RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320238.3

NHLH2-201, Transcript of nescient helix-loop-helix 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NHLH2, Length 2,512 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2-201ENST00000320238 PMS1P54277 932 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
NHLH2-201ENST00000320238 TEX35Q5T0J7 233 aa21.73■■□□□ 1.07
NHLH2-201ENST00000320238 USP17L2Q6R6M4 530 aa21.73■■□□□ 1.07
NHLH2-201ENST00000320238 DTHD1Q6ZMT9 781 aa21.73■■□□□ 1.07
NHLH2-201ENST00000320238 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
NHLH2-201ENST00000320238 MFAP3LO75121 409 aa21.72■■□□□ 1.07
NHLH2-201ENST00000320238 TUBB4AP04350 444 aa21.72■■□□□ 1.07
NHLH2-201ENST00000320238 CCDC175P0C221 793 aa21.72■■□□□ 1.07
NHLH2-201ENST00000320238 NAALADL2Q58DX5 795 aa21.72■■□□□ 1.07
NHLH2-201ENST00000320238 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
NHLH2-201ENST00000320238 CNBD1Q8NA66 436 aa21.72■■□□□ 1.07
NHLH2-201ENST00000320238 WDR66Q8TBY9 1149 aa21.72■■□□□ 1.07
NHLH2-201ENST00000320238 KIFC2Q96AC6 838 aa21.72■■□□□ 1.07
NHLH2-201ENST00000320238 ADGRG1Q9Y653 693 aa21.72■■□□□ 1.07
NHLH2-201ENST00000320238 GPSM2P81274 684 aa21.72■■□□□ 1.07
NHLH2-201ENST00000320238 GRAPQ13588 217 aa21.72■■□□□ 1.07
NHLH2-201ENST00000320238 TRAPPC3LQ5T215 181 aa21.72■■□□□ 1.07
NHLH2-201ENST00000320238 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
NHLH2-201ENST00000320238 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
NHLH2-201ENST00000320238 LRRC15Q8TF66 581 aa21.72■■□□□ 1.07
NHLH2-201ENST00000320238 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
NHLH2-201ENST00000320238 BAG3O95817 575 aa21.71■■□□□ 1.07
NHLH2-201ENST00000320238 RASA1P20936 1047 aa21.71■■□□□ 1.07
NHLH2-201ENST00000320238 TXLNAP40222 546 aa21.71■■□□□ 1.07
NHLH2-201ENST00000320238 BTDP43251 543 aa21.71■■□□□ 1.07
NHLH2-201ENST00000320238 GRM4Q14833 912 aa21.71■■□□□ 1.07
NHLH2-201ENST00000320238 KRT222Q8N1A0 295 aa21.71■■□□□ 1.07
NHLH2-201ENST00000320238 PANX2Q96RD6 677 aa21.71■■□□□ 1.07
NHLH2-201ENST00000320238 CTAGE1Q96RT6 745 aa21.71■■□□□ 1.07
NHLH2-201ENST00000320238 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
NHLH2-201ENST00000320238 DISC1Q9NRI5 854 aa21.71■■□□□ 1.07
NHLH2-201ENST00000320238 KCNJ18B7U540 433 aa21.71■■□□□ 1.07
NHLH2-201ENST00000320238 KLRF2D3W0D1 207 aa21.71■■□□□ 1.07
NHLH2-201ENST00000320238 UFL1O94874 794 aa21.71■■□□□ 1.07
NHLH2-201ENST00000320238 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
NHLH2-201ENST00000320238 KCNJ12Q14500 433 aa21.71■■□□□ 1.07
NHLH2-201ENST00000320238 LETM2Q2VYF4 491 aa21.71■■□□□ 1.07
NHLH2-201ENST00000320238 AMOTL1Q8IY63 956 aa21.71■■□□□ 1.07
NHLH2-201ENST00000320238 LONP1P36776 959 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
NHLH2-201ENST00000320238 UBA7P41226 1012 aa21.7■■□□□ 1.06
NHLH2-201ENST00000320238 PPP2R3AQ06190 1150 aa21.7■■□□□ 1.06
NHLH2-201ENST00000320238 STXBP3O00186 592 aa21.7■■□□□ 1.06
NHLH2-201ENST00000320238 MAP3K9P80192 1104 aa21.7■■□□□ 1.06
NHLH2-201ENST00000320238 TCP11X2Q5H9J9 407 aa21.7■■□□□ 1.06
NHLH2-201ENST00000320238 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
NHLH2-201ENST00000320238 UBA5Q9GZZ9 404 aa21.7■■□□□ 1.06
NHLH2-201ENST00000320238 RWDD2AQ9UIY3 292 aa21.7■■□□□ 1.06
NHLH2-201ENST00000320238 COPB1P53618 953 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
NHLH2-201ENST00000320238 VPS72Q15906 364 aa21.69■■□□□ 1.06
