RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321337.11

SENP3-201, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SENP3, Length 2,611 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-201ENST00000321337 SAR1BQ9Y6B6 198 aa28.43■■■□□ 2.14
SENP3-201ENST00000321337 TRIM14Q14142 442 aa28.42■■■□□ 2.14
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SENP3-201ENST00000321337 MED4Q9NPJ6 270 aa28.42■■■□□ 2.14
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SENP3-201ENST00000321337 BMP15O95972 392 aa28.42■■■□□ 2.14
SENP3-201ENST00000321337 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa28.42■■■□□ 2.14
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SENP3-201ENST00000321337 EHD4Q9H223 541 aa28.36■■■□□ 2.13
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SENP3-201ENST00000321337 USP17L21D6R901 530 aa28.34■■■□□ 2.13
SENP3-201ENST00000321337 TRHP20396 242 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
SENP3-201ENST00000321337 MAGEA9P43362 315 aa28.34■■■□□ 2.13
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SENP3-201ENST00000321337 TMEM60Q9H2L4 133 aa28.34■■■□□ 2.13
SENP3-201ENST00000321337 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
SENP3-201ENST00000321337 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
SENP3-201ENST00000321337 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
SENP3-201ENST00000321337 KRT26Q7Z3Y9 468 aa28.33■■■□□ 2.13
SENP3-201ENST00000321337 DISC1Q9NRI5 854 aa28.33■■■□□ 2.13
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