RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409659.5

LRPPRC-202, Transcript of leucine rich pentatricopeptide repeat containing, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LRPPRC, Length 1,610 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRPPRC-202ENST00000409659 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
LRPPRC-202ENST00000409659 STX1AQ16623 288 aa22.17■■□□□ 1.14
LRPPRC-202ENST00000409659 RASGRP2Q7LDG7 609 aa22.17■■□□□ 1.14
LRPPRC-202ENST00000409659 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
LRPPRC-202ENST00000409659 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP22.17■■□□□ 1.146e-7■■□□□ 13.8
LRPPRC-202ENST00000409659 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
LRPPRC-202ENST00000409659 VEZTQ9HBM0 779 aa22.17■■□□□ 1.14
LRPPRC-202ENST00000409659 SYKP43405 635 aa22.16■■□□□ 1.14
LRPPRC-202ENST00000409659 ANO6Q4KMQ2 910 aa22.16■■□□□ 1.14
LRPPRC-202ENST00000409659 TTC38Q5R3I4 469 aa22.16■■□□□ 1.14
LRPPRC-202ENST00000409659 TYW1BQ6NUM6 668 aa22.16■■□□□ 1.14
LRPPRC-202ENST00000409659 CDAN1Q8IWY9 1227 aa22.16■■□□□ 1.14
LRPPRC-202ENST00000409659 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
LRPPRC-202ENST00000409659 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
LRPPRC-202ENST00000409659 PIBF1Q8WXW3 757 aa22.16■■□□□ 1.14
LRPPRC-202ENST00000409659 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
LRPPRC-202ENST00000409659 CLIC6Q96NY7 704 aa22.16■■□□□ 1.14
LRPPRC-202ENST00000409659 MKL1Q969V6 931 aa22.15■■□□□ 1.14
LRPPRC-202ENST00000409659 SDF4Q9BRK5 362 aa22.15■■□□□ 1.14
LRPPRC-202ENST00000409659 CLIP2Q9UDT6 1046 aa22.15■■□□□ 1.14
LRPPRC-202ENST00000409659 MTMR7Q9Y216 660 aa22.15■■□□□ 1.14
LRPPRC-202ENST00000409659 ZNF543Q08ER8 600 aa22.14■■□□□ 1.14
LRPPRC-202ENST00000409659 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
LRPPRC-202ENST00000409659 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa22.14■■□□□ 1.14
LRPPRC-202ENST00000409659 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
LRPPRC-202ENST00000409659 FERMT2Q96AC1 680 aa22.14■■□□□ 1.14
LRPPRC-202ENST00000409659 TRIM34Q9BYJ4 488 aa22.14■■□□□ 1.14
LRPPRC-202ENST00000409659 TMEM39BQ9GZU3 492 aa22.14■■□□□ 1.14
LRPPRC-202ENST00000409659 ZMYND12Q9H0C1 365 aa22.14■■□□□ 1.14
LRPPRC-202ENST00000409659 NYAP2Q9P242 653 aa22.14■■□□□ 1.14
LRPPRC-202ENST00000409659 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
LRPPRC-202ENST00000409659 ESYT2A0FGR8 921 aa22.13■■□□□ 1.13
LRPPRC-202ENST00000409659 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
LRPPRC-202ENST00000409659 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
LRPPRC-202ENST00000409659 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
LRPPRC-202ENST00000409659 TMEM179Q6ZVK1 233 aa22.13■■□□□ 1.13
LRPPRC-202ENST00000409659 CLEC10AQ8IUN9 316 aa22.13■■□□□ 1.13
LRPPRC-202ENST00000409659 KANSL2Q9H9L4 492 aa22.13■■□□□ 1.13
LRPPRC-202ENST00000409659 FAM13BQ9NYF5 915 aa22.13■■□□□ 1.13
LRPPRC-202ENST00000409659 HACL1Q9UJ83 578 aa22.13■■□□□ 1.13
LRPPRC-202ENST00000409659 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
LRPPRC-202ENST00000409659 FAM196BA6NMK8 535 aa22.13■■□□□ 1.13
LRPPRC-202ENST00000409659 HS1BP3Q53T59 392 aa22.13■■□□□ 1.13
LRPPRC-202ENST00000409659 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
LRPPRC-202ENST00000409659 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa22.13■■□□□ 1.13
LRPPRC-202ENST00000409659 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
