RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295872.8

SPICE1-201, Transcript of spindle and centriole associated protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPICE1, Length 5,417 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPICE1-201ENST00000295872 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SPICE1-201ENST00000295872 GRIN3BO60391 1043 aa14.72□□□□□ -0.05
SPICE1-201ENST00000295872 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SPICE1-201ENST00000295872 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SPICE1-201ENST00000295872 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SPICE1-201ENST00000295872 CEP83Q9Y592 693 aa14.72□□□□□ -0.05
SPICE1-201ENST00000295872 RFX7Q2KHR2 1363 aa14.72□□□□□ -0.05
SPICE1-201ENST00000295872 A0A0G2JLW4 131 aa14.71□□□□□ -0.05
SPICE1-201ENST00000295872 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SPICE1-201ENST00000295872 FAM47CQ5HY64 1035 aa14.71□□□□□ -0.05
SPICE1-201ENST00000295872 EPHA10Q5JZY3 1008 aa14.71□□□□□ -0.05
SPICE1-201ENST00000295872 CCDC155Q8N6L0 562 aa14.71□□□□□ -0.05
SPICE1-201ENST00000295872 GPT2Q8TD30 523 aa14.71□□□□□ -0.05
SPICE1-201ENST00000295872 IQSEC2Q5JU85 1478 aa14.71□□□□□ -0.05
SPICE1-201ENST00000295872 CRKP46108 304 aa14.71□□□□□ -0.05
SPICE1-201ENST00000295872 TRAPPC10P48553 1259 aa14.71□□□□□ -0.05
SPICE1-201ENST00000295872 STRN3Q13033 797 aa14.71□□□□□ -0.05
SPICE1-201ENST00000295872 LCORLQ8N3X6 602 aa14.71□□□□□ -0.05
SPICE1-201ENST00000295872 FSD2A1L4K1 749 aa14.71□□□□□ -0.05
SPICE1-201ENST00000295872 SLC15A2Q16348 729 aa14.71□□□□□ -0.05
SPICE1-201ENST00000295872 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
SPICE1-201ENST00000295872 KRBA2Q6ZNG9 492 aa14.71□□□□□ -0.05
SPICE1-201ENST00000295872 FAM107BQ9H098 131 aa14.71□□□□□ -0.05
SPICE1-201ENST00000295872 MYO3AQ8NEV4 1616 aa14.71□□□□□ -0.05
SPICE1-201ENST00000295872 GAS7O60861 476 aa14.71□□□□□ -0.05
SPICE1-201ENST00000295872 OR52Z1P0C646 297 aa14.71□□□□□ -0.05
SPICE1-201ENST00000295872 TAF12Q16514 161 aa14.71□□□□□ -0.05
SPICE1-201ENST00000295872 DYMQ7RTS9 669 aa14.71□□□□□ -0.05
SPICE1-201ENST00000295872 FNBP1Q96RU3 617 aa14.71□□□□□ -0.05
SPICE1-201ENST00000295872 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP14.71□□□□□ -0.05
SPICE1-201ENST00000295872 MST1RQ04912 1400 aa14.71□□□□□ -0.06
SPICE1-201ENST00000295872 PPP6R2O75170 966 aa14.71□□□□□ -0.06
SPICE1-201ENST00000295872 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
SPICE1-201ENST00000295872 TAB2Q9NYJ8 693 aa14.71□□□□□ -0.06
SPICE1-201ENST00000295872 IQCA1LA6NCM1 817 aa14.7□□□□□ -0.06
SPICE1-201ENST00000295872 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SPICE1-201ENST00000295872 WDR44Q5JSH3 913 aa14.7□□□□□ -0.06
SPICE1-201ENST00000295872 DEFB132Q7Z7B7 95 aa14.7□□□□□ -0.06
SPICE1-201ENST00000295872 CPDO75976 1380 aa14.7□□□□□ -0.06
SPICE1-201ENST00000295872 TNNC1P63316 161 aa14.7□□□□□ -0.06
SPICE1-201ENST00000295872 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SPICE1-201ENST00000295872 KIFAP3Q92845 792 aa14.7□□□□□ -0.06
SPICE1-201ENST00000295872 BLZF1Q9H2G9 400 aa14.7□□□□□ -0.06
SPICE1-201ENST00000295872 POLR3EQ9NVU0 708 aa14.7□□□□□ -0.06
SPICE1-201ENST00000295872 OPA1O60313 960 aa14.7□□□□□ -0.06
SPICE1-201ENST00000295872 LONP1P36776 959 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SPICE1-201ENST00000295872 SLC39A14Q15043 492 aa14.7□□□□□ -0.06
SPICE1-201ENST00000295872 INF2Q27J81 1249 aa14.7□□□□□ -0.06
SPICE1-201ENST00000295872 CPS1P31327 1500 aa14.7□□□□□ -0.06
SPICE1-201ENST00000295872 ASIC2Q16515 512 aa14.7□□□□□ -0.06
SPICE1-201ENST00000295872 ASPRV1Q53RT3 343 aa14.7□□□□□ -0.06
SPICE1-201ENST00000295872 ERO1AQ96HE7 468 aa14.7□□□□□ -0.06
SPICE1-201ENST00000295872 UIMC1Q96RL1 719 aa14.7□□□□□ -0.06
SPICE1-201ENST00000295872 AMNQ9BXJ7 453 aa14.7□□□□□ -0.06
SPICE1-201ENST00000295872 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa14.7□□□□□ -0.06
SPICE1-201ENST00000295872 GNA14O95837 355 aa14.69□□□□□ -0.06
SPICE1-201ENST00000295872 GPSM2P81274 684 aa14.69□□□□□ -0.06
SPICE1-201ENST00000295872 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SPICE1-201ENST00000295872 PRR5LQ6MZQ0 368 aa14.69□□□□□ -0.06
SPICE1-201ENST00000295872 CDAN1Q8IWY9 1227 aa14.69□□□□□ -0.06
SPICE1-201ENST00000295872 SLFN12Q8IYM2 578 aa14.69□□□□□ -0.06
SPICE1-201ENST00000295872 CAPZA3Q96KX2 299 aa14.69□□□□□ -0.06
SPICE1-201ENST00000295872 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SPICE1-201ENST00000295872 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SPICE1-201ENST00000295872 PRKAB2O43741 272 aa14.69□□□□□ -0.06
SPICE1-201ENST00000295872 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SPICE1-201ENST00000295872 CCDC51Q96ER9 411 aa14.69□□□□□ -0.06
SPICE1-201ENST00000295872 CRAMP1Q96RY5 1269 aa14.69□□□□□ -0.06
SPICE1-201ENST00000295872 KCNG1Q9UIX4 513 aa14.69□□□□□ -0.06
SPICE1-201ENST00000295872 CLIC4Q9Y696 253 aa14.69□□□□□ -0.06
SPICE1-201ENST00000295872 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa14.69□□□□□ -0.06
SPICE1-201ENST00000295872 DPH6Q7L8W6 267 aa14.69□□□□□ -0.06
SPICE1-201ENST00000295872 MIER3Q7Z3K6 550 aa14.69□□□□□ -0.06
SPICE1-201ENST00000295872 CCDC125Q86Z20 511 aa14.69□□□□□ -0.06
SPICE1-201ENST00000295872 LAD1O00515 517 aa14.68□□□□□ -0.06
SPICE1-201ENST00000295872 KRT9P35527 623 aa14.68□□□□□ -0.06
SPICE1-201ENST00000295872 LIFRP42702 1097 aa14.68□□□□□ -0.06
SPICE1-201ENST00000295872 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa14.68□□□□□ -0.06
SPICE1-201ENST00000295872 STAMQ92783 540 aa14.68□□□□□ -0.06
SPICE1-201ENST00000295872 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SPICE1-201ENST00000295872 MAGEF1Q9HAY2 307 aa14.68□□□□□ -0.06
SPICE1-201ENST00000295872 TNFAIP3P21580 790 aa14.68□□□□□ -0.06
SPICE1-201ENST00000295872 ITPK1Q13572 414 aa14.68□□□□□ -0.06
SPICE1-201ENST00000295872 MYCT1Q8N699 235 aa14.68□□□□□ -0.06
SPICE1-201ENST00000295872 RGS22Q8NE09 1264 aa14.68□□□□□ -0.06
SPICE1-201ENST00000295872 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP14.68□□□□□ -0.06
SPICE1-201ENST00000295872 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SPICE1-201ENST00000295872 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa14.68□□□□□ -0.06
SPICE1-201ENST00000295872 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa14.68□□□□□ -0.06
SPICE1-201ENST00000295872 hCG_1984214I3L0E3 225 aa14.68□□□□□ -0.06
SPICE1-201ENST00000295872 EEF2P13639 858 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SPICE1-201ENST00000295872 BIRC3Q13489 604 aa14.68□□□□□ -0.06
SPICE1-201ENST00000295872 MAEAQ7L5Y9 396 aa14.68□□□□□ -0.06
SPICE1-201ENST00000295872 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SPICE1-201ENST00000295872 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SPICE1-201ENST00000295872 TTC16Q8NEE8 873 aa14.68□□□□□ -0.06
SPICE1-201ENST00000295872 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa14.68□□□□□ -0.06
SPICE1-201ENST00000295872 SNAP23O00161 211 aa14.68□□□□□ -0.06
SPICE1-201ENST00000295872 CAMTA2O94983 1202 aa14.68□□□□□ -0.06
SPICE1-201ENST00000295872 BMP3P12645 472 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms