RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 KRT31Q15323 416 aa21.11■□□□□ 0.97
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SH3BP1-202ENST00000417536 ACRBPQ8NEB7 543 aa21.11■□□□□ 0.97
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SH3BP1-202ENST00000417536 KCNJ18B7U540 433 aa21.05■□□□□ 0.96
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SH3BP1-202ENST00000417536 KCNJ12Q14500 433 aa21.05■□□□□ 0.96
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SH3BP1-202ENST00000417536 SLF1Q9BQI6 1058 aa21.04■□□□□ 0.96
SH3BP1-202ENST00000417536 POLLQ9UGP5 575 aa21.04■□□□□ 0.96
SH3BP1-202ENST00000417536 TSPY2A6NKD2 308 aa21.04■□□□□ 0.96
SH3BP1-202ENST00000417536 KRT9P35527 623 aa21.04■□□□□ 0.96
SH3BP1-202ENST00000417536 TRAPPC10P48553 1259 aa21.04■□□□□ 0.96
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
SH3BP1-202ENST00000417536 NEK11Q8NG66 645 aa21.04■□□□□ 0.96
SH3BP1-202ENST00000417536 RASGRP4Q8TDF6 673 aa21.04■□□□□ 0.96
SH3BP1-202ENST00000417536 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP21.04■□□□□ 0.967e-30■■□□□ 14.1
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SH3BP1-202ENST00000417536 ORC4O43929 436 aa21.03■□□□□ 0.96
SH3BP1-202ENST00000417536 FECHP22830 423 aa21.03■□□□□ 0.96
SH3BP1-202ENST00000417536 PRCPP42785 496 aa21.03■□□□□ 0.96
SH3BP1-202ENST00000417536 SPAG1Q07617 926 aa21.03■□□□□ 0.96
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SH3BP1-202ENST00000417536 BRD3Q15059 726 aa21.03■□□□□ 0.96
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SH3BP1-202ENST00000417536 PNKPQ96T60 521 aa21.03■□□□□ 0.96
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