RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404321.3

PTPRN2-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N2, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRN2, Length 1,374 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2-204ENST00000404321 SGPL1O95470 568 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRN2-204ENST00000404321 SLC25A27O95847 323 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRN2-204ENST00000404321 TFRCP02786 760 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
PTPRN2-204ENST00000404321 NOVP48745 357 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRN2-204ENST00000404321 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
PTPRN2-204ENST00000404321 CCDC96Q2M329 555 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRN2-204ENST00000404321 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
PTPRN2-204ENST00000404321 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
PTPRN2-204ENST00000404321 RPTORQ8N122 1335 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRN2-204ENST00000404321 STRNO43815 780 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRN2-204ENST00000404321 NEFLP07196 543 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRN2-204ENST00000404321 TOP1P11387 765 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
PTPRN2-204ENST00000404321 FCER1AP12319 257 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRN2-204ENST00000404321 SNAP25P60880 206 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRN2-204ENST00000404321 MMP19Q99542 508 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRN2-204ENST00000404321 TEX13BQ9BXU2 312 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRN2-204ENST00000404321 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRN2-204ENST00000404321 RIPK3Q9Y572 518 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRN2-204ENST00000404321 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
PTPRN2-204ENST00000404321 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
PTPRN2-204ENST00000404321 SGSM2O43147 1006 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRN2-204ENST00000404321 PGK2P07205 417 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRN2-204ENST00000404321 HOXC6P09630 235 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRN2-204ENST00000404321 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
PTPRN2-204ENST00000404321 CYP2C19P33261 490 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRN2-204ENST00000404321 STAT2P52630 851 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRN2-204ENST00000404321 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRN2-204ENST00000404321 RCSD1Q6JBY9 416 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRN2-204ENST00000404321 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRN2-204ENST00000404321 MYH4Q9Y623 1939 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRN2-204ENST00000404321 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
PTPRN2-204ENST00000404321 MFSD14CQ5VZR4 134 aa21.39■■□□□ 1.02
PTPRN2-204ENST00000404321 CHURC1Q8WUH1 139 aa21.39■■□□□ 1.02
PTPRN2-204ENST00000404321 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
PTPRN2-204ENST00000404321 SLC16A2P36021 539 aa21.38■■□□□ 1.01
PTPRN2-204ENST00000404321 KCTD2Q14681 263 aa21.38■■□□□ 1.01
PTPRN2-204ENST00000404321 TTBK2Q6IQ55 1244 aa21.38■■□□□ 1.01
PTPRN2-204ENST00000404321 FAM160B2Q86V87 743 aa21.38■■□□□ 1.01
PTPRN2-204ENST00000404321 ABRAQ8N0Z2 381 aa21.38■■□□□ 1.01
PTPRN2-204ENST00000404321 GPCPD1Q9NPB8 672 aa21.38■■□□□ 1.01
PTPRN2-204ENST00000404321 HOMER2Q9NSB8 354 aa21.38■■□□□ 1.01
PTPRN2-204ENST00000404321 PARP14Q460N5 1801 aa21.38■■□□□ 1.01
PTPRN2-204ENST00000404321 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
PTPRN2-204ENST00000404321 CCDC174Q6PII3 467 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRN2-204ENST00000404321 DCAF4Q8WV16 495 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRN2-204ENST00000404321 ZSWIM5Q9P217 1185 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRN2-204ENST00000404321 CYP21A2P08686 494 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRN2-204ENST00000404321 CNGA1P29973 690 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRN2-204ENST00000404321 COPB2P35606 906 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRN2-204ENST00000404321 IQCA1Q86XH1 822 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRN2-204ENST00000404321 AGBL1Q96MI9 1066 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRN2-204ENST00000404321 TTC14Q96N46 770 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRN2-204ENST00000404321 KRT23Q9C075 422 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRN2-204ENST00000404321 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRN2-204ENST00000404321 PRR12Q9ULL5 1215 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRN2-204ENST00000404321 TAF6LQ9Y6J9 622 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRN2-204ENST00000404321 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
PTPRN2-204ENST00000404321 ATP2A1O14983 1001 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRN2-204ENST00000404321 PDHBP11177 359 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRN2-204ENST00000404321 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
PTPRN2-204ENST00000404321 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
PTPRN2-204ENST00000404321 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
PTPRN2-204ENST00000404321 CNNM2Q9H8M5 875 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRN2-204ENST00000404321 SLC5A4Q9NY91 659 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRN2-204ENST00000404321 BMP2KLQ5H9B9 411 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRN2-204ENST00000404321 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
PTPRN2-204ENST00000404321 TRPV1Q8NER1 839 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRN2-204ENST00000404321 MAML3Q96JK9 1138 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRN2-204ENST00000404321 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
PTPRN2-204ENST00000404321 TNKSO95271 1327 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRN2-204ENST00000404321 GOLGA8HP0CJ92 632 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRN2-204ENST00000404321 OAZ1P54368 228 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRN2-204ENST00000404321 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRN2-204ENST00000404321 OLFML2BQ68BL8 750 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRN2-204ENST00000404321 CYB5R4Q7L1T6 521 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRN2-204ENST00000404321 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRN2-204ENST00000404321 DGKHQ86XP1 1220 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRN2-204ENST00000404321 DDX11Q96FC9 970 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRN2-204ENST00000404321 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRN2-204ENST00000404321 UBAC1Q9BSL1 405 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRN2-204ENST00000404321 KAT14Q9H8E8 782 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRN2-204ENST00000404321 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
PTPRN2-204ENST00000404321 ZNF536O15090 1300 aa21.33■■□□□ 1.01
PTPRN2-204ENST00000404321 LAMA4Q16363 1823 aa21.33■■□□□ 1.01
PTPRN2-204ENST00000404321 PLA2G6O60733 806 aa21.33■■□□□ 1
PTPRN2-204ENST00000404321 IGHA2P01877 340 aa21.33■■□□□ 1
PTPRN2-204ENST00000404321 ZNF543Q08ER8 600 aa21.33■■□□□ 1
PTPRN2-204ENST00000404321 SYDE2Q5VT97 1194 aa21.33■■□□□ 1
PTPRN2-204ENST00000404321 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa21.33■■□□□ 1
PTPRN2-204ENST00000404321 PNMA1Q8ND90 353 aa21.33■■□□□ 1
PTPRN2-204ENST00000404321 MAP4K1Q92918 833 aa21.33■■□□□ 1
PTPRN2-204ENST00000404321 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa21.33■■□□□ 1
PTPRN2-204ENST00000404321 FDX1P10109 184 aa21.32■■□□□ 1
PTPRN2-204ENST00000404321 ALAS1P13196 640 aa21.32■■□□□ 1
PTPRN2-204ENST00000404321 TRDNQ13061 729 aa21.32■■□□□ 1
PTPRN2-204ENST00000404321 ZNF792Q3KQV3 632 aa21.32■■□□□ 1
PTPRN2-204ENST00000404321 CCDC178Q5BJE1 867 aa21.32■■□□□ 1
PTPRN2-204ENST00000404321 LHX8Q68G74 356 aa21.32■■□□□ 1
PTPRN2-204ENST00000404321 STOX1Q6ZVD7 989 aa21.32■■□□□ 1
PTPRN2-204ENST00000404321 ANKRD35Q8N283 1001 aa21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms