RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264350.7

HERC5-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC5, Length 3,513 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC5-201ENST00000264350 SPATA1Q5VX52 437 aa15.31■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 SRLQ86TD4 932 aa15.31■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 CLEC10AQ8IUN9 316 aa15.31■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 IQUBQ8NA54 791 aa15.31■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa15.31■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 BAG3O95817 575 aa15.31■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 SERPINB2P05120 415 aa15.31■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 SLURP2P0DP57 97 aa15.31■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 SLF1Q9BQI6 1058 aa15.31■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 UBA5Q9GZZ9 404 aa15.31■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa15.31■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa15.31■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa15.3■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 ZMYND10O75800 440 aa15.3■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 STAT6P42226 847 aa15.3■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 SARSP49591 514 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 CUL4BQ13620 913 aa15.3■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa15.3■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 FCHSD1Q86WN1 690 aa15.3■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 GDAQ9Y2T3 454 aa15.3■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 GLI3P10071 1580 aa15.3■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 AFF2P51816 1311 aa15.3■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 PKN1Q16512 942 aa15.3■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 ZNF804AQ7Z570 1209 aa15.3■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 PNMA1Q8ND90 353 aa15.3■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 HDAC6Q9UBN7 1215 aa15.3■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa15.3■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 AKAP11Q9UKA4 1901 aa15.3■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 PP2D1A8MPX8 630 aa15.3■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 MARCH6O60337 910 aa15.3■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 ERVK-24P63145 666 aa15.3■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 UBXN1Q04323 297 aa15.3■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 LRRC4BQ9NT99 713 aa15.3■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 GUCA1BQ9UMX6 200 aa15.3■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 L1RE1Q9UN81 338 aa15.3■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 TAF1P21675 1872 aa15.3■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa15.29■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 CCDC151A5D8V7 595 aa15.29■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa15.29■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 TUBB4AP04350 444 aa15.29■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 BTDP43251 543 aa15.29■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 FAM193AP78312 1265 aa15.29■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 VPS72Q15906 364 aa15.29■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 LAMB4A4D0S4 1761 aa15.29■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 ENC1O14682 589 aa15.29■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 GYPCP04921 128 aa15.29■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 GPSM2P81274 684 aa15.29■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 SEC23AQ15436 765 aa15.29■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 FBXO33Q7Z6M2 555 aa15.29■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 KRT9P35527 623 aa15.29■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 ACTN2P35609 894 aa15.29■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 UBA7P41226 1012 aa15.29■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 TCP10Q12799 353 aa15.29■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 NELFBQ8WX92 580 aa15.29■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 RASSF4Q9H2L5 321 aa15.29■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 GGA1Q9UJY5 639 aa15.29■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 A0A1B0GTH6 734 aa15.28■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 TRIM49BA6NDI0 452 aa15.28■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 ATP8B1O43520 1251 aa15.28■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 SRGAP2O75044 1071 aa15.28■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 TRIML1Q8N9V2 468 aa15.28■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 RABEP2Q9H5N1 569 aa15.28■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 ADAMTS3O15072 1205 aa15.28■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 SCG2P13521 617 aa15.28■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 USP17L2Q6R6M4 530 aa15.28■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 EXOC4Q96A65 974 aa15.28■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 PHF20Q9BVI0 1012 aa15.28■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 MYH7P12883 1935 aa15.28■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 CACNB3P54284 484 aa15.27■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 PACS2Q86VP3 889 aa15.27■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 FERMT2Q96AC1 680 aa15.27■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 TRIM47Q96LD4 638 aa15.27■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 NOP2P46087 812 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 TROAPQ12815 778 aa15.27■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 INF2Q27J81 1249 aa15.27■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 PRR5LQ6MZQ0 368 aa15.27■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 TMTC3Q6ZXV5 915 aa15.27■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 GOLGA5Q8TBA6 731 aa15.27■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 GPCPD1Q9NPB8 672 aa15.27■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 CDC23Q9UJX2 597 aa15.27■□□□□ 0.04
HERC5-201ENST00000264350 FAM196BA6NMK8 535 aa15.27■□□□□ 0.03
HERC5-201ENST00000264350 HSPA1LP34931 641 aa15.27■□□□□ 0.03
HERC5-201ENST00000264350 PAK1Q13153 545 aa15.27■□□□□ 0.03
HERC5-201ENST00000264350 CASP8Q14790 479 aa15.27■□□□□ 0.03
HERC5-201ENST00000264350 KRT31Q15323 416 aa15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.1 ms