RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345716.8

NISCH-201, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,238 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-201ENST00000345716 TICAM2Q86XR7 235 aa22.99■■□□□ 1.27
NISCH-201ENST00000345716 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa22.99■■□□□ 1.27
NISCH-201ENST00000345716 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
NISCH-201ENST00000345716 INCENPQ9NQS7 918 aa22.99■■□□□ 1.27
NISCH-201ENST00000345716 NRKQ7Z2Y5 1582 aa22.99■■□□□ 1.27
NISCH-201ENST00000345716 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
NISCH-201ENST00000345716 NRBP1Q9UHY1 535 aa22.99■■□□□ 1.27
NISCH-201ENST00000345716 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP22.99■■□□□ 1.27
NISCH-201ENST00000345716 BBOX1O75936 387 aa22.99■■□□□ 1.27
NISCH-201ENST00000345716 GSDMAQ96QA5 445 aa22.99■■□□□ 1.27
NISCH-201ENST00000345716 PYCARDQ9ULZ3 195 aa22.99■■□□□ 1.27
NISCH-201ENST00000345716 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa22.99■■□□□ 1.27
NISCH-201ENST00000345716 SLFN12Q8IYM2 578 aa22.98■■□□□ 1.27
NISCH-201ENST00000345716 CNKSR1Q969H4 720 aa22.98■■□□□ 1.27
NISCH-201ENST00000345716 VTI1AQ96AJ9 217 aa22.98■■□□□ 1.27
NISCH-201ENST00000345716 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
NISCH-201ENST00000345716 SLC39A2Q9NP94 309 aa22.98■■□□□ 1.27
NISCH-201ENST00000345716 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
NISCH-201ENST00000345716 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa22.98■■□□□ 1.27
NISCH-201ENST00000345716 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
NISCH-201ENST00000345716 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
NISCH-201ENST00000345716 PTPRMP28827 1452 aa22.98■■□□□ 1.27
NISCH-201ENST00000345716 SYNE4Q8N205 404 aa22.98■■□□□ 1.27
NISCH-201ENST00000345716 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
NISCH-201ENST00000345716 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
NISCH-201ENST00000345716 MIER3Q7Z3K6 550 aa22.97■■□□□ 1.27
NISCH-201ENST00000345716 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa22.97■■□□□ 1.27
NISCH-201ENST00000345716 CEP104O60308 925 aa22.97■■□□□ 1.27
NISCH-201ENST00000345716 STX10O60499 249 aa22.97■■□□□ 1.27
NISCH-201ENST00000345716 USP17L8P0C7I0 530 aa22.97■■□□□ 1.27
NISCH-201ENST00000345716 RDH13Q8NBN7 331 aa22.97■■□□□ 1.27
NISCH-201ENST00000345716 CCDC17Q96LX7 622 aa22.97■■□□□ 1.27
NISCH-201ENST00000345716 BCL2L12Q9HB09 334 aa22.97■■□□□ 1.27
NISCH-201ENST00000345716 PANK4Q9NVE7 773 aa22.97■■□□□ 1.27
NISCH-201ENST00000345716 TMEM232C9JQI7 657 aa22.97■■□□□ 1.27
NISCH-201ENST00000345716 TSC1Q92574 1164 aa22.97■■□□□ 1.27
NISCH-201ENST00000345716 NOP56O00567 594 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
NISCH-201ENST00000345716 MECOMQ03112 1051 aa22.97■■□□□ 1.27
NISCH-201ENST00000345716 GRM1Q13255 1194 aa22.97■■□□□ 1.27
NISCH-201ENST00000345716 TRIM37O94972 964 aa22.96■■□□□ 1.27
NISCH-201ENST00000345716 POLR2MP0CAP2 368 aa22.96■■□□□ 1.27
NISCH-201ENST00000345716 ETF1P62495 437 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
NISCH-201ENST00000345716 ABCB5Q2M3G0 1257 aa22.96■■□□□ 1.27
NISCH-201ENST00000345716 ASPRV1Q53RT3 343 aa22.96■■□□□ 1.27
NISCH-201ENST00000345716 CLEC4GQ6UXB4 293 aa22.96■■□□□ 1.27
NISCH-201ENST00000345716 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
NISCH-201ENST00000345716 CRB1P82279 1406 aa22.96■■□□□ 1.27
NISCH-201ENST00000345716 BCRP11274 1271 aa22.96■■□□□ 1.27
NISCH-201ENST00000345716 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
NISCH-201ENST00000345716 TNFAIP1Q13829 316 aa22.96■■□□□ 1.27
NISCH-201ENST00000345716 DIXDC1Q155Q3 683 aa22.96■■□□□ 1.27
NISCH-201ENST00000345716 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.27
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NISCH-201ENST00000345716 UBL4BQ8N7F7 174 aa22.95■■□□□ 1.27
NISCH-201ENST00000345716 TSNARE1Q96NA8 513 aa22.95■■□□□ 1.27
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NISCH-201ENST00000345716 NLRX1Q86UT6 975 aa22.95■■□□□ 1.26
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NISCH-201ENST00000345716 SWAP70Q9UH65 585 aa22.95■■□□□ 1.26
NISCH-201ENST00000345716 SNAP23O00161 211 aa22.95■■□□□ 1.26
NISCH-201ENST00000345716 LAD1O00515 517 aa22.95■■□□□ 1.26
NISCH-201ENST00000345716 EBAG9O00559 213 aa22.95■■□□□ 1.26
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NISCH-201ENST00000345716 IFT20Q8IY31 132 aa22.95■■□□□ 1.26
NISCH-201ENST00000345716 DYNLL2Q96FJ2 89 aa22.95■■□□□ 1.26
NISCH-201ENST00000345716 IKBKBO14920 756 aa22.95■■□□□ 1.26
NISCH-201ENST00000345716 FAM26FQ5R3K3 315 aa22.95■■□□□ 1.26
NISCH-201ENST00000345716 TMEM87AQ8NBN3 555 aa22.95■■□□□ 1.26
NISCH-201ENST00000345716 GIMAP7Q8NHV1 300 aa22.95■■□□□ 1.26
NISCH-201ENST00000345716 TNS3Q68CZ2 1445 aa22.95■■□□□ 1.26
NISCH-201ENST00000345716 ARHGAP44Q17R89 818 aa22.95■■□□□ 1.26
NISCH-201ENST00000345716 RPS6KA1Q15418 735 aa22.94■■□□□ 1.26
NISCH-201ENST00000345716 TSKSQ9UJT2 592 aa22.94■■□□□ 1.26
NISCH-201ENST00000345716 BAG6P46379 1132 aa22.94■■□□□ 1.26
NISCH-201ENST00000345716 COPB1P53618 953 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
NISCH-201ENST00000345716 LIN9Q5TKA1 542 aa22.94■■□□□ 1.26
NISCH-201ENST00000345716 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa22.94■■□□□ 1.26
NISCH-201ENST00000345716 SAR1BQ9Y6B6 198 aa22.94■■□□□ 1.26
NISCH-201ENST00000345716 EEF2KMTQ96G04 330 aa22.94■■□□□ 1.26
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NISCH-201ENST00000345716 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
NISCH-201ENST00000345716 COBLO75128 1261 aa22.94■■□□□ 1.26
NISCH-201ENST00000345716 TTLL1O95922 423 aa22.94■■□□□ 1.26
NISCH-201ENST00000345716 CYP2J2P51589 502 aa22.94■■□□□ 1.26
NISCH-201ENST00000345716 CFAP221Q4G0U5 840 aa22.93■■□□□ 1.26
NISCH-201ENST00000345716 KLHL7Q8IXQ5 586 aa22.93■■□□□ 1.26
NISCH-201ENST00000345716 TTC14Q96N46 770 aa22.93■■□□□ 1.26
NISCH-201ENST00000345716 AZI2Q9H6S1 392 aa22.93■■□□□ 1.26
NISCH-201ENST00000345716 SLFN14P0C7P3 912 aa22.93■■□□□ 1.26
NISCH-201ENST00000345716 GRAPQ13588 217 aa22.93■■□□□ 1.26
NISCH-201ENST00000345716 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
NISCH-201ENST00000345716 ISCA1Q9BUE6 129 aa22.93■■□□□ 1.26
NISCH-201ENST00000345716 AMNQ9BXJ7 453 aa22.93■■□□□ 1.26
NISCH-201ENST00000345716 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa22.93■■□□□ 1.26
NISCH-201ENST00000345716 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
NISCH-201ENST00000345716 PEX26Q7Z412 305 aa22.92■■□□□ 1.26
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