RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258341.4

LAMC1-201, Transcript of laminin subunit gamma 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LAMC1, Length 7,889 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1-201ENST00000258341 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP18.04■□□□□ 0.48
LAMC1-201ENST00000258341 GRK7Q8WTQ7 553 aa18.04■□□□□ 0.48
LAMC1-201ENST00000258341 CSRNP1Q96S65 589 aa18.04■□□□□ 0.48
LAMC1-201ENST00000258341 APOL6Q9BWW8 343 aa18.04■□□□□ 0.48
LAMC1-201ENST00000258341 VPS54Q9P1Q0 977 aa18.04■□□□□ 0.48
LAMC1-201ENST00000258341 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa18.04■□□□□ 0.48
LAMC1-201ENST00000258341 PDE6CP51160 858 aa18.04■□□□□ 0.48
LAMC1-201ENST00000258341 IQCB1Q15051 598 aa18.04■□□□□ 0.48
LAMC1-201ENST00000258341 LMCD1Q9NZU5 365 aa18.04■□□□□ 0.48
LAMC1-201ENST00000258341 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa18.04■□□□□ 0.48
LAMC1-201ENST00000258341 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa18.04■□□□□ 0.48
LAMC1-201ENST00000258341 SUGCTQ9HAC7 445 aa18.04■□□□□ 0.48
LAMC1-201ENST00000258341 IMPACTQ9P2X3 320 aa18.04■□□□□ 0.48
LAMC1-201ENST00000258341 ERO1AQ96HE7 468 aa18.04■□□□□ 0.48
LAMC1-201ENST00000258341 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
LAMC1-201ENST00000258341 SESN3P58005 492 aa18.03■□□□□ 0.48
LAMC1-201ENST00000258341 MTX1Q13505 466 aa18.03■□□□□ 0.48
LAMC1-201ENST00000258341 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
LAMC1-201ENST00000258341 TMTC1Q8IUR5 882 aa18.03■□□□□ 0.48
LAMC1-201ENST00000258341 RNF217Q8TC41 542 aa18.03■□□□□ 0.48
LAMC1-201ENST00000258341 C1orf112Q9NSG2 853 aa18.03■□□□□ 0.48
LAMC1-201ENST00000258341 GARSP41250 739 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
LAMC1-201ENST00000258341 NLRP12P59046 1061 aa18.03■□□□□ 0.48
LAMC1-201ENST00000258341 ANKRD35Q8N283 1001 aa18.03■□□□□ 0.48
LAMC1-201ENST00000258341 MLKLQ8NB16 471 aa18.03■□□□□ 0.48
LAMC1-201ENST00000258341 MYL10Q9BUA6 226 aa18.03■□□□□ 0.48
LAMC1-201ENST00000258341 NT5C3AQ9H0P0 336 aa18.03■□□□□ 0.48
LAMC1-201ENST00000258341 PCDHA12Q9UN75 941 aa18.03■□□□□ 0.48
LAMC1-201ENST00000258341 FLT4P35916 1363 aa18.03■□□□□ 0.48
LAMC1-201ENST00000258341 RNF40O75150 1001 aa18.03■□□□□ 0.48
LAMC1-201ENST00000258341 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
LAMC1-201ENST00000258341 GPBP1Q86WP2 473 aa18.03■□□□□ 0.48
LAMC1-201ENST00000258341 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
LAMC1-201ENST00000258341 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
LAMC1-201ENST00000258341 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
LAMC1-201ENST00000258341 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa18.03■□□□□ 0.48
LAMC1-201ENST00000258341 K7ENM7 598 aa18.03■□□□□ 0.48
LAMC1-201ENST00000258341 KCNK3O14649 394 aa18.03■□□□□ 0.48
LAMC1-201ENST00000258341 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
LAMC1-201ENST00000258341 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP18.03■□□□□ 0.482e-6■■□□□ 14.5
LAMC1-201ENST00000258341 PTPROQ16827 1216 aa18.03■□□□□ 0.48
LAMC1-201ENST00000258341 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
LAMC1-201ENST00000258341 TNNI3KQ59H18 835 aa18.03■□□□□ 0.48
LAMC1-201ENST00000258341 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
LAMC1-201ENST00000258341 PANK4Q9NVE7 773 aa18.03■□□□□ 0.48
LAMC1-201ENST00000258341 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa18.03■□□□□ 0.48
LAMC1-201ENST00000258341 TLR3O15455 904 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
LAMC1-201ENST00000258341 TECP42680 631 aa18.03■□□□□ 0.48
LAMC1-201ENST00000258341 CHURC1Q8WUH1 139 aa18.03■□□□□ 0.48
LAMC1-201ENST00000258341 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
LAMC1-201ENST00000258341 SH3TC1Q8TE82 1336 aa18.03■□□□□ 0.48
LAMC1-201ENST00000258341 EPS15L1Q9UBC2 864 aa18.02■□□□□ 0.48
LAMC1-201ENST00000258341 LRRIQ4A6NIV6 560 aa18.02■□□□□ 0.48
LAMC1-201ENST00000258341 KRIT1O00522 736 aa18.02■□□□□ 0.48
LAMC1-201ENST00000258341 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
LAMC1-201ENST00000258341 HESX1Q9UBX0 185 aa18.02■□□□□ 0.48
LAMC1-201ENST00000258341 PLBD2Q8NHP8 589 aa18.02■□□□□ 0.48
LAMC1-201ENST00000258341 Q9H521 79 aa18.02■□□□□ 0.48
LAMC1-201ENST00000258341 SLF1Q9BQI6 1058 aa18.02■□□□□ 0.48
LAMC1-201ENST00000258341 AKT3Q9Y243 479 aa18.02■□□□□ 0.48
LAMC1-201ENST00000258341 DUOX2Q9NRD8 1548 aa18.02■□□□□ 0.47
LAMC1-201ENST00000258341 SMCO2A6NFE2 343 aa18.02■□□□□ 0.47
LAMC1-201ENST00000258341 TNFAIP1Q13829 316 aa18.02■□□□□ 0.47
LAMC1-201ENST00000258341 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.47
LAMC1-201ENST00000258341 STAMQ92783 540 aa18.02■□□□□ 0.47
LAMC1-201ENST00000258341 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa18.02■□□□□ 0.47
LAMC1-201ENST00000258341 PRXQ9BXM0 1461 aa18.01■□□□□ 0.47
LAMC1-201ENST00000258341 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa18.01■□□□□ 0.47
LAMC1-201ENST00000258341 SPATA5Q8NB90 893 aa18.01■□□□□ 0.47
LAMC1-201ENST00000258341 USP40Q9NVE5 1235 aa18.01■□□□□ 0.47
LAMC1-201ENST00000258341 TRPM2O94759 1503 aa18.01■□□□□ 0.47
LAMC1-201ENST00000258341 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa18.01■□□□□ 0.47
LAMC1-201ENST00000258341 XKR9Q5GH70 373 aa18.01■□□□□ 0.47
LAMC1-201ENST00000258341 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
LAMC1-201ENST00000258341 KDRP35968 1356 aa18.01■□□□□ 0.47
LAMC1-201ENST00000258341 ALAS1P13196 640 aa18.01■□□□□ 0.47
LAMC1-201ENST00000258341 FBXW4P57775 412 aa18.01■□□□□ 0.47
LAMC1-201ENST00000258341 FAM47AQ5JRC9 791 aa18.01■□□□□ 0.47
LAMC1-201ENST00000258341 SPATA17Q96L03 361 aa18.01■□□□□ 0.47
LAMC1-201ENST00000258341 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
LAMC1-201ENST00000258341 PTPN22Q9Y2R2 807 aa18.01■□□□□ 0.47
LAMC1-201ENST00000258341 RAD50Q92878 1312 aa18.01■□□□□ 0.47
LAMC1-201ENST00000258341 ZNF532Q9HCE3 1301 aa18.01■□□□□ 0.47
LAMC1-201ENST00000258341 SGK1O00141 431 aa18.01■□□□□ 0.47
LAMC1-201ENST00000258341 NVLO15381 856 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
LAMC1-201ENST00000258341 APBA3O96018 575 aa18.01■□□□□ 0.47
LAMC1-201ENST00000258341 KCNJ14Q9UNX9 436 aa18.01■□□□□ 0.47
LAMC1-201ENST00000258341 ARHGAP6O43182 974 aa18.01■□□□□ 0.47
LAMC1-201ENST00000258341 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
LAMC1-201ENST00000258341 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP18.01■□□□□ 0.47
LAMC1-201ENST00000258341 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
LAMC1-201ENST00000258341 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
LAMC1-201ENST00000258341 GNGT2O14610 69 aa18■□□□□ 0.47
LAMC1-201ENST00000258341 PTPREP23469 700 aa18■□□□□ 0.47
LAMC1-201ENST00000258341 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
LAMC1-201ENST00000258341 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
LAMC1-201ENST00000258341 SLFN12Q8IYM2 578 aa18■□□□□ 0.47
LAMC1-201ENST00000258341 TTC1Q99614 292 aa18■□□□□ 0.47
LAMC1-201ENST00000258341 MROH5Q6ZUA9 1318 aa18■□□□□ 0.47
LAMC1-201ENST00000258341 RIMS2Q9UQ26 1411 aa18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms