RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 IQCB1Q15051 598 aa26■■□□□ 1.75
VSTM4-201ENST00000298454 FAM43AQ8N2R8 423 aa26■■□□□ 1.75
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
VSTM4-201ENST00000298454 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
VSTM4-201ENST00000298454 SEPT2Q15019 361 aa25.99■■□□□ 1.75
VSTM4-201ENST00000298454 TAOK3Q9H2K8 898 aa25.99■■□□□ 1.75
VSTM4-201ENST00000298454 SMCO2A6NFE2 343 aa25.99■■□□□ 1.75
VSTM4-201ENST00000298454 PNOCQ13519 176 aa25.99■■□□□ 1.75
VSTM4-201ENST00000298454 KCTD1Q719H9 257 aa25.99■■□□□ 1.75
VSTM4-201ENST00000298454 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
VSTM4-201ENST00000298454 KANSL2Q9H9L4 492 aa25.99■■□□□ 1.75
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC96Q2M329 555 aa25.98■■□□□ 1.75
VSTM4-201ENST00000298454 DPCR1Q3MIW9 517 aa25.98■■□□□ 1.75
VSTM4-201ENST00000298454 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa25.98■■□□□ 1.75
VSTM4-201ENST00000298454 SIAH1Q8IUQ4 282 aa25.98■■□□□ 1.75
VSTM4-201ENST00000298454 FERMT2Q96AC1 680 aa25.98■■□□□ 1.75
VSTM4-201ENST00000298454 EPSTI1Q96J88 318 aa25.98■■□□□ 1.75
VSTM4-201ENST00000298454 SLC16A2P36021 539 aa25.97■■□□□ 1.75
VSTM4-201ENST00000298454 JAG1P78504 1218 aa25.97■■□□□ 1.75
VSTM4-201ENST00000298454 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
VSTM4-201ENST00000298454 ABCB5Q2M3G0 1257 aa25.97■■□□□ 1.75
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM179Q6ZVK1 233 aa25.97■■□□□ 1.75
VSTM4-201ENST00000298454 ADGRF4Q8IZF3 695 aa25.97■■□□□ 1.75
VSTM4-201ENST00000298454 PDILTQ8N807 584 aa25.97■■□□□ 1.75
VSTM4-201ENST00000298454 AGBL3Q8NEM8 1001 aa25.97■■□□□ 1.75
VSTM4-201ENST00000298454 JMJD4Q9H9V9 463 aa25.97■■□□□ 1.75
VSTM4-201ENST00000298454 NYAP2Q9P242 653 aa25.97■■□□□ 1.75
VSTM4-201ENST00000298454 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
VSTM4-201ENST00000298454 VWA3AA6NCI4 1184 aa25.97■■□□□ 1.75
VSTM4-201ENST00000298454 ESPNB1AK53 854 aa25.97■■□□□ 1.75
VSTM4-201ENST00000298454 FOXN1O15353 648 aa25.97■■□□□ 1.75
VSTM4-201ENST00000298454 RAD21O60216 631 aa25.97■■□□□ 1.75
VSTM4-201ENST00000298454 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
VSTM4-201ENST00000298454 INF2Q27J81 1249 aa25.97■■□□□ 1.75
VSTM4-201ENST00000298454 MKL1Q969V6 931 aa25.97■■□□□ 1.75
VSTM4-201ENST00000298454 SERTAD1Q9UHV2 236 aa25.97■■□□□ 1.75
VSTM4-201ENST00000298454 MYH4Q9Y623 1939 aa25.96■■□□□ 1.75
VSTM4-201ENST00000298454 NFKBIEO00221 500 aa25.96■■□□□ 1.75
VSTM4-201ENST00000298454 SPDYE2Q495Y8 402 aa25.96■■□□□ 1.75
VSTM4-201ENST00000298454 ISM2Q6H9L7 571 aa25.96■■□□□ 1.75
VSTM4-201ENST00000298454 COA7Q96BR5 231 aa25.96■■□□□ 1.75
VSTM4-201ENST00000298454 C6orf50Q9HD87 102 aa25.96■■□□□ 1.75
VSTM4-201ENST00000298454 TUBE1Q9UJT0 475 aa25.96■■□□□ 1.75
VSTM4-201ENST00000298454 ICA1Q05084 483 aa25.96■■□□□ 1.75
VSTM4-201ENST00000298454 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
VSTM4-201ENST00000298454 CEP57L1Q8IYX8 460 aa25.96■■□□□ 1.75
VSTM4-201ENST00000298454 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
VSTM4-201ENST00000298454 GNA11P29992 359 aa25.95■■□□□ 1.74
VSTM4-201ENST00000298454 IL17AQ16552 155 aa25.95■■□□□ 1.74
VSTM4-201ENST00000298454 HS1BP3Q53T59 392 aa25.95■■□□□ 1.74
VSTM4-201ENST00000298454 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
VSTM4-201ENST00000298454 C4orf32Q8N8J7 132 aa25.95■■□□□ 1.74
VSTM4-201ENST00000298454 SGIP1Q9BQI5 828 aa25.95■■□□□ 1.74
VSTM4-201ENST00000298454 VEZTQ9HBM0 779 aa25.95■■□□□ 1.74
VSTM4-201ENST00000298454 CNTNAP1P78357 1384 aa25.95■■□□□ 1.74
VSTM4-201ENST00000298454 A0A087X0B3 334 aa25.95■■□□□ 1.74
VSTM4-201ENST00000298454 GH2P01242 217 aa25.95■■□□□ 1.74
VSTM4-201ENST00000298454 NLRP12P59046 1061 aa25.95■■□□□ 1.74
VSTM4-201ENST00000298454 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
VSTM4-201ENST00000298454 FAM151AQ8WW52 585 aa25.95■■□□□ 1.74
VSTM4-201ENST00000298454 JDP2Q8WYK2 163 aa25.95■■□□□ 1.74
VSTM4-201ENST00000298454 BCS1LQ9Y276 419 aa25.95■■□□□ 1.74
VSTM4-201ENST00000298454 CIAPIN1Q6FI81 312 aa25.94■■□□□ 1.74
VSTM4-201ENST00000298454 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP25.94■■□□□ 1.74
VSTM4-201ENST00000298454 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
VSTM4-201ENST00000298454 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa25.93■■□□□ 1.74
VSTM4-201ENST00000298454 PTMAP06454 111 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
VSTM4-201ENST00000298454 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
VSTM4-201ENST00000298454 SLFN13Q68D06 897 aa25.93■■□□□ 1.74
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC39Q9UFE4 941 aa25.93■■□□□ 1.74
VSTM4-201ENST00000298454 SHTN1A0MZ66 631 aa25.93■■□□□ 1.74
VSTM4-201ENST00000298454 USP17L10C9JJH3 530 aa25.93■■□□□ 1.74
VSTM4-201ENST00000298454 hCG_1984214I3L0E3 225 aa25.93■■□□□ 1.74
VSTM4-201ENST00000298454 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
VSTM4-201ENST00000298454 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
VSTM4-201ENST00000298454 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
VSTM4-201ENST00000298454 MTMR14Q8NCE2 650 aa25.93■■□□□ 1.74
VSTM4-201ENST00000298454 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
VSTM4-201ENST00000298454 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
VSTM4-201ENST00000298454 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa25.92■■□□□ 1.74
VSTM4-201ENST00000298454 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa25.92■■□□□ 1.74
VSTM4-201ENST00000298454 ESYT2A0FGR8 921 aa25.92■■□□□ 1.74
VSTM4-201ENST00000298454 SLC1A4P43007 532 aa25.92■■□□□ 1.74
VSTM4-201ENST00000298454 CDAN1Q8IWY9 1227 aa25.92■■□□□ 1.74
VSTM4-201ENST00000298454 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa25.92■■□□□ 1.74
VSTM4-201ENST00000298454 BECN2A8MW95 431 aa25.92■■□□□ 1.74
VSTM4-201ENST00000298454 KRT25Q7Z3Z0 450 aa25.92■■□□□ 1.74
VSTM4-201ENST00000298454 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa25.92■■□□□ 1.74
VSTM4-201ENST00000298454 AOPEPQ8N6M6 819 aa25.92■■□□□ 1.74
VSTM4-201ENST00000298454 DHX58Q96C10 678 aa25.92■■□□□ 1.74
VSTM4-201ENST00000298454 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
VSTM4-201ENST00000298454 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
VSTM4-201ENST00000298454 PRR29P0C7W0 189 aa25.91■■□□□ 1.74
VSTM4-201ENST00000298454 POSTNQ15063 836 aa25.91■■□□□ 1.74
VSTM4-201ENST00000298454 DCAF4Q8WV16 495 aa25.91■■□□□ 1.74
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM39BQ9GZU3 492 aa25.91■■□□□ 1.74
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM260Q9NX78 707 aa25.91■■□□□ 1.74
VSTM4-201ENST00000298454 CD2APQ9Y5K6 639 aa25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.3 ms