88□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SMARCA1P28370 1054 aa11.88□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CDC27P30260 824 aa11.88□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 USP17L24Q0WX57 530 aa11.88□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TRAF1Q13077 416 aa11.88□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TRIM29Q14134 588 aa11.88□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SYDE2Q5VT97 1194 aa11.88□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RASAL3Q86YV0 1011 aa11.88□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 STAG2Q8N3U4 1231 aa11.88□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CCDC82Q8N4S0 544 aa11.88□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SLF1Q9BQI6 1058 aa11.88□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 EMILIN3Q9NT22 766 aa11.88□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa11.88□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa11.88□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa11.87□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PLA2G6O60733 806 aa11.87□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DEXIO95424 95 aa11.87□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SLC10A3P09131 477 aa11.87□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FDX1P10109 184 aa11.87□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PLCB2Q00722 1185 aa11.87□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SREBF2Q12772 1141 aa11.87□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GRM1Q13255 1194 aa11.87□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CCL15Q16663 113 aa11.87□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa11.87□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RASGRP2Q7LDG7 609 aa11.87□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HOMER1Q86YM7 354 aa11.87□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa11.87□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KIFC2Q96AC6 838 aa11.87□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DDX11Q96FC9 970 aa11.87□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PNMA2Q9UL42 364 aa11.87□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MYPNQ86TC9 1320 aa11.86□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa11.86□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 hCG_1984214I3L0E3 225 aa11.86□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZBED4O75132 1171 aa11.86□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GJB2P29033 226 aa11.86□□□□□ -0.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SLC16A2P36021 539 aa11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms