RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 TLR3O15455 904 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
SPCS1-201ENST00000233025 SLC25A27O95847 323 aa20.09■□□□□ 0.81
SPCS1-201ENST00000233025 ASGR1P07306 291 aa20.09■□□□□ 0.81
SPCS1-201ENST00000233025 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa20.09■□□□□ 0.81
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM132BQ14DG7 1078 aa20.09■□□□□ 0.81
SPCS1-201ENST00000233025 VWCEQ96DN2 955 aa20.09■□□□□ 0.81
SPCS1-201ENST00000233025 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa20.09■□□□□ 0.81
SPCS1-201ENST00000233025 ADCY6O43306 1168 aa20.08■□□□□ 0.81
SPCS1-201ENST00000233025 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
SPCS1-201ENST00000233025 FLOT1O75955 427 aa20.08■□□□□ 0.81
SPCS1-201ENST00000233025 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
SPCS1-201ENST00000233025 SNRKQ9NRH2 765 aa20.08■□□□□ 0.81
SPCS1-201ENST00000233025 FAM184BQ9ULE4 1060 aa20.08■□□□□ 0.81
SPCS1-201ENST00000233025 CA3P07451 260 aa20.07■□□□□ 0.8
SPCS1-201ENST00000233025 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
SPCS1-201ENST00000233025 HIPK3Q9H422 1215 aa20.07■□□□□ 0.8
SPCS1-201ENST00000233025 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
SPCS1-201ENST00000233025 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
SPCS1-201ENST00000233025 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
SPCS1-201ENST00000233025 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
SPCS1-201ENST00000233025 KCTD2Q14681 263 aa20.06■□□□□ 0.8
SPCS1-201ENST00000233025 RIOX2Q8IUF8 465 aa20.06■□□□□ 0.8
SPCS1-201ENST00000233025 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
SPCS1-201ENST00000233025 WNT8AQ9H1J5 351 aa20.06■□□□□ 0.8
SPCS1-201ENST00000233025 CERS4Q9HA82 394 aa20.06■□□□□ 0.8
SPCS1-201ENST00000233025 TTC6Q86TZ1 520 aa20.05■□□□□ 0.8
SPCS1-201ENST00000233025 FAM9BQ8IZU0 186 aa20.05■□□□□ 0.8
SPCS1-201ENST00000233025 VTI1AQ96AJ9 217 aa20.05■□□□□ 0.8
SPCS1-201ENST00000233025 FBXL18Q96ME1 805 aa20.05■□□□□ 0.8
SPCS1-201ENST00000233025 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa20.05■□□□□ 0.8
SPCS1-201ENST00000233025 TANC1Q9C0D5 1861 aa20.05■□□□□ 0.8
SPCS1-201ENST00000233025 TET1Q8NFU7 2136 aa20.05■□□□□ 0.8
SPCS1-201ENST00000233025 CTAGE5O15320 804 aa20.04■□□□□ 0.8
SPCS1-201ENST00000233025 IGSF3O75054 1194 aa20.04■□□□□ 0.8
SPCS1-201ENST00000233025 USP5P45974 858 aa20.04■□□□□ 0.8
SPCS1-201ENST00000233025 PLCD1P51178 756 aa20.04■□□□□ 0.8
SPCS1-201ENST00000233025 GJA9P57773 515 aa20.04■□□□□ 0.8
SPCS1-201ENST00000233025 GABPAQ06546 454 aa20.04■□□□□ 0.8
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM67Q5HYA8 995 aa20.04■□□□□ 0.8
SPCS1-201ENST00000233025 SLC43A3Q8NBI5 491 aa20.04■□□□□ 0.8
SPCS1-201ENST00000233025 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
SPCS1-201ENST00000233025 KCNH6Q9H252 994 aa20.04■□□□□ 0.8
SPCS1-201ENST00000233025 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
SPCS1-201ENST00000233025 SRGAP3O43295 1099 aa20.03■□□□□ 0.8
SPCS1-201ENST00000233025 ARHGEF15O94989 841 aa20.03■□□□□ 0.8
SPCS1-201ENST00000233025 CCL23P55773 120 aa20.03■□□□□ 0.8
SPCS1-201ENST00000233025 MTX1Q13505 466 aa20.03■□□□□ 0.8
SPCS1-201ENST00000233025 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa20.03■□□□□ 0.8
SPCS1-201ENST00000233025 MEIS3Q99687 375 aa20.03■□□□□ 0.8
SPCS1-201ENST00000233025 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
SPCS1-201ENST00000233025 HDAC5Q9UQL6 1122 aa20.03■□□□□ 0.8
SPCS1-201ENST00000233025 ZBBXA8MT70 800 aa20.02■□□□□ 0.8
SPCS1-201ENST00000233025 LPXNO60711 386 aa20.02■□□□□ 0.8
SPCS1-201ENST00000233025 CYP7A1P22680 504 aa20.02■□□□□ 0.8
SPCS1-201ENST00000233025 SPICE1Q8N0Z3 855 aa20.02■□□□□ 0.8
SPCS1-201ENST00000233025 MIGA1Q8NAN2 632 aa20.02■□□□□ 0.8
SPCS1-201ENST00000233025 UIMC1Q96RL1 719 aa20.02■□□□□ 0.8
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
SPCS1-201ENST00000233025 NKX3-2P78367 333 aa20.01■□□□□ 0.79
SPCS1-201ENST00000233025 GNASQ5JWF2 1037 aa20.01■□□□□ 0.79
SPCS1-201ENST00000233025 CERS3Q8IU89 383 aa20.01■□□□□ 0.79
SPCS1-201ENST00000233025 FAM178BQ8IXR5 827 aa20.01■□□□□ 0.79
SPCS1-201ENST00000233025 GJD3Q8N144 294 aa20.01■□□□□ 0.79
SPCS1-201ENST00000233025 SPC25Q9HBM1 224 aa20.01■□□□□ 0.79
SPCS1-201ENST00000233025 CACNA1HO95180 2353 aa20.01■□□□□ 0.79
SPCS1-201ENST00000233025 SIP14410 1827 aa20■□□□□ 0.79
SPCS1-201ENST00000233025 WDR46O15213 610 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
SPCS1-201ENST00000233025 STAT3P40763 770 aa20■□□□□ 0.79
SPCS1-201ENST00000233025 TAP1Q03518 808 aa20■□□□□ 0.79
SPCS1-201ENST00000233025 EVX2Q03828 476 aa20■□□□□ 0.79
SPCS1-201ENST00000233025 GRB10Q13322 594 aa20■□□□□ 0.79
SPCS1-201ENST00000233025 TTLL4Q14679 1199 aa20■□□□□ 0.79
SPCS1-201ENST00000233025 CLEC10AQ8IUN9 316 aa20■□□□□ 0.79
SPCS1-201ENST00000233025 SIAH1Q8IUQ4 282 aa20■□□□□ 0.79
SPCS1-201ENST00000233025 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
SPCS1-201ENST00000233025 REPS2Q8NFH8 660 aa20■□□□□ 0.79
SPCS1-201ENST00000233025 ARNTL2Q8WYA1 636 aa20■□□□□ 0.79
SPCS1-201ENST00000233025 VCPKMTQ9H867 229 aa20■□□□□ 0.79
SPCS1-201ENST00000233025 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa19.99■□□□□ 0.79
SPCS1-201ENST00000233025 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
SPCS1-201ENST00000233025 COPB2P35606 906 aa19.99■□□□□ 0.79
SPCS1-201ENST00000233025 ACVR2BQ13705 512 aa19.99■□□□□ 0.79
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC144BQ3MJ40 725 aa19.99■□□□□ 0.79
SPCS1-201ENST00000233025 TTC39AQ5SRH9 613 aa19.99■□□□□ 0.79
SPCS1-201ENST00000233025 FBXO28Q9NVF7 368 aa19.99■□□□□ 0.79
SPCS1-201ENST00000233025 TMX2Q9Y320 296 aa19.99■□□□□ 0.79
SPCS1-201ENST00000233025 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
SPCS1-201ENST00000233025 VWA5AO00534 786 aa19.98■□□□□ 0.79
SPCS1-201ENST00000233025 ALADP13716 330 aa19.98■□□□□ 0.79
SPCS1-201ENST00000233025 ZAP70P43403 619 aa19.98■□□□□ 0.79
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM179Q6ZVK1 233 aa19.98■□□□□ 0.79
SPCS1-201ENST00000233025 SCLYQ96I15 445 aa19.98■□□□□ 0.79
SPCS1-201ENST00000233025 AGBL1Q96MI9 1066 aa19.98■□□□□ 0.79
SPCS1-201ENST00000233025 GRIN2DO15399 1336 aa19.98■□□□□ 0.79
SPCS1-201ENST00000233025 B4GALT4O60513 344 aa19.97■□□□□ 0.79
SPCS1-201ENST00000233025 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa19.97■□□□□ 0.79
SPCS1-201ENST00000233025 SPRED2Q7Z698 418 aa19.97■□□□□ 0.79
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
SPCS1-201ENST00000233025 FGD4Q96M96 766 aa19.97■□□□□ 0.79
SPCS1-201ENST00000233025 DBNDD2Q9BQY9 259 aa19.97■□□□□ 0.79
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