RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384557.1

RNU6-1274P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1274, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1274P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1274P-201ENST00000384557 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 GFOD1Q9NXC2 390 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 NDOR1Q9UHB4 597 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 MAPRE3Q9UPY8 281 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 SIGLEC6O43699 453 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 CBX7O95931 251 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 CPP00450 1065 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 GSNP06396 782 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 FAM87AP0C7U9 286 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 NAT1P18440 290 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 HOXC12P31275 282 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 AMPD3Q01432 767 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 POU4F1Q01851 419 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 CYP27A1Q02318 531 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 ADGRE1Q14246 886 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 NFKBIBQ15653 356 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 CYP27C1Q4G0S4 372 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 FOXB2Q5VYV0 432 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 AHI1Q8N157 1196 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 MFSD4AQ8N468 514 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 OSBP2Q969R2 916 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 MRGPRX3Q96LB0 322 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 DUSP23Q9BVJ7 150 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 PRDM14Q9GZV8 571 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 CHST7Q9NS84 486 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 GPATCH2Q9NW75 528 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 RNF112Q9ULX5 631 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 B4E1Z4 1266 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 ALG1L2C9J202 215 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 MEIS1O00470 390 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 AQP7O14520 342 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 TBX1O43435 398 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 WIPF1O43516 503 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 OPA1O60313 960 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 PRAMEF1O95521 474 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 EOMESO95936 686 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 CD3EP07766 207 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 ECI1P42126 302 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 NOP2P46087 812 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 GFRA1P56159 465 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 RBM10P98175 930 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 NFKB2Q00653 900 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 TRIM61Q5EBN2 209 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 CNNM4Q6P4Q7 775 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 C22orf34Q6ZV56 151 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 USP53Q70EK8 1073 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 BRAPQ7Z569 592 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 FERMT3Q86UX7 667 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 LRRTM3Q86VH5 581 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 THNSL2Q86YJ6 484 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 CLEC10AQ8IUN9 316 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 KSR1Q8IVT5 923 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 DTWD2Q8NBA8 298 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 ATL2Q8NHH9 583 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 RIN3Q8TB24 985 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 PTPRN2Q92932 1015 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 VWCEQ96DN2 955 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 TBC1D32Q96NH3 1257 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 LGR4Q9BXB1 951 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 CYP26B1Q9NR63 512 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 HOMER2Q9NSB8 354 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 ADAMTS8Q9UP79 889 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 FAM181BA6NEQ2 426 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 GSG1L2A8MUP6 293 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 STXBP3O00186 592 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP3.21□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 MARCH6O60337 910 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 DLX3O60479 287 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 LRRN2O75325 713 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 LEFTY1O75610 366 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 ASLP04424 464 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 SCG5P05408 212 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 IGFALSP35858 605 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-1274P-201ENST00000384557 GRIA2P42262 883 aa3.21□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76 ms