RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384310.1

RNU6-339P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 339, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-339P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-339P-201ENST00000384310 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 LILRB5O75023 590 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 ADAM11O75078 769 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 DLGAP3O95886 979 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 APBA3O96018 575 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 CST3P01034 146 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 ALBP02768 609 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 CAPNS1P04632 268 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 NTF4P34130 210 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 ID4P47928 161 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 GFRA1P56159 465 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 PTPN21Q16825 1174 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 LONRF3Q496Y0 759 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 IQSEC1Q6DN90 963 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 USP53Q70EK8 1073 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 BRF1Q92994 677 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 CHST12Q9NRB3 414 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 CRIM1Q9NZV1 1036 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 IP6K2Q9UHH9 426 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 GGA1Q9UJY5 639 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 STARD13Q9Y3M8 1113 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 TRAF6Q9Y4K3 522 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 M0R2C6 588 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 AQP7O14520 342 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 SHOXO15266 292 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 SH3BP5O60239 455 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 PPFIA3O75145 1194 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 RFPL1O75677 317 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 ABLIM3O94929 683 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 CRTAMO95727 393 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 NEFMP07197 916 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 CAP2P40123 477 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 ECI1P42126 302 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 GRB10Q13322 594 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 TCIRG1Q13488 830 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 AUHQ13825 339 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 TTLL4Q14679 1199 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 PPP2R5DQ14738 602 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 RALBP1Q15311 655 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 SF1Q15637 639 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 VPS72Q15906 364 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 NTRK3Q16288 839 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 NBPF9Q3BBW0 867 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 ANKRD39Q53RE8 183 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 MSL1Q68DK7 614 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 UBE3DQ7Z6J8 389 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 ANKLE2Q86XL3 938 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 DGKHQ86XP1 1220 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 MAP4K3Q8IVH8 894 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 TMEM145Q8NBT3 493 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 GALNT11Q8NCW6 608 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 UBASH3BQ8TF42 649 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 IL17RAQ96F46 866 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 WNK4Q96J92 1243 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 FANCD2OSQ96PS1 177 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 UBA5Q9GZZ9 404 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 ZNF700Q9H0M5 742 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 PIDD1Q9HB75 910 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 SAMD15Q9P1V8 674 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 FBXL21Q9UKT6 434 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 TNKSO95271 1327 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 VSTM5A8MXK1 200 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 GAS7O60861 476 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 PPFIA4O75335 1185 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 PRKD3O94806 890 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 MYBL2P10244 700 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 NAT1P18440 290 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 PAX3P23760 479 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 CD68P34810 354 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP4.98□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 MMRN1Q13201 1228 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 C20orf204Q6ZNR8 217 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 ARMCX6Q7L4S7 300 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 TICAM2Q86XR7 235 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-339P-201ENST00000384310 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.1 ms