RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427220.5

TTLL3-210, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTLL3, Length 3,233 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3-210ENST00000427220 ANKRD7Q92527 254 aa22.19■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP22.19■■□□□ 1.144e-7■■□□□ 11.7
TTLL3-210ENST00000427220 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 RPN1P04843 607 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP22.19■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 ASIC1P78348 528 aa22.19■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 ZHX3Q9H4I2 956 aa22.19■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 KCNQ5Q9NR82 932 aa22.19■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 PCDHA6Q9UN73 950 aa22.19■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa22.19■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa22.19■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 ZSCAN12O43309 604 aa22.19■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 UBE2SQ16763 222 aa22.19■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 SLF1Q9BQI6 1058 aa22.19■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 DBNDD1Q9H9R9 158 aa22.19■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 POLD4Q9HCU8 107 aa22.19■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 NHSL1Q5SYE7 1610 aa22.19■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 IKQ13123 557 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 KRT31Q15323 416 aa22.18■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 C4AP0C0L4 1744 aa22.18■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 C4BP0C0L5 1744 aa22.18■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 CALML3P27482 149 aa22.18■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 PAK1Q13153 545 aa22.18■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 PPP2R5BQ15173 497 aa22.18■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 KCTD1Q719H9 257 aa22.18■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 REXO1L1PQ8IX06 675 aa22.18■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa22.18■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 ARHGAP6O43182 974 aa22.18■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 PMS1P54277 932 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 GSTO1P78417 241 aa22.18■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 ZNF569Q5MCW4 686 aa22.18■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 RAD9BQ6WBX8 426 aa22.18■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 TTBK2Q6IQ55 1244 aa22.17■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 KIAA0825Q8IV33 1275 aa22.17■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 TNFRSF25Q93038 417 aa22.17■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 ERO1AQ96HE7 468 aa22.17■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 TPM1P09493 284 aa22.17■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 ZNF18P17022 549 aa22.17■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 TBC1D7Q9P0N9 293 aa22.17■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 AFF2P51816 1311 aa22.16■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 GYS1P13807 737 aa22.16■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 TBCKQ8TEA7 893 aa22.16■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 TXNRD1Q16881 649 aa22.16■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 LEMD3Q9Y2U8 911 aa22.16■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 KCNJ18B7U540 433 aa22.16■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 AKR1B1P15121 316 aa22.16■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 KCNJ12Q14500 433 aa22.16■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 SLC39A2Q9NP94 309 aa22.16■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 BCL9LQ86UU0 1499 aa22.15■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 FCER1AP12319 257 aa22.15■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 PLCG1P19174 1290 aa22.15■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 NR1I3Q14994 352 aa22.15■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa22.15■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa22.15■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa22.15■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 FLT1P17948 1338 aa22.15■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 KRT9P35527 623 aa22.15■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 DGKHQ86XP1 1220 aa22.15■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 TBC1D16Q8TBP0 767 aa22.15■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 KLK7P49862 253 aa22.14■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 PDE4DQ08499 809 aa22.14■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 GSDMAQ96QA5 445 aa22.14■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 USP40Q9NVE5 1235 aa22.14■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 TRIM10Q9UDY6 481 aa22.14■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 LRRC41Q15345 812 aa22.14■■□□□ 1.13
TTLL3-210ENST00000427220 CABP7Q86V35 215 aa22.14■■□□□ 1.13
TTLL3-210ENST00000427220 POTEDQ86YR6 584 aa22.14■■□□□ 1.13
TTLL3-210ENST00000427220 GUCA1BQ9UMX6 200 aa22.14■■□□□ 1.13
TTLL3-210ENST00000427220 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
TTLL3-210ENST00000427220 TRIM65Q6PJ69 517 aa22.14■■□□□ 1.13
TTLL3-210ENST00000427220 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa22.14■■□□□ 1.13
TTLL3-210ENST00000427220 POTEMA6NI47 508 aa22.13■■□□□ 1.13
TTLL3-210ENST00000427220 STXBP3O00186 592 aa22.13■■□□□ 1.13
TTLL3-210ENST00000427220 BMP15O95972 392 aa22.13■■□□□ 1.13
TTLL3-210ENST00000427220 DDR1Q08345 913 aa22.13■■□□□ 1.13
TTLL3-210ENST00000427220 GRM4Q14833 912 aa22.13■■□□□ 1.13
TTLL3-210ENST00000427220 SBK1Q52WX2 424 aa22.13■■□□□ 1.13
TTLL3-210ENST00000427220 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
TTLL3-210ENST00000427220 DISC1Q9NRI5 854 aa22.13■■□□□ 1.13
TTLL3-210ENST00000427220 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
TTLL3-210ENST00000427220 TMEM139Q8IV31 216 aa22.13■■□□□ 1.13
TTLL3-210ENST00000427220 CHP1Q99653 195 aa22.13■■□□□ 1.13
TTLL3-210ENST00000427220 ERICH4A6NGS2 130 aa22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.5 ms