RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367576.5

LTV1-201, Transcript of LTV1 ribosome biogenesis factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTV1, Length 1,847 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1-201ENST00000367576 CSADQ9Y600 493 aa20.52■□□□□ 0.88
LTV1-201ENST00000367576 XBP1P17861 261 aa20.51■□□□□ 0.87
LTV1-201ENST00000367576 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa20.51■□□□□ 0.87
LTV1-201ENST00000367576 ELP3Q9H9T3 547 aa20.51■□□□□ 0.87
LTV1-201ENST00000367576 CNPY2Q9Y2B0 182 aa20.51■□□□□ 0.87
LTV1-201ENST00000367576 SMARCA1P28370 1054 aa20.5■□□□□ 0.87
LTV1-201ENST00000367576 MCM4P33991 863 aa20.5■□□□□ 0.87
LTV1-201ENST00000367576 SYDE2Q5VT97 1194 aa20.5■□□□□ 0.87
LTV1-201ENST00000367576 TYW1BQ6NUM6 668 aa20.5■□□□□ 0.87
LTV1-201ENST00000367576 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
LTV1-201ENST00000367576 ZNF280CQ8ND82 737 aa20.5■□□□□ 0.87
LTV1-201ENST00000367576 OXER1Q8TDS5 423 aa20.5■□□□□ 0.87
LTV1-201ENST00000367576 GDPD2Q9HCC8 539 aa20.5■□□□□ 0.87
LTV1-201ENST00000367576 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa20.5■□□□□ 0.87
LTV1-201ENST00000367576 WDR18Q9BV38 432 aa20.5■□□□□ 0.87
LTV1-201ENST00000367576 PHF20Q9BVI0 1012 aa20.5■□□□□ 0.87
LTV1-201ENST00000367576 BTBD18B2RXH4 712 aa20.49■□□□□ 0.87
LTV1-201ENST00000367576 STXBP3O00186 592 aa20.49■□□□□ 0.87
LTV1-201ENST00000367576 HMGCS2P54868 508 aa20.49■□□□□ 0.87
LTV1-201ENST00000367576 NLRP5P59047 1200 aa20.49■□□□□ 0.87
LTV1-201ENST00000367576 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP20.49■□□□□ 0.87
LTV1-201ENST00000367576 CLEC17AQ6ZS10 378 aa20.49■□□□□ 0.87
LTV1-201ENST00000367576 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
LTV1-201ENST00000367576 EMILIN3Q9NT22 766 aa20.49■□□□□ 0.87
LTV1-201ENST00000367576 FBXO28Q9NVF7 368 aa20.49■□□□□ 0.87
LTV1-201ENST00000367576 PHIPQ8WWQ0 1821 aa20.49■□□□□ 0.87
LTV1-201ENST00000367576 ADAMTS3O15072 1205 aa20.48■□□□□ 0.87
LTV1-201ENST00000367576 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
LTV1-201ENST00000367576 STAT2P52630 851 aa20.48■□□□□ 0.87
LTV1-201ENST00000367576 NR5A1Q13285 461 aa20.48■□□□□ 0.87
LTV1-201ENST00000367576 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
LTV1-201ENST00000367576 ARMC9Q7Z3E5 817 aa20.48■□□□□ 0.87
LTV1-201ENST00000367576 COA7Q96BR5 231 aa20.48■□□□□ 0.87
LTV1-201ENST00000367576 FIBPO43427 364 aa20.48■□□□□ 0.87
LTV1-201ENST00000367576 NAPAP54920 295 aa20.48■□□□□ 0.87
LTV1-201ENST00000367576 BACE1P56817 501 aa20.48■□□□□ 0.87
LTV1-201ENST00000367576 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa20.48■□□□□ 0.87
LTV1-201ENST00000367576 KIFC2Q96AC6 838 aa20.48■□□□□ 0.87
LTV1-201ENST00000367576 TANGO6Q9C0B7 1094 aa20.48■□□□□ 0.87
LTV1-201ENST00000367576 BARHL2Q9NY43 387 aa20.48■□□□□ 0.87
LTV1-201ENST00000367576 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
LTV1-201ENST00000367576 PRR12Q9ULL5 1215 aa20.48■□□□□ 0.87
LTV1-201ENST00000367576 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa20.47■□□□□ 0.87
LTV1-201ENST00000367576 ZBTB5O15062 677 aa20.47■□□□□ 0.87
LTV1-201ENST00000367576 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
LTV1-201ENST00000367576 VCAM1P19320 739 aa20.47■□□□□ 0.87
LTV1-201ENST00000367576 KRT2P35908 639 aa20.47■□□□□ 0.87
LTV1-201ENST00000367576 QRICH1Q2TAL8 776 aa20.47■□□□□ 0.87
LTV1-201ENST00000367576 OTUD5Q96G74 571 aa20.47■□□□□ 0.87
LTV1-201ENST00000367576 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP20.47■□□□□ 0.875e-6■■■■■ 32.2
LTV1-201ENST00000367576 WDR46O15213 610 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
LTV1-201ENST00000367576 USP14P54578 494 aa20.46■□□□□ 0.87
LTV1-201ENST00000367576 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
LTV1-201ENST00000367576 NPY5RQ15761 445 aa20.46■□□□□ 0.87
LTV1-201ENST00000367576 BTNL9Q6UXG8 535 aa20.46■□□□□ 0.87
LTV1-201ENST00000367576 LPAR1Q92633 364 aa20.46■□□□□ 0.87
LTV1-201ENST00000367576 MTMR8Q96EF0 704 aa20.46■□□□□ 0.87
LTV1-201ENST00000367576 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa20.46■□□□□ 0.87
LTV1-201ENST00000367576 TPRNQ4KMQ1 711 aa20.46■□□□□ 0.87
LTV1-201ENST00000367576 CCDC148Q8NFR7 591 aa20.46■□□□□ 0.87
LTV1-201ENST00000367576 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
LTV1-201ENST00000367576 SH3GLB2Q9NR46 395 aa20.46■□□□□ 0.87
LTV1-201ENST00000367576 FAM205CA6NFA0 338 aa20.45■□□□□ 0.86
LTV1-201ENST00000367576 MAP3K11Q16584 847 aa20.45■□□□□ 0.86
LTV1-201ENST00000367576 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
LTV1-201ENST00000367576 BRAPQ7Z569 592 aa20.45■□□□□ 0.86
LTV1-201ENST00000367576 RGS22Q8NE09 1264 aa20.45■□□□□ 0.86
LTV1-201ENST00000367576 BRMS1Q9HCU9 246 aa20.45■□□□□ 0.86
LTV1-201ENST00000367576 MYH15Q9Y2K3 1946 aa20.44■□□□□ 0.86
LTV1-201ENST00000367576 GOLGA6L22H0YM25 854 aa20.44■□□□□ 0.86
LTV1-201ENST00000367576 CELF2O95319 508 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
LTV1-201ENST00000367576 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP20.44■□□□□ 0.864e-7■□□□□ 10.4
LTV1-201ENST00000367576 KRT85P78386 507 aa20.44■□□□□ 0.86
LTV1-201ENST00000367576 CCDC174Q6PII3 467 aa20.44■□□□□ 0.86
LTV1-201ENST00000367576 NOSTRINQ8IVI9 506 aa20.44■□□□□ 0.86
LTV1-201ENST00000367576 RASGRP4Q8TDF6 673 aa20.44■□□□□ 0.86
LTV1-201ENST00000367576 CHURC1Q8WUH1 139 aa20.44■□□□□ 0.86
LTV1-201ENST00000367576 FEM1BQ9UK73 627 aa20.44■□□□□ 0.86
LTV1-201ENST00000367576 DDX11L8A8MPP1 907 aa20.43■□□□□ 0.86
LTV1-201ENST00000367576 USH1GQ495M9 461 aa20.43■□□□□ 0.86
LTV1-201ENST00000367576 MYSM1Q5VVJ2 828 aa20.43■□□□□ 0.86
LTV1-201ENST00000367576 CHADLQ6NUI6 762 aa20.43■□□□□ 0.86
LTV1-201ENST00000367576 FAM160B2Q86V87 743 aa20.43■□□□□ 0.86
LTV1-201ENST00000367576 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
LTV1-201ENST00000367576 TMOD4Q9NZQ9 345 aa20.43■□□□□ 0.86
LTV1-201ENST00000367576 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
LTV1-201ENST00000367576 FLOT1O75955 427 aa20.43■□□□□ 0.86
LTV1-201ENST00000367576 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
LTV1-201ENST00000367576 ERO1BQ86YB8 467 aa20.43■□□□□ 0.86
LTV1-201ENST00000367576 BLIDQ8IZY5 108 aa20.43■□□□□ 0.86
LTV1-201ENST00000367576 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
LTV1-201ENST00000367576 PCDHA4Q9UN74 947 aa20.43■□□□□ 0.86
LTV1-201ENST00000367576 SMCO2A6NFE2 343 aa20.42■□□□□ 0.86
LTV1-201ENST00000367576 SPDYE5A6NIY4 337 aa20.42■□□□□ 0.86
LTV1-201ENST00000367576 C19orf81C9J6K1 198 aa20.42■□□□□ 0.86
LTV1-201ENST00000367576 CALML3P27482 149 aa20.42■□□□□ 0.86
LTV1-201ENST00000367576 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
LTV1-201ENST00000367576 OPTNQ96CV9 577 aa20.42■□□□□ 0.86
LTV1-201ENST00000367576 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
LTV1-201ENST00000367576 USP28Q96RU2 1077 aa20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms