RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 COBLO75128 1261 aa24.64■■□□□ 1.54
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PTPRM-201ENST00000332175 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 STAT1P42224 750 aa24.64■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF827Q17R98 1081 aa24.64■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 DENND2CQ68D51 928 aa24.64■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 CAPN12Q6ZSI9 719 aa24.64■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa24.64■■□□□ 1.54
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PTPRM-201ENST00000332175 CLIC6Q96NY7 704 aa24.64■■□□□ 1.54
PTPRM-201ENST00000332175 TEKT3Q9BXF9 490 aa24.64■■□□□ 1.54
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PTPRM-201ENST00000332175 CLRN2A0PK11 232 aa24.64■■□□□ 1.53
PTPRM-201ENST00000332175 SATB1Q01826 763 aa24.64■■□□□ 1.53
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PTPRM-201ENST00000332175 SPICE1Q8N0Z3 855 aa24.63■■□□□ 1.53
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PTPRM-201ENST00000332175 DESI2Q9BSY9 194 aa24.62■■□□□ 1.53
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PTPRM-201ENST00000332175 SHANK2Q9UPX8 1470 aa24.61■■□□□ 1.53
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PTPRM-201ENST00000332175 FAM178BQ8IXR5 827 aa24.6■■□□□ 1.53
PTPRM-201ENST00000332175 MAIP1Q8WWC4 291 aa24.6■■□□□ 1.53
PTPRM-201ENST00000332175 IWS1Q96ST2 819 aa24.6■■□□□ 1.53
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PTPRM-201ENST00000332175 USP28Q96RU2 1077 aa24.6■■□□□ 1.53
PTPRM-201ENST00000332175 ATP7AQ04656 1500 aa24.6■■□□□ 1.53
PTPRM-201ENST00000332175 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
PTPRM-201ENST00000332175 SULF1Q8IWU6 871 aa24.6■■□□□ 1.53
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PTPRM-201ENST00000332175 CSPG5O95196 566 aa24.6■■□□□ 1.53
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PTPRM-201ENST00000332175 GBP6Q6ZN66 633 aa24.58■■□□□ 1.53
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