RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358813.4

CCL20-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 800 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-201ENST00000358813 TKFCQ3LXA3 575 aa7.36□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 NKAPLQ5M9Q1 402 aa7.36□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 EHMT1Q9H9B1 1298 aa7.36□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa7.36□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 DCCP43146 1447 aa7.35□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 TET3O43151 1660 aa7.35□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 ASMTLO95671 621 aa7.35□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 ECEL1O95672 775 aa7.35□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 CTSBP07858 339 aa7.35□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 PDE3AQ14432 1141 aa7.35□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 SCARA3Q6AZY7 606 aa7.35□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 LLGL2Q6P1M3 1020 aa7.35□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 FERMT3Q86UX7 667 aa7.35□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa7.35□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 CCDC136Q96JN2 1154 aa7.35□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 SEMA6BQ9H3T3 888 aa7.35□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 RAD18Q9NS91 495 aa7.35□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 PFDN2Q9UHV9 154 aa7.35□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 LMTK2Q8IWU2 1503 aa7.35□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa7.35□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 PTPN23Q9H3S7 1636 aa7.34□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 ATE1O95260 518 aa7.34□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 PREPP48147 710 aa7.34□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
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CCL20-201ENST00000358813 FAM178BQ8IXR5 827 aa7.34□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 SUGCTQ9HAC7 445 aa7.34□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 HOMER2Q9NSB8 354 aa7.34□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 ZMYM5Q9UJ78 669 aa7.34□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa7.34□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 CROCC2H7BZ55 1655 aa7.34□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 ABCC5O15440 1437 aa7.34□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 NOS1P29475 1434 aa7.34□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 SETD5Q9C0A6 1442 aa7.34□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 GCC2Q8IWJ2 1684 aa7.33□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 DHX15O43143 795 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
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CCL20-201ENST00000358813 GAS2O43903 313 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 H2AFB1P0C5Y9 115 aa7.33□□□□□ -1.24
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CCL20-201ENST00000358813 ARNTP27540 789 aa7.33□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 CNGA1P29973 690 aa7.33□□□□□ -1.24
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CCL20-201ENST00000358813 JDP2Q8WYK2 163 aa7.33□□□□□ -1.24
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CCL20-201ENST00000358813 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa7.33□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 SLC12A7Q9Y666 1083 aa7.33□□□□□ -1.24
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CCL20-201ENST00000358813 A0A1W2PQH9 124 aa7.32□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
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CCL20-201ENST00000358813 DRD2P14416 443 aa7.32□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP7.32□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 AKAP4Q5JQC9 854 aa7.32□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 ODR4Q5SWX8 454 aa7.32□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 RASIP1Q5U651 963 aa7.32□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 PRR23CQ6ZRP0 262 aa7.32□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 ARMC10Q8N2F6 343 aa7.32□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 MYRFLQ96LU7 910 aa7.32□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 TM9SF2Q99805 663 aa7.32□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 MYH16Q9H6N6 1097 aa7.32□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 ZFYVE9O95405 1425 aa7.32□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 TIAF1O95411 115 aa7.31□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 BMP3P12645 472 aa7.31□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 LIG1P18858 919 aa7.31□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
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CCL20-201ENST00000358813 TMEM67Q5HYA8 995 aa7.31□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 EEPD1Q7L9B9 569 aa7.31□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 TTC6Q86TZ1 520 aa7.31□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 FMNL3Q8IVF7 1028 aa7.31□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 STK35Q8TDR2 534 aa7.31□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 IER2Q9BTL4 223 aa7.31□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 PCGF6Q9BYE7 350 aa7.31□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 KCNF1Q9H3M0 494 aa7.31□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 RAXQ9Y2V3 346 aa7.31□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 CD2APQ9Y5K6 639 aa7.31□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 MST1RQ04912 1400 aa7.3□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 PTCH1Q13635 1447 aa7.3□□□□□ -1.24
CCL20-201ENST00000358813 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa7.3□□□□□ -1.24
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