RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426683.5

HERC3-205, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 4

Gene HERC3, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-205ENST00000426683 ANKS1AQ92625 1134 aa21.18■□□□□ 0.98
HERC3-205ENST00000426683 MROH8Q9H579 483 aa21.18■□□□□ 0.98
HERC3-205ENST00000426683 HTTP42858 3142 aa21.18■□□□□ 0.98
HERC3-205ENST00000426683 SLC15A5A6NIM6 579 aa21.17■□□□□ 0.98
HERC3-205ENST00000426683 SLC27A2O14975 620 aa21.17■□□□□ 0.98
HERC3-205ENST00000426683 PLA2G6O60733 806 aa21.17■□□□□ 0.98
HERC3-205ENST00000426683 SLC25A27O95847 323 aa21.17■□□□□ 0.98
HERC3-205ENST00000426683 PDHBP11177 359 aa21.17■□□□□ 0.98
HERC3-205ENST00000426683 RGS2P41220 211 aa21.17■□□□□ 0.98
HERC3-205ENST00000426683 UBXN2AP68543 259 aa21.17■□□□□ 0.98
HERC3-205ENST00000426683 NECTIN1Q15223 517 aa21.17■□□□□ 0.98
HERC3-205ENST00000426683 CREB3L3Q68CJ9 461 aa21.17■□□□□ 0.98
HERC3-205ENST00000426683 CPXCR1Q8N123 301 aa21.17■□□□□ 0.98
HERC3-205ENST00000426683 USP6NLQ92738 828 aa21.17■□□□□ 0.98
HERC3-205ENST00000426683 KAT14Q9H8E8 782 aa21.17■□□□□ 0.98
HERC3-205ENST00000426683 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa21.17■□□□□ 0.98
HERC3-205ENST00000426683 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
HERC3-205ENST00000426683 MAP2K5Q13163 448 aa21.16■□□□□ 0.98
HERC3-205ENST00000426683 GRB14Q14449 540 aa21.16■□□□□ 0.98
HERC3-205ENST00000426683 PNMA1Q8ND90 353 aa21.16■□□□□ 0.98
HERC3-205ENST00000426683 TMEM106CQ9BVX2 250 aa21.16■□□□□ 0.98
HERC3-205ENST00000426683 TEX13BQ9BXU2 312 aa21.16■□□□□ 0.98
HERC3-205ENST00000426683 GPCPD1Q9NPB8 672 aa21.16■□□□□ 0.98
HERC3-205ENST00000426683 INHAP05111 366 aa21.15■□□□□ 0.98
HERC3-205ENST00000426683 FDX1P10109 184 aa21.15■□□□□ 0.98
HERC3-205ENST00000426683 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
HERC3-205ENST00000426683 COPB2P35606 906 aa21.15■□□□□ 0.98
HERC3-205ENST00000426683 SLC4A3P48751 1232 aa21.15■□□□□ 0.98
HERC3-205ENST00000426683 MTFR1Q15390 333 aa21.15■□□□□ 0.98
HERC3-205ENST00000426683 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
HERC3-205ENST00000426683 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
HERC3-205ENST00000426683 TTBK2Q6IQ55 1244 aa21.15■□□□□ 0.98
HERC3-205ENST00000426683 APBA2Q99767 749 aa21.15■□□□□ 0.98
HERC3-205ENST00000426683 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
HERC3-205ENST00000426683 PRR12Q9ULL5 1215 aa21.15■□□□□ 0.98
HERC3-205ENST00000426683 PLXNB2O15031 1838 aa21.14■□□□□ 0.97
HERC3-205ENST00000426683 ATP2A1O14983 1001 aa21.14■□□□□ 0.97
HERC3-205ENST00000426683 STRNO43815 780 aa21.14■□□□□ 0.97
HERC3-205ENST00000426683 SNHG28P0DPA3 235 aa21.14■□□□□ 0.97
HERC3-205ENST00000426683 SLC16A2P36021 539 aa21.14■□□□□ 0.97
HERC3-205ENST00000426683 OAZ1P54368 228 aa21.14■□□□□ 0.97
HERC3-205ENST00000426683 SEC23AQ15436 765 aa21.14■□□□□ 0.97
HERC3-205ENST00000426683 TRIB2Q92519 343 aa21.14■□□□□ 0.97
HERC3-205ENST00000426683 DOCK3Q8IZD9 2030 aa21.14■□□□□ 0.97
HERC3-205ENST00000426683 ERICH2A1L162 156 aa21.13■□□□□ 0.97
HERC3-205ENST00000426683 POTEFA5A3E0 1075 aa21.13■□□□□ 0.97
HERC3-205ENST00000426683 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
HERC3-205ENST00000426683 HMGCRP04035 888 aa21.13■□□□□ 0.97
HERC3-205ENST00000426683 FCER1AP12319 257 aa21.13■□□□□ 0.97
