RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000222305.7

USF2-201, Transcript of upstream transcription factor 2, c-fos interacting, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USF2, Length 1,634 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2-201ENST00000222305 FSTL1Q12841 308 aa26.61■■□□□ 1.85
USF2-201ENST00000222305 SH3D19Q5HYK7 790 aa26.61■■□□□ 1.85
USF2-201ENST00000222305 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
USF2-201ENST00000222305 FBXO28Q9NVF7 368 aa26.61■■□□□ 1.85
USF2-201ENST00000222305 CHMP5Q9NZZ3 219 aa26.61■■□□□ 1.85
USF2-201ENST00000222305 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
USF2-201ENST00000222305 STX6O43752 255 aa26.6■■□□□ 1.85
USF2-201ENST00000222305 PDCP20941 246 aa26.6■■□□□ 1.85
USF2-201ENST00000222305 GUCY1B3Q02153 619 aa26.6■■□□□ 1.85
USF2-201ENST00000222305 SYDE2Q5VT97 1194 aa26.6■■□□□ 1.85
USF2-201ENST00000222305 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
USF2-201ENST00000222305 BTNL9Q6UXG8 535 aa26.6■■□□□ 1.85
USF2-201ENST00000222305 WASF1Q92558 559 aa26.6■■□□□ 1.85
USF2-201ENST00000222305 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
USF2-201ENST00000222305 TANGO6Q9C0B7 1094 aa26.6■■□□□ 1.85
USF2-201ENST00000222305 KCNH4Q9UQ05 1017 aa26.6■■□□□ 1.85
USF2-201ENST00000222305 SMCHD1A6NHR9 2005 aa26.59■■□□□ 1.85
USF2-201ENST00000222305 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
USF2-201ENST00000222305 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
USF2-201ENST00000222305 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa26.59■■□□□ 1.85
USF2-201ENST00000222305 WNK4Q96J92 1243 aa26.59■■□□□ 1.85
USF2-201ENST00000222305 C8orf76Q96K31 380 aa26.59■■□□□ 1.85
USF2-201ENST00000222305 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
USF2-201ENST00000222305 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
USF2-201ENST00000222305 SCG2P13521 617 aa26.58■■□□□ 1.85
USF2-201ENST00000222305 SNAP25P60880 206 aa26.58■■□□□ 1.85
USF2-201ENST00000222305 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
USF2-201ENST00000222305 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
USF2-201ENST00000222305 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
USF2-201ENST00000222305 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP26.58■■□□□ 1.85
USF2-201ENST00000222305 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
USF2-201ENST00000222305 FEM1BQ9UK73 627 aa26.58■■□□□ 1.85
USF2-201ENST00000222305 PRR12Q9ULL5 1215 aa26.58■■□□□ 1.85
USF2-201ENST00000222305 CXCL11O14625 94 aa26.57■■□□□ 1.84
USF2-201ENST00000222305 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
USF2-201ENST00000222305 GADL1Q6ZQY3 521 aa26.57■■□□□ 1.84
USF2-201ENST00000222305 CHURC1Q8WUH1 139 aa26.57■■□□□ 1.84
USF2-201ENST00000222305 KIFC2Q96AC6 838 aa26.57■■□□□ 1.84
USF2-201ENST00000222305 MTMR6Q9Y217 621 aa26.57■■□□□ 1.84
USF2-201ENST00000222305 ZDHHC9Q9Y397 364 aa26.57■■□□□ 1.84
USF2-201ENST00000222305 H3BQV1 296 aa26.57■■□□□ 1.84
USF2-201ENST00000222305 IFFO2Q5TF58 517 aa26.57■■□□□ 1.84
USF2-201ENST00000222305 FAM160B2Q86V87 743 aa26.57■■□□□ 1.84
USF2-201ENST00000222305 SHISA4Q96DD7 197 aa26.57■■□□□ 1.84
USF2-201ENST00000222305 MTMR8Q96EF0 704 aa26.57■■□□□ 1.84
USF2-201ENST00000222305 VPS54Q9P1Q0 977 aa26.57■■□□□ 1.84
USF2-201ENST00000222305 MYH15Q9Y2K3 1946 aa26.56■■□□□ 1.84
USF2-201ENST00000222305 PLA2G6O60733 806 aa26.56■■□□□ 1.84
USF2-201ENST00000222305 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
USF2-201ENST00000222305 TREML2Q5T2D2 321 aa26.56■■□□□ 1.84
USF2-201ENST00000222305 SAPCD2Q86UD0 394 aa26.56■■□□□ 1.84
USF2-201ENST00000222305 FLOT1O75955 427 aa26.55■■□□□ 1.84
USF2-201ENST00000222305 NUCB2P80303 420 aa26.55■■□□□ 1.84
USF2-201ENST00000222305 WWC2Q6AWC2 1192 aa26.55■■□□□ 1.84
USF2-201ENST00000222305 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa26.55■■□□□ 1.84
USF2-201ENST00000222305 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa26.55■■□□□ 1.84
USF2-201ENST00000222305 TMEM88BA6NKF7 163 aa26.54■■□□□ 1.84
USF2-201ENST00000222305 ZBTB5O15062 677 aa26.54■■□□□ 1.84
USF2-201ENST00000222305 BRD1O95696 1058 aa26.54■■□□□ 1.84
USF2-201ENST00000222305 QRICH1Q2TAL8 776 aa26.54■■□□□ 1.84
USF2-201ENST00000222305 KRT40Q6A162 431 aa26.54■■□□□ 1.84
USF2-201ENST00000222305 SLF1Q9BQI6 1058 aa26.54■■□□□ 1.84
USF2-201ENST00000222305 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
USF2-201ENST00000222305 KCNJ14Q9UNX9 436 aa26.54■■□□□ 1.84
USF2-201ENST00000222305 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
USF2-201ENST00000222305 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa26.54■■□□□ 1.84
USF2-201ENST00000222305 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
USF2-201ENST00000222305 TRIM29Q14134 588 aa26.54■■□□□ 1.84
USF2-201ENST00000222305 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
USF2-201ENST00000222305 SNAPC2Q13487 334 aa26.53■■□□□ 1.84
USF2-201ENST00000222305 MOGSQ13724 837 aa26.53■■□□□ 1.84
USF2-201ENST00000222305 SPRYD7Q5W111 196 aa26.53■■□□□ 1.84
USF2-201ENST00000222305 TYW1BQ6NUM6 668 aa26.53■■□□□ 1.84
USF2-201ENST00000222305 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
USF2-201ENST00000222305 TLL2Q9Y6L7 1015 aa26.53■■□□□ 1.84
USF2-201ENST00000222305 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
USF2-201ENST00000222305 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
USF2-201ENST00000222305 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa26.52■■□□□ 1.84
USF2-201ENST00000222305 COA7Q96BR5 231 aa26.52■■□□□ 1.84
USF2-201ENST00000222305 BARHL2Q9NY43 387 aa26.52■■□□□ 1.84
USF2-201ENST00000222305 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa26.52■■□□□ 1.84
USF2-201ENST00000222305 TCHHQ07283 1943 aa26.52■■□□□ 1.84
USF2-201ENST00000222305 USP17L15C9J2P7 530 aa26.51■■□□□ 1.83
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USF2-201ENST00000222305 USP17L18D6R9N7 530 aa26.51■■□□□ 1.83
USF2-201ENST00000222305 USP17L22D6RA61 530 aa26.51■■□□□ 1.83
USF2-201ENST00000222305 USP17L17D6RBQ6 530 aa26.51■■□□□ 1.83
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USF2-201ENST00000222305 XBP1P17861 261 aa26.51■■□□□ 1.83
USF2-201ENST00000222305 USP17L24Q0WX57 530 aa26.51■■□□□ 1.83
USF2-201ENST00000222305 FERMT3Q86UX7 667 aa26.51■■□□□ 1.83
USF2-201ENST00000222305 RASAL3Q86YV0 1011 aa26.51■■□□□ 1.83
USF2-201ENST00000222305 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
USF2-201ENST00000222305 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
USF2-201ENST00000222305 CCDC174Q6PII3 467 aa26.5■■□□□ 1.83
USF2-201ENST00000222305 A0A0G2JMZ2 1700 aa26.5■■□□□ 1.83
USF2-201ENST00000222305 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
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