RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP22.36■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa22.36■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM94Q12767 1356 aa22.36■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa22.36■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 SCNN1DP51172 638 aa22.36■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 ITIH3Q06033 890 aa22.36■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 PKP1Q13835 747 aa22.36■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC125Q86Z20 511 aa22.36■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 FAM178BQ8IXR5 827 aa22.36■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 ZMYND15Q9H091 742 aa22.36■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 H0YCG3 227 aa22.36■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF827Q17R98 1081 aa22.36■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 ADCK5Q3MIX3 580 aa22.36■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 FAM26FQ5R3K3 315 aa22.36■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 RAB17Q9H0T7 212 aa22.36■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 APOA5Q6Q788 366 aa22.36■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 MCF2L2Q86YR7 1114 aa22.36■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 ATG3Q9NT62 314 aa22.36■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 FANCLQ9NW38 375 aa22.36■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 TRAPPC10P48553 1259 aa22.35■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa22.35■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 HAUS4Q9H6D7 363 aa22.35■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 XDHP47989 1333 aa22.35■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 GBP6Q6ZN66 633 aa22.35■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 KRT26Q7Z3Y9 468 aa22.35■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 FAM184BQ9ULE4 1060 aa22.35■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 SAMD9Q5K651 1589 aa22.35■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 ATP7BP35670 1465 aa22.35■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 MBD5Q9P267 1494 aa22.35■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 M0QZ92 97 aa22.35■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 SLC39A14Q15043 492 aa22.35■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 PPP2R5EQ16537 467 aa22.35■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 ARHGEF16Q5VV41 709 aa22.35■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 UNC5CLQ8IV45 518 aa22.35■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 HACE1Q8IYU2 909 aa22.35■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 MAGEF1Q9HAY2 307 aa22.35■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa22.35■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.35■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 NDUFA8P51970 172 aa22.35■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 GEN1Q17RS7 908 aa22.35■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 HSPA1LP34931 641 aa22.34■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 CLIC6Q96NY7 704 aa22.34■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 TRPC6Q9Y210 931 aa22.34■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 ERVK-7P63135 1459 aa22.34■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 ETF1P62495 437 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 LRMPQ12912 555 aa22.34■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 DOK7Q18PE1 504 aa22.34■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 PARP2Q9UGN5 583 aa22.34■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 STMN2Q93045 179 aa22.34■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 MLXIPQ9HAP2 919 aa22.34■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 PANK4Q9NVE7 773 aa22.34■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 CCT6BQ92526 530 aa22.34■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 GMNNO75496 209 aa22.33■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 RPN1P04843 607 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa22.33■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 XKR9Q5GH70 373 aa22.33■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 GSDMAQ96QA5 445 aa22.33■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 FAM102BQ5T8I3 360 aa22.33■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 TBC1D31Q96DN5 1066 aa22.33■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 PLA2G4DQ86XP0 818 aa22.33■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa22.33■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 KRT71Q3SY84 523 aa22.32■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 C10orf67Q8IYJ2 551 aa22.32■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 AMNQ9BXJ7 453 aa22.32■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 CLIC4Q9Y696 253 aa22.32■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 LONRF2Q1L5Z9 754 aa22.32■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 TEKT3Q9BXF9 490 aa22.32■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 CUEDC2Q9H467 287 aa22.32■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC160A6NGH7 325 aa22.32■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 LAD1O00515 517 aa22.32■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 HHATQ5VTY9 493 aa22.32■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 HYOU1Q9Y4L1 999 aa22.32■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF521Q96K83 1311 aa22.32■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM232C9JQI7 657 aa22.32■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF853P0CG23 659 aa22.32■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 BRD3Q15059 726 aa22.32■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 SLC5A4Q9NY91 659 aa22.32■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 KRT15P19012 456 aa22.31■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 ABCB4P21439 1286 aa22.31■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 LIG4P49917 911 aa22.31■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 TMC4Q7Z404 712 aa22.31■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 CIB2O75838 187 aa22.31■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 TCP1P17987 556 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 DESI2Q9BSY9 194 aa22.31■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 EFCAB6Q5THR3 1501 aa22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.8 ms