NHLH2-201ENST00000320238 MRFAP1Q9Y605 127 aa21.69■■□□□ 1.06
NHLH2-201ENST00000320238 M0R2N6 131 aa21.69■■□□□ 1.06
NHLH2-201ENST00000320238 EIF6P56537 245 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
NHLH2-201ENST00000320238 ERVK-24P63145 666 aa21.69■■□□□ 1.06
NHLH2-201ENST00000320238 UBXN1Q04323 297 aa21.69■■□□□ 1.06
NHLH2-201ENST00000320238 ZNF804AQ7Z570 1209 aa21.69■■□□□ 1.06
NHLH2-201ENST00000320238 EYA3Q99504 573 aa21.69■■□□□ 1.06
NHLH2-201ENST00000320238 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
NHLH2-201ENST00000320238 BARHL2Q9NY43 387 aa21.69■■□□□ 1.06
NHLH2-201ENST00000320238 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
NHLH2-201ENST00000320238 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
NHLH2-201ENST00000320238 NAPAP54920 295 aa21.68■■□□□ 1.06
NHLH2-201ENST00000320238 ZNF569Q5MCW4 686 aa21.68■■□□□ 1.06
NHLH2-201ENST00000320238 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
NHLH2-201ENST00000320238 TEX11Q8IYF3 940 aa21.68■■□□□ 1.06
NHLH2-201ENST00000320238 FHOD1Q9Y613 1164 aa21.68■■□□□ 1.06
NHLH2-201ENST00000320238 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa21.68■■□□□ 1.06
NHLH2-201ENST00000320238 CDK8P49336 464 aa21.68■■□□□ 1.06
NHLH2-201ENST00000320238 CLEC10AQ8IUN9 316 aa21.68■■□□□ 1.06
NHLH2-201ENST00000320238 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
NHLH2-201ENST00000320238 EFCAB8A8MWE9 144 aa21.67■■□□□ 1.06
NHLH2-201ENST00000320238 CD209Q9NNX6 404 aa21.67■■□□□ 1.06
NHLH2-201ENST00000320238 LEMD3Q9Y2U8 911 aa21.67■■□□□ 1.06
NHLH2-201ENST00000320238 F8W031 263 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
NHLH2-201ENST00000320238 PRR5LQ6MZQ0 368 aa21.67■■□□□ 1.06
NHLH2-201ENST00000320238 IRF2BP1Q8IU81 584 aa21.67■■□□□ 1.06
NHLH2-201ENST00000320238 HPS3Q969F9 1004 aa21.67■■□□□ 1.06
NHLH2-201ENST00000320238 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
NHLH2-201ENST00000320238 TFR2Q9UP52 801 aa21.67■■□□□ 1.06
NHLH2-201ENST00000320238 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
NHLH2-201ENST00000320238 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
NHLH2-201ENST00000320238 TXNRD1Q16881 649 aa21.66■■□□□ 1.06
NHLH2-201ENST00000320238 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
NHLH2-201ENST00000320238 CEP95Q96GE4 821 aa21.66■■□□□ 1.06
NHLH2-201ENST00000320238 CHP1Q99653 195 aa21.66■■□□□ 1.06
NHLH2-201ENST00000320238 SLF1Q9BQI6 1058 aa21.66■■□□□ 1.06
NHLH2-201ENST00000320238 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
NHLH2-201ENST00000320238 LRRC4BQ9NT99 713 aa21.66■■□□□ 1.06
NHLH2-201ENST00000320238 ABHD10Q9NUJ1 306 aa21.66■■□□□ 1.06
NHLH2-201ENST00000320238 USP21Q9UK80 565 aa21.66■■□□□ 1.06
NHLH2-201ENST00000320238 CASZ1Q86V15 1759 aa21.66■■□□□ 1.06
NHLH2-201ENST00000320238 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
NHLH2-201ENST00000320238 SMCO2A6NFE2 343 aa21.66■■□□□ 1.06
NHLH2-201ENST00000320238 KRT9P35527 623 aa21.66■■□□□ 1.06
NHLH2-201ENST00000320238 GSTO1P78417 241 aa21.66■■□□□ 1.06
NHLH2-201ENST00000320238 PICALMQ13492 652 aa21.66■■□□□ 1.06
NHLH2-201ENST00000320238 MFSD14BQ5SR56 506 aa21.66■■□□□ 1.06
NHLH2-201ENST00000320238 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa21.66■■□□□ 1.06
NHLH2-201ENST00000320238 CNGA4Q8IV77 575 aa21.66■■□□□ 1.06
NHLH2-201ENST00000320238 SH3GLB2Q9NR46 395 aa21.66■■□□□ 1.06
NHLH2-201ENST00000320238 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.9 ms