HERC3-205ENST00000426683 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
HERC3-205ENST00000426683 ADORA2AP29274 412 aa21.13■□□□□ 0.97
HERC3-205ENST00000426683 SNAP25P60880 206 aa21.13■□□□□ 0.97
HERC3-205ENST00000426683 ZNF543Q08ER8 600 aa21.13■□□□□ 0.97
HERC3-205ENST00000426683 RNF20Q5VTR2 975 aa21.13■□□□□ 0.97
HERC3-205ENST00000426683 BTNL9Q6UXG8 535 aa21.13■□□□□ 0.97
HERC3-205ENST00000426683 CHST3Q7LGC8 479 aa21.13■□□□□ 0.97
HERC3-205ENST00000426683 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
HERC3-205ENST00000426683 RIPK3Q9Y572 518 aa21.13■□□□□ 0.97
HERC3-205ENST00000426683 GOLGA8HP0CJ92 632 aa21.12■□□□□ 0.97
HERC3-205ENST00000426683 CCL5P13501 91 aa21.12■□□□□ 0.97
HERC3-205ENST00000426683 CCL14Q16627 93 aa21.12■□□□□ 0.97
HERC3-205ENST00000426683 SYDE2Q5VT97 1194 aa21.12■□□□□ 0.97
HERC3-205ENST00000426683 DPP9Q86TI2 863 aa21.12■□□□□ 0.97
HERC3-205ENST00000426683 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
HERC3-205ENST00000426683 ABRAQ8N0Z2 381 aa21.12■□□□□ 0.97
HERC3-205ENST00000426683 MMP19Q99542 508 aa21.12■□□□□ 0.97
HERC3-205ENST00000426683 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
HERC3-205ENST00000426683 HOXC6P09630 235 aa21.11■□□□□ 0.97
HERC3-205ENST00000426683 ANTXR2P58335 489 aa21.11■□□□□ 0.97
HERC3-205ENST00000426683 TRIM32Q13049 653 aa21.11■□□□□ 0.97
HERC3-205ENST00000426683 KCTD2Q14681 263 aa21.11■□□□□ 0.97
HERC3-205ENST00000426683 SART3Q15020 963 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
HERC3-205ENST00000426683 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
HERC3-205ENST00000426683 CCDC174Q6PII3 467 aa21.11■□□□□ 0.97
HERC3-205ENST00000426683 NPLOC4Q8TAT6 608 aa21.11■□□□□ 0.97
HERC3-205ENST00000426683 RNF208Q9H0X6 261 aa21.11■□□□□ 0.97
HERC3-205ENST00000426683 UNC93B1Q9H1C4 597 aa21.11■□□□□ 0.97
HERC3-205ENST00000426683 ZNF536O15090 1300 aa21.1■□□□□ 0.97
HERC3-205ENST00000426683 COBLO75128 1261 aa21.1■□□□□ 0.97
HERC3-205ENST00000426683 WTAPQ15007 396 aa21.1■□□□□ 0.97
HERC3-205ENST00000426683 AGBL1Q96MI9 1066 aa21.1■□□□□ 0.97
HERC3-205ENST00000426683 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
HERC3-205ENST00000426683 PRC1O43663 620 aa21.09■□□□□ 0.97
HERC3-205ENST00000426683 RGS19P49795 217 aa21.09■□□□□ 0.97
HERC3-205ENST00000426683 TMEM67Q5HYA8 995 aa21.09■□□□□ 0.97
HERC3-205ENST00000426683 SENP2Q9HC62 589 aa21.09■□□□□ 0.97
HERC3-205ENST00000426683 SLC5A4Q9NY91 659 aa21.09■□□□□ 0.97
HERC3-205ENST00000426683 FLRT1Q9NZU1 646 aa21.09■□□□□ 0.97
HERC3-205ENST00000426683 REC8O95072 547 aa21.08■□□□□ 0.97
HERC3-205ENST00000426683 PGK2P07205 417 aa21.08■□□□□ 0.97
HERC3-205ENST00000426683 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
HERC3-205ENST00000426683 EN2P19622 333 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
HERC3-205ENST00000426683 MCM5P33992 734 aa21.08■□□□□ 0.97
HERC3-205ENST00000426683 ASPRV1Q53RT3 343 aa21.08■□□□□ 0.97
HERC3-205ENST00000426683 CHST13Q8NET6 341 aa21.08■□□□□ 0.97
HERC3-205ENST00000426683 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa21.08■□□□□ 0.97
HERC3-205ENST00000426683 UBA5Q9GZZ9 404 aa21.08■□□□□ 0.97
HERC3-205ENST00000426683 CPVLQ9H3G5 476 aa21.08■□□□□ 0.97
HERC3-205ENST00000426683 HOMER2Q9NSB8 354 aa21.08■□□□□ 0.97
HERC3-205ENST00000426683 FBXO40Q9UH90 709 aa21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.4 ms