RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293973.1

NTN3-201, Transcript of netrin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NTN3, Length 1,986 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTN3-201ENST00000293973 LOC285556D6RIA3 1793 aa29.04■■■□□ 2.24
NTN3-201ENST00000293973 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
NTN3-201ENST00000293973 PLA2G6O60733 806 aa29.04■■■□□ 2.24
NTN3-201ENST00000293973 SYDE2Q5VT97 1194 aa29.04■■■□□ 2.24
NTN3-201ENST00000293973 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
NTN3-201ENST00000293973 HOMER1Q86YM7 354 aa29.04■■■□□ 2.24
NTN3-201ENST00000293973 CHURC1Q8WUH1 139 aa29.04■■■□□ 2.24
NTN3-201ENST00000293973 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
NTN3-201ENST00000293973 JMJD4Q9H9V9 463 aa29.04■■■□□ 2.24
NTN3-201ENST00000293973 FSTL1Q12841 308 aa29.03■■■□□ 2.24
NTN3-201ENST00000293973 PKP1Q13835 747 aa29.03■■■□□ 2.24
NTN3-201ENST00000293973 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
NTN3-201ENST00000293973 WNK4Q96J92 1243 aa29.03■■■□□ 2.24
NTN3-201ENST00000293973 PIGSQ96S52 555 aa29.03■■■□□ 2.24
NTN3-201ENST00000293973 TANGO6Q9C0B7 1094 aa29.03■■■□□ 2.24
NTN3-201ENST00000293973 CHMP5Q9NZZ3 219 aa29.03■■■□□ 2.24
NTN3-201ENST00000293973 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
NTN3-201ENST00000293973 SCG2P13521 617 aa29.02■■■□□ 2.24
NTN3-201ENST00000293973 FOSBP53539 338 aa29.02■■■□□ 2.24
NTN3-201ENST00000293973 FAM160B2Q86V87 743 aa29.02■■■□□ 2.24
NTN3-201ENST00000293973 C8orf76Q96K31 380 aa29.02■■■□□ 2.24
NTN3-201ENST00000293973 FBXO28Q9NVF7 368 aa29.02■■■□□ 2.24
NTN3-201ENST00000293973 STX6O43752 255 aa29.02■■■□□ 2.24
NTN3-201ENST00000293973 SAPCD2Q86UD0 394 aa29.02■■■□□ 2.24
NTN3-201ENST00000293973 PRR12Q9ULL5 1215 aa29.02■■■□□ 2.24
NTN3-201ENST00000293973 MTMR8Q96EF0 704 aa29.01■■■□□ 2.23
NTN3-201ENST00000293973 PARP14Q460N5 1801 aa29.01■■■□□ 2.23
NTN3-201ENST00000293973 NUCB2P80303 420 aa29■■■□□ 2.23
NTN3-201ENST00000293973 SNAPC2Q13487 334 aa29■■■□□ 2.23
NTN3-201ENST00000293973 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
NTN3-201ENST00000293973 KIFC2Q96AC6 838 aa29■■■□□ 2.23
NTN3-201ENST00000293973 GJB4Q9NTQ9 266 aa29■■■□□ 2.23
NTN3-201ENST00000293973 H3BQV1 296 aa28.99■■■□□ 2.23
NTN3-201ENST00000293973 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
NTN3-201ENST00000293973 IFFO2Q5TF58 517 aa28.99■■■□□ 2.23
NTN3-201ENST00000293973 GADL1Q6ZQY3 521 aa28.99■■■□□ 2.23
NTN3-201ENST00000293973 SLF1Q9BQI6 1058 aa28.99■■■□□ 2.23
NTN3-201ENST00000293973 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
NTN3-201ENST00000293973 ZBTB5O15062 677 aa28.99■■■□□ 2.23
NTN3-201ENST00000293973 FLOT1O75955 427 aa28.99■■■□□ 2.23
NTN3-201ENST00000293973 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa28.99■■■□□ 2.23
NTN3-201ENST00000293973 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa28.98■■■□□ 2.23
NTN3-201ENST00000293973 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
NTN3-201ENST00000293973 SPRYD7Q5W111 196 aa28.98■■■□□ 2.23
NTN3-201ENST00000293973 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
NTN3-201ENST00000293973 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
NTN3-201ENST00000293973 MTMR6Q9Y217 621 aa28.98■■■□□ 2.23
NTN3-201ENST00000293973 TLL2Q9Y6L7 1015 aa28.98■■■□□ 2.23
NTN3-201ENST00000293973 TMEM88BA6NKF7 163 aa28.97■■■□□ 2.23
NTN3-201ENST00000293973 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
