RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368078.7

CASQ1-201, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASQ1, Length 1,897 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-201ENST00000368078 BRMS1Q9HCU9 246 aa17.64■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 GPRC5DQ9NZD1 345 aa17.64■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 PCDHA4Q9UN74 947 aa17.64■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 SLC1A4P43007 532 aa17.63■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa17.63■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa17.63■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa17.63■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 DEFB129Q9H1M3 183 aa17.63■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 RNF181Q9P0P0 153 aa17.63■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa17.63■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 PHF20L1A8MW92 1017 aa17.63■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 CAP2P40123 477 aa17.63■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 NAPAP54920 295 aa17.63■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP17.63■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP17.63■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 SPICE1Q8N0Z3 855 aa17.63■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 ENGASEQ8NFI3 743 aa17.63■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP17.63■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 PCDHA6Q9UN73 950 aa17.63■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa17.63■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 SMCO2A6NFE2 343 aa17.62■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 M0R2N6 131 aa17.62■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 NDUFB10O96000 172 aa17.62■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP17.62■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 GRIN1Q05586 938 aa17.62■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF174Q15697 407 aa17.62■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP17.62■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 DCAF4Q8WV16 495 aa17.62■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP17.61■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 PPP6R2O75170 966 aa17.61■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 CALML3P27482 149 aa17.61■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 NDUFA8P51970 172 aa17.61■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 SNAP25P60880 206 aa17.61■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 TNFAIP1Q13829 316 aa17.61■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP17.61■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 RBSNQ9H1K0 784 aa17.61■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 GRPEL1Q9HAV7 217 aa17.61■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP17.61■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 FZD1Q9UP38 647 aa17.61■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 A0A1W2PQ27 194 aa17.61■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 A0A1W2PQ64 194 aa17.61■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 A0A1W2PQD8 194 aa17.61■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 SPECC1Q5M775 1068 aa17.61■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 CKAP2LQ8IYA6 745 aa17.61■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa17.61■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP17.61■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 ZMYND12Q9H0C1 365 aa17.61■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 C9orf131Q5VYM1 1079 aa17.6■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 SHC4Q6S5L8 630 aa17.6■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 CCDC148Q8NFR7 591 aa17.6■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 NUP62CLQ9H1M0 184 aa17.6■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 SMCHD1A6NHR9 2005 aa17.59■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 ATAD5Q96QE3 1844 aa17.59■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP17.59■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa17.59■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 TRIM75PA6NK02 468 aa17.59■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM232C9JQI7 657 aa17.59■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP17.59■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 DLK2Q6UY11 383 aa17.59■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 MTMR8Q96EF0 704 aa17.59■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 CLSTN2Q9H4D0 955 aa17.59■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 CMA1P23946 247 aa17.58■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 FAM160A1Q05DH4 1040 aa17.58■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 TTC38Q5R3I4 469 aa17.58■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa17.58■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP17.58■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 DAGLBQ8NCG7 672 aa17.58■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 TNMDQ9H2S6 317 aa17.58■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa17.58■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP17.58■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 TMX2Q9Y320 296 aa17.58■□□□□ 0.41
CASQ1-201ENST00000368078 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP17.58■□□□□ 0.4
CASQ1-201ENST00000368078 BMP3P12645 472 aa17.58■□□□□ 0.4
CASQ1-201ENST00000368078 GMCL1Q96IK5 515 aa17.58■□□□□ 0.4
CASQ1-201ENST00000368078 PANK2Q9BZ23 570 aa17.58■□□□□ 0.4
CASQ1-201ENST00000368078 C6orf50Q9HD87 102 aa17.58■□□□□ 0.4
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM260Q9NX78 707 aa17.58■□□□□ 0.4
CASQ1-201ENST00000368078 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP17.58■□□□□ 0.4
CASQ1-201ENST00000368078 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.4
CASQ1-201ENST00000368078 ZBTB5O15062 677 aa17.57■□□□□ 0.4
CASQ1-201ENST00000368078 PTPREP23469 700 aa17.57■□□□□ 0.4
CASQ1-201ENST00000368078 MRE11P49959 708 aa17.57■□□□□ 0.4
CASQ1-201ENST00000368078 INF2Q27J81 1249 aa17.57■□□□□ 0.4
CASQ1-201ENST00000368078 GALNT17Q6IS24 598 aa17.57■□□□□ 0.4
CASQ1-201ENST00000368078 JMYQ8N9B5 988 aa17.57■□□□□ 0.4
CASQ1-201ENST00000368078 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP17.57■□□□□ 0.4
CASQ1-201ENST00000368078 FUCA2Q9BTY2 467 aa17.57■□□□□ 0.4
CASQ1-201ENST00000368078 TSPY26PQ9H489 355 aa17.57■□□□□ 0.4
CASQ1-201ENST00000368078 GGA3Q9NZ52 723 aa17.57■□□□□ 0.4
CASQ1-201ENST00000368078 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa17.56■□□□□ 0.4
CASQ1-201ENST00000368078 CUTAO60888 179 aa17.56■□□□□ 0.4
CASQ1-201ENST00000368078 PFKFB1P16118 471 aa17.56■□□□□ 0.4
CASQ1-201ENST00000368078 INPP5BP32019 993 aa17.56■□□□□ 0.4
CASQ1-201ENST00000368078 MCM7P33993 719 aa17.56■□□□□ 0.4
CASQ1-201ENST00000368078 MAP3K11Q16584 847 aa17.56■□□□□ 0.4
CASQ1-201ENST00000368078 QRICH1Q2TAL8 776 aa17.56■□□□□ 0.4
CASQ1-201ENST00000368078 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP17.56■□□□□ 0.4
CASQ1-201ENST00000368078 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa17.56■□□□□ 0.4
CASQ1-201ENST00000368078 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.8 ms