LRPPRC-202ENST00000409659 TEPSINQ96N21 525 aa22.13■■□□□ 1.13
LRPPRC-202ENST00000409659 CSRNP1Q96S65 589 aa22.13■■□□□ 1.13
LRPPRC-202ENST00000409659 ANO10Q9NW15 660 aa22.13■■□□□ 1.13
LRPPRC-202ENST00000409659 KIAA1468Q9P260 1216 aa22.13■■□□□ 1.13
LRPPRC-202ENST00000409659 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
LRPPRC-202ENST00000409659 KCNH3Q9ULD8 1083 aa22.13■■□□□ 1.13
LRPPRC-202ENST00000409659 GLTPD2A6NH11 291 aa22.12■■□□□ 1.13
LRPPRC-202ENST00000409659 CBX8Q9HC52 389 aa22.12■■□□□ 1.13
LRPPRC-202ENST00000409659 ADAMTS3O15072 1205 aa22.11■■□□□ 1.13
LRPPRC-202ENST00000409659 RASA3Q14644 834 aa22.11■■□□□ 1.13
LRPPRC-202ENST00000409659 DPY19L2Q6NUT2 758 aa22.11■■□□□ 1.13
LRPPRC-202ENST00000409659 PPP1R18Q6NYC8 613 aa22.11■■□□□ 1.13
LRPPRC-202ENST00000409659 CPVLQ9H3G5 476 aa22.11■■□□□ 1.13
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LRPPRC-202ENST00000409659 PCDHA6Q9UN73 950 aa22.11■■□□□ 1.13
LRPPRC-202ENST00000409659 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa22.11■■□□□ 1.13
LRPPRC-202ENST00000409659 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
LRPPRC-202ENST00000409659 WNT7AO00755 349 aa22.1■■□□□ 1.13
LRPPRC-202ENST00000409659 ATP2B1P20020 1258 aa22.1■■□□□ 1.13
LRPPRC-202ENST00000409659 GNA11P29992 359 aa22.1■■□□□ 1.13
LRPPRC-202ENST00000409659 ZNF165P49910 485 aa22.1■■□□□ 1.13
LRPPRC-202ENST00000409659 NAPAP54920 295 aa22.1■■□□□ 1.13
LRPPRC-202ENST00000409659 GRIN1Q05586 938 aa22.1■■□□□ 1.13
LRPPRC-202ENST00000409659 DCAF4Q8WV16 495 aa22.1■■□□□ 1.13
LRPPRC-202ENST00000409659 PIGSQ96S52 555 aa22.1■■□□□ 1.13
LRPPRC-202ENST00000409659 DNAJC25Q9H1X3 360 aa22.1■■□□□ 1.13
LRPPRC-202ENST00000409659 USP25Q9UHP3 1055 aa22.1■■□□□ 1.13
LRPPRC-202ENST00000409659 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
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LRPPRC-202ENST00000409659 KRBA2Q6ZNG9 492 aa22.09■■□□□ 1.13
LRPPRC-202ENST00000409659 C6orf50Q9HD87 102 aa22.09■■□□□ 1.13
LRPPRC-202ENST00000409659 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa22.09■■□□□ 1.13
LRPPRC-202ENST00000409659 MAP3K10Q02779 954 aa22.09■■□□□ 1.13
LRPPRC-202ENST00000409659 TNFAIP1Q13829 316 aa22.09■■□□□ 1.13
LRPPRC-202ENST00000409659 ABCB5Q2M3G0 1257 aa22.09■■□□□ 1.13
LRPPRC-202ENST00000409659 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
LRPPRC-202ENST00000409659 HOMER1Q86YM7 354 aa22.09■■□□□ 1.13
LRPPRC-202ENST00000409659 MTMR8Q96EF0 704 aa22.09■■□□□ 1.13
LRPPRC-202ENST00000409659 CSRNP2Q9H175 543 aa22.09■■□□□ 1.13
LRPPRC-202ENST00000409659 TUBE1Q9UJT0 475 aa22.09■■□□□ 1.13
LRPPRC-202ENST00000409659 POTECB2RU33 542 aa22.08■■□□□ 1.13
LRPPRC-202ENST00000409659 EEF2P13639 858 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
LRPPRC-202ENST00000409659 TNNI2P48788 182 aa22.08■■□□□ 1.13
LRPPRC-202ENST00000409659 ICA1Q05084 483 aa22.08■■□□□ 1.13
LRPPRC-202ENST00000409659 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
LRPPRC-202ENST00000409659 KRT25Q7Z3Z0 450 aa22.08■■□□□ 1.13
LRPPRC-202ENST00000409659 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa22.08■■□□□ 1.13
LRPPRC-202ENST00000409659 UBA5Q9GZZ9 404 aa22.08■■□□□ 1.13
LRPPRC-202ENST00000409659 GGA3Q9NZ52 723 aa22.08■■□□□ 1.13
LRPPRC-202ENST00000409659 ATAD5Q96QE3 1844 aa22.07■■□□□ 1.12
LRPPRC-202ENST00000409659 PTGDRQ13258 359 aa22.07■■□□□ 1.12
LRPPRC-202ENST00000409659 IQCB1Q15051 598 aa22.07■■□□□ 1.12
LRPPRC-202ENST00000409659 ZNF174Q15697 407 aa22.07■■□□□ 1.12
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