NTN3-201ENST00000293973 GUCY1B3Q02153 619 aa28.97■■■□□ 2.23
NTN3-201ENST00000293973 RLFQ13129 1914 aa28.97■■■□□ 2.23
NTN3-201ENST00000293973 TRIM29Q14134 588 aa28.97■■■□□ 2.23
NTN3-201ENST00000293973 TREML2Q5T2D2 321 aa28.97■■■□□ 2.23
NTN3-201ENST00000293973 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa28.97■■■□□ 2.23
NTN3-201ENST00000293973 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa28.97■■■□□ 2.23
NTN3-201ENST00000293973 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP28.97■■■□□ 2.23
NTN3-201ENST00000293973 VPS54Q9P1Q0 977 aa28.97■■■□□ 2.23
NTN3-201ENST00000293973 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
NTN3-201ENST00000293973 USP17L15C9J2P7 530 aa28.97■■■□□ 2.23
NTN3-201ENST00000293973 USP17L13C9JLJ4 530 aa28.97■■■□□ 2.23
NTN3-201ENST00000293973 USP17L11C9JVI0 530 aa28.97■■■□□ 2.23
NTN3-201ENST00000293973 USP17L18D6R9N7 530 aa28.97■■■□□ 2.23
NTN3-201ENST00000293973 USP17L22D6RA61 530 aa28.97■■■□□ 2.23
NTN3-201ENST00000293973 USP17L17D6RBQ6 530 aa28.97■■■□□ 2.23
NTN3-201ENST00000293973 USP17L19D6RCP7 530 aa28.97■■■□□ 2.23
NTN3-201ENST00000293973 USP17L20D6RJB6 530 aa28.97■■■□□ 2.23
NTN3-201ENST00000293973 XBP1P17861 261 aa28.97■■■□□ 2.23
NTN3-201ENST00000293973 USP17L24Q0WX57 530 aa28.97■■■□□ 2.23
NTN3-201ENST00000293973 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
NTN3-201ENST00000293973 WWC2Q6AWC2 1192 aa28.97■■■□□ 2.23
NTN3-201ENST00000293973 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
NTN3-201ENST00000293973 BRD1O95696 1058 aa28.96■■■□□ 2.23
NTN3-201ENST00000293973 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
NTN3-201ENST00000293973 SNAP25P60880 206 aa28.96■■■□□ 2.23
NTN3-201ENST00000293973 QRICH1Q2TAL8 776 aa28.96■■■□□ 2.23
NTN3-201ENST00000293973 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa28.96■■■□□ 2.23
NTN3-201ENST00000293973 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa28.96■■■□□ 2.23
NTN3-201ENST00000293973 MOGSQ13724 837 aa28.95■■■□□ 2.23
NTN3-201ENST00000293973 KRT40Q6A162 431 aa28.95■■■□□ 2.23
NTN3-201ENST00000293973 RGS22Q8NE09 1264 aa28.95■■■□□ 2.23
NTN3-201ENST00000293973 SHISA4Q96DD7 197 aa28.95■■■□□ 2.23
NTN3-201ENST00000293973 BARHL2Q9NY43 387 aa28.95■■■□□ 2.23
NTN3-201ENST00000293973 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.23
NTN3-201ENST00000293973 ZDHHC9Q9Y397 364 aa28.95■■■□□ 2.23
NTN3-201ENST00000293973 GTF2A2P52657 109 aa28.95■■■□□ 2.22
NTN3-201ENST00000293973 RGMBQ6NW40 437 aa28.95■■■□□ 2.22
NTN3-201ENST00000293973 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.22
NTN3-201ENST00000293973 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa28.95■■■□□ 2.22
NTN3-201ENST00000293973 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
NTN3-201ENST00000293973 RASAL3Q86YV0 1011 aa28.94■■■□□ 2.22
NTN3-201ENST00000293973 MS4A4AQ96JQ5 239 aa28.94■■■□□ 2.22
NTN3-201ENST00000293973 SH3GLB2Q9NR46 395 aa28.94■■■□□ 2.22
NTN3-201ENST00000293973 hCG_1984214I3L0E3 225 aa28.93■■■□□ 2.22
NTN3-201ENST00000293973 STXBP3O00186 592 aa28.93■■■□□ 2.22
NTN3-201ENST00000293973 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
NTN3-201ENST00000293973 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
NTN3-201ENST00000293973 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
NTN3-201ENST00000293973 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
NTN3-201ENST00000293973 CETPP11597 493 aa28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.